151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0351 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0351  hypothetical protein  100 
 
 
141 aa  295  2e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000546433  hitchhiker  0.00000644081 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4265  hypothetical protein  38.52 
 
 
146 aa  95.5  2e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.16799  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5254  hypothetical protein  36.07 
 
 
133 aa  92.4  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3214  hypothetical protein  39.02 
 
 
145 aa  84.3  5e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.907218  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3276  hypothetical protein  39.02 
 
 
145 aa  84.3  5e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3225  hypothetical protein  39.02 
 
 
145 aa  84.3  5e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.730825  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4045  hypothetical protein  35.92 
 
 
141 aa  82.8  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.589309 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3652  hypothetical protein  39.64 
 
 
136 aa  82  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.92305  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1602  hypothetical protein  32.52 
 
 
143 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4493  hypothetical protein  35.83 
 
 
148 aa  79  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5301  hypothetical protein  32.8 
 
 
143 aa  77.4  0.00000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.653983 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4786  hypothetical protein  35.77 
 
 
144 aa  74.7  0.0000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.259655  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0235  hypothetical protein  30.89 
 
 
136 aa  73.9  0.0000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.737012  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1832  hypothetical protein  36.11 
 
 
138 aa  70.5  0.000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0184205  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7489  hypothetical protein  36.19 
 
 
139 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.840415  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1758  hypothetical protein  29.77 
 
 
130 aa  68.2  0.00000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.799098  normal  0.109738 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1903  hypothetical protein  29.82 
 
 
132 aa  67.4  0.00000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.539737  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0859  hypothetical protein  31.73 
 
 
132 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0302426  normal  0.401608 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2788  hypothetical protein  31.03 
 
 
132 aa  67.4  0.00000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.159844  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0616  hypothetical protein  30.3 
 
 
176 aa  67  0.00000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.11399  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1994  hypothetical protein  30.84 
 
 
120 aa  67  0.00000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.253194  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0843  hypothetical protein  36.17 
 
 
145 aa  65.5  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3482  protein of unknown function DUF35  33.33 
 
 
319 aa  64.3  0.0000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.893274  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3606  protein of unknown function DUF35  33.33 
 
 
130 aa  63.9  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.215549  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3587  hypothetical protein  28.68 
 
 
137 aa  63.9  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.400148 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1804  hypothetical protein  28.8 
 
 
140 aa  63.9  0.0000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.983 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0892  hypothetical protein  28.79 
 
 
142 aa  63.9  0.0000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.204366  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1979  protein of unknown function DUF35  28.68 
 
 
137 aa  63.9  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0353441  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8196  hypothetical protein  30.25 
 
 
319 aa  63.9  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6630  hypothetical protein  35.9 
 
 
120 aa  63.2  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0233518  normal  0.987358 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0549  hypothetical protein  32.52 
 
 
132 aa  61.6  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0860  hypothetical protein  31.53 
 
 
138 aa  61.6  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3541  hypothetical protein  34.62 
 
 
156 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0915855 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0582  hypothetical protein  30.17 
 
 
137 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00877368  normal  0.438267 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4054  hypothetical protein  29.1 
 
 
151 aa  61.2  0.000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0163629  normal  0.53534 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1972  nucleic-acid-binding protein containing a Zn-ribbon-like protein  32.79 
 
 
150 aa  61.2  0.000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1880  hypothetical protein  27.91 
 
 
137 aa  60.8  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0682045 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3114  hypothetical protein  31.25 
 
 
130 aa  60.8  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0274298  normal  0.392807 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5775  protein of unknown function DUF35  38.61 
 
 
129 aa  60.5  0.000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0423668  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5500  hypothetical protein  32.54 
 
 
132 aa  60.5  0.000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5005  hypothetical protein  30.09 
 
 
129 aa  60.5  0.000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.264526  normal  0.0828633 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2094  hypothetical protein  32.8 
 
 
128 aa  59.7  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5112  hypothetical protein  34.75 
 
 
132 aa  59.7  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000923569  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6833  hypothetical protein  30.36 
 
 
121 aa  60.1  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2138  hypothetical protein  29.6 
 
 
321 aa  59.7  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2821  hypothetical protein  35.14 
 
 
315 aa  60.1  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.875118  normal  0.0237416 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2010  hypothetical protein  28.06 
 
 
137 aa  59.3  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.392361  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3806  hypothetical protein  31.25 
 
 
132 aa  59.3  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2152  hypothetical protein  25.81 
 
 
311 aa  59.3  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2932  hypothetical protein  29.37 
 
 
137 aa  59.3  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.241273  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5278  hypothetical protein  33.9 
 
 
135 aa  58.9  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0899  hypothetical protein  30.91 
 
 
131 aa  58.5  0.00000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.312493  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4268  hypothetical protein  25.9 
 
 
140 aa  58.2  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.450465 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2378  hypothetical protein  26.28 
 
 
143 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.301734  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2351  hypothetical protein  30.36 
 
 
130 aa  58.2  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.387375  normal  0.674763 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2623  hypothetical protein  35.92 
 
 
305 aa  57.8  0.00000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.140164  normal  0.486862 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4153  hypothetical protein  30.89 
 
 
132 aa  57.4  0.00000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.280027  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2276  hypothetical protein  38.24 
 
 
123 aa  57.4  0.00000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.501265 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3511  hypothetical protein  31.48 
 
 
131 aa  56.2  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0032  hypothetical protein  24.44 
 
 
138 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.662095  normal  0.14279 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2101  hypothetical protein  31.48 
 
 
139 aa  56.6  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.416637  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2662  hypothetical protein  28.97 
 
 
136 aa  55.5  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2934  hypothetical protein  29.69 
 
 
144 aa  55.8  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.431872  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3402  hypothetical protein  37.36 
 
 
136 aa  55.5  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0631046 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3828  hypothetical protein  31.25 
 
 
132 aa  54.7  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5554  hypothetical protein  29.37 
 
 
157 aa  53.9  0.0000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8760  protein of unknown function DUF35  32.63 
 
 
140 aa  53.9  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.108371 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3885  hypothetical protein  33.87 
 
 
117 aa  53.9  0.0000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1687  hypothetical protein  28 
 
 
137 aa  53.9  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0475632  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2745  nucleic-acid-binding protein containing a Zn-ribbon  26.89 
 
 
135 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0775897 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2366  hypothetical protein  31.25 
 
 
152 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.206302  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4323  hypothetical protein  28.28 
 
 
541 aa  53.5  0.0000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.51495 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0510  hypothetical protein  32.17 
 
 
143 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3973  hypothetical protein  31.2 
 
 
125 aa  53.5  0.0000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.370228 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5539  hypothetical protein  28.12 
 
 
141 aa  53.1  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0042  hypothetical protein  23.7 
 
 
138 aa  52.8  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4072  hypothetical protein  35.23 
 
 
142 aa  53.1  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0051  hypothetical protein  23.7 
 
 
138 aa  52.8  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0173713  normal  0.0421472 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1027  hypothetical protein  28.04 
 
 
175 aa  53.1  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3932  protein of unknown function DUF35  33.33 
 
 
144 aa  52.4  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2015  hypothetical protein  31.73 
 
 
136 aa  52.8  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.196649  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0146  protein of unknown function DUF35  31.71 
 
 
127 aa  51.6  0.000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0902  hypothetical protein  29.2 
 
 
140 aa  52  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3311  hypothetical protein  26.83 
 
 
135 aa  52  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.367067 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5644  hypothetical protein  33.72 
 
 
152 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0128  hypothetical protein  31.71 
 
 
127 aa  51.6  0.000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4566  putative thiolase subunit  30.36 
 
 
132 aa  51.2  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00449482  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4017  hypothetical protein  26.36 
 
 
155 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.188869  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3318  hypothetical protein  35.9 
 
 
312 aa  51.2  0.000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000206651 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2106  hypothetical protein  32.97 
 
 
122 aa  50.8  0.000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.283808  normal  0.0319762 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4171  hypothetical protein  28.57 
 
 
548 aa  50.8  0.000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4412  hypothetical protein  31.48 
 
 
132 aa  50.4  0.000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000585754  normal  0.649702 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5096  hypothetical protein  28.36 
 
 
128 aa  50.4  0.000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0436  protein of unknown function DUF35  25 
 
 
128 aa  50.1  0.00001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.686015  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0905  hypothetical protein  25.66 
 
 
135 aa  50.1  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00718711  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0178  hypothetical protein  30 
 
 
134 aa  50.1  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.82614  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2337  protein of unknown function DUF35  30.47 
 
 
149 aa  50.1  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2483  hypothetical protein  27.62 
 
 
548 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.207424 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0387  hypothetical protein  28.12 
 
 
129 aa  49.7  0.00001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.448785  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2360  hypothetical protein  32.43 
 
 
131 aa  48.9  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.116484 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>