78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2732 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_2732  hypothetical protein  100 
 
 		 319 aa  642    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3818  protein of unknown function DUF35  60.88 
 
 		 320 aa  383  1e-105  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.704476  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2642  hypothetical protein  60.25 
 
 		 329 aa  384  1e-105  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.13056  normal  0.212134 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2839  hypothetical protein  61.49 
 
 		 319 aa  381  1e-105  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.11529  normal  0.0470778 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4634  hypothetical protein  57.45 
 
 		 338 aa  369  1e-101  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.185588  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4722  hypothetical protein  57.45 
 
 		 338 aa  369  1e-101  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5016  hypothetical protein  57.76 
 
 		 338 aa  370  1e-101  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13554  hypothetical protein  56.78 
 
 		 334 aa  371  1e-101  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000150735 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5220  hypothetical protein  56.83 
 
 		 330 aa  365  1e-100  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.146278  normal  0.27671 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1538  hypothetical protein  56.15 
 
 		 332 aa  357  9.999999999999999e-98  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3964  protein of unknown function DUF35  53.77 
 
 		 329 aa  340  2.9999999999999998e-92  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3983  protein of unknown function DUF35  50.16 
 
 		 309 aa  299  5e-80  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.411104  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3090  protein of unknown function DUF35  50.81 
 
 		 335 aa  297  2e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.736409  normal  0.697465 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1482  nucleic-acid-binding protein containing a Zn- ribbon-like protein  51.34 
 
 		 295 aa  284  1.0000000000000001e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0269  hypothetical protein  33.33 
 
 		 165 aa  76.6  0.0000000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000709024  normal  0.121609 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2783  protein of unknown function DUF35  32.39 
 
 		 165 aa  74.7  0.000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.103009  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0268  hypothetical protein  34 
 
 		 141 aa  70.5  0.00000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00125281  normal  0.120379 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0674  protein of unknown function DUF35  36.67 
 
 		 178 aa  67  0.0000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3784  protein of unknown function DUF35  27.46 
 
 		 165 aa  61.2  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.0099748  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2762  hypothetical protein  33.9 
 
 		 158 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.10983  normal  0.416635 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0340  protein of unknown function DUF35  32.65 
 
 		 134 aa  57.8  0.0000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.0000262786  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0766  hypothetical protein  35 
 
 		 135 aa  56.6  0.0000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.48862  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4045  hypothetical protein  31.75 
 
 		 141 aa  56.2  0.0000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.589309 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1758  hypothetical protein  31.13 
 
 		 130 aa  56.2  0.0000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.799098  normal  0.109738 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0397  hypothetical protein  32.2 
 
 		 177 aa  55.8  0.000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0892  hypothetical protein  30.51 
 
 		 142 aa  55.5  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.204366  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4493  hypothetical protein  31.78 
 
 		 148 aa  55.1  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5500  hypothetical protein  33.94 
 
 		 132 aa  53.5  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1501  hypothetical protein  25.22 
 
 		 133 aa  52.4  0.000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2932  hypothetical protein  32.11 
 
 		 137 aa  52  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.241273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1310  hypothetical protein  36.36 
 
 		 151 aa  52  0.00001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.120998 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5096  hypothetical protein  31.86 
 
 		 128 aa  51.2  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3482  protein of unknown function DUF35  30.25 
 
 		 319 aa  51.2  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.893274  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0149  hypothetical protein  30.48 
 
 		 129 aa  51.6  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0899  hypothetical protein  28.44 
 
 		 131 aa  50.4  0.00003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.312493  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0510  hypothetical protein  34.02 
 
 		 143 aa  50.1  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2363  hypothetical protein  32.11 
 
 		 130 aa  50.1  0.00006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2351  hypothetical protein  28.07 
 
 		 130 aa  50.1  0.00006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.387375  normal  0.674763 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2101  hypothetical protein  29.7 
 
 		 139 aa  49.7  0.00007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.416637  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0905  hypothetical protein  30.09 
 
 		 135 aa  49.3  0.00009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00718711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5005  hypothetical protein  28.32 
 
 		 129 aa  48.9  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.264526  normal  0.0828633 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2662  hypothetical protein  30.19 
 
 		 136 aa  48.9  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3114  hypothetical protein  27.19 
 
 		 130 aa  48.9  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0274298  normal  0.392807 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4017  hypothetical protein  27.83 
 
 		 155 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.188869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0155  hypothetical protein  32.71 
 
 		 130 aa  48.9  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5301  hypothetical protein  28.57 
 
 		 143 aa  48.9  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.653983 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2788  hypothetical protein  31.68 
 
 		 132 aa  48.9  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.159844  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1979  protein of unknown function DUF35  30.86 
 
 		 137 aa  48.5  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0353441  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0436  protein of unknown function DUF35  32.23 
 
 		 128 aa  48.5  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.686015  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4786  hypothetical protein  26.79 
 
 		 144 aa  47.8  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.259655  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4153  hypothetical protein  28.07 
 
 		 132 aa  47.4  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.280027  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0860  hypothetical protein  30.84 
 
 		 138 aa  47  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3806  hypothetical protein  29.91 
 
 		 132 aa  47  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3311  hypothetical protein  28.57 
 
 		 135 aa  47.4  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.367067 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2276  hypothetical protein  29.09 
 
 		 123 aa  47  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.501265 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3402  hypothetical protein  31.71 
 
 		 136 aa  46.6  0.0005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0631046 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0582  hypothetical protein  26.52 
 
 		 137 aa  47  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00877368  normal  0.438267 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2784  protein of unknown function DUF35  22.81 
 
 		 144 aa  46.6  0.0005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0211194  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5254  hypothetical protein  28.85 
 
 		 133 aa  46.6  0.0006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1880  hypothetical protein  29.63 
 
 		 137 aa  46.6  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0682045 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1625  hypothetical protein  31.63 
 
 		 130 aa  46.2  0.0007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0836  hypothetical protein  30.83 
 
 		 189 aa  45.8  0.001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2010  hypothetical protein  30.16 
 
 		 137 aa  45.8  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.392361  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2508  protein of unknown function DUF35  30.56 
 
 		 132 aa  45.4  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.347955  normal  0.395372 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3587  hypothetical protein  29.63 
 
 		 137 aa  45.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.400148 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1934  hypothetical protein  28.16 
 
 		 133 aa  44.7  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0108502  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0387  hypothetical protein  28.57 
 
 		 129 aa  44.7  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.448785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3828  hypothetical protein  26.32 
 
 		 132 aa  44.3  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8196  hypothetical protein  23.21 
 
 		 319 aa  43.9  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4072  hypothetical protein  34.41 
 
 		 142 aa  43.5  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4323  hypothetical protein  27.07 
 
 		 541 aa  43.1  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.51495 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4566  putative thiolase subunit  26.32 
 
 		 132 aa  43.1  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00449482  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1392  hypothetical protein  27.08 
 
 		 152 aa  43.1  0.006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3255  putative short chain dehydrogenase  30.23 
 
 		 413 aa  43.1  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.695501  normal  0.516031 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1438  3-hydroxybutyryl-CoA epimerase  33.93 
 
 		 576 aa  42.7  0.007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.410853  normal  0.0151032 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4054  hypothetical protein  28.83 
 
 		 151 aa  42.7  0.007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0163629  normal  0.53534 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0812  hypothetical protein  32.32 
 
 		 134 aa  42.7  0.008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.553396  hitchhiker  0.000113363 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1687  hypothetical protein  31.25 
 
 		 137 aa  42.7  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0475632  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>