187 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_1880 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_1880  hypothetical protein  100 
 
 		 137 aa  287  4e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0682045 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3587  hypothetical protein  91.24 
 
 		 137 aa  270  5.000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.400148 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1979  protein of unknown function DUF35  90.51 
 
 		 137 aa  268  2e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0353441  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1687  hypothetical protein  83.94 
 
 		 137 aa  249  1e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0475632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2932  hypothetical protein  79.56 
 
 		 137 aa  233  9e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.241273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2010  hypothetical protein  67.88 
 
 		 137 aa  202  1e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.392361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3402  hypothetical protein  63.91 
 
 		 136 aa  172  9.999999999999999e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0631046 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2934  hypothetical protein  54.92 
 
 		 144 aa  125  2.0000000000000002e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.431872  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8196  hypothetical protein  42.42 
 
 		 319 aa  120  9e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0899  hypothetical protein  39.1 
 
 		 131 aa  114  6e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.312493  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2788  hypothetical protein  39.53 
 
 		 132 aa  113  8.999999999999998e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.159844  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1602  hypothetical protein  38.81 
 
 		 143 aa  110  7.000000000000001e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1903  hypothetical protein  39.39 
 
 		 132 aa  107  6e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.539737  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5254  hypothetical protein  40.94 
 
 		 133 aa  107  7.000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2138  hypothetical protein  37.88 
 
 		 321 aa  102  2e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3692  hypothetical protein  37.5 
 
 		 550 aa  101  4e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3765  hypothetical protein  37.5 
 
 		 550 aa  101  4e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.981168 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3482  protein of unknown function DUF35  37.69 
 
 		 319 aa  100  5e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.893274  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3311  hypothetical protein  36.76 
 
 		 135 aa  99.4  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.367067 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0905  hypothetical protein  37.12 
 
 		 135 aa  99  2e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00718711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4171  hypothetical protein  39.84 
 
 		 548 aa  98.2  3e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3705  hypothetical protein  36.76 
 
 		 550 aa  98.6  3e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.724372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0843  hypothetical protein  38.13 
 
 		 145 aa  96.3  1e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2821  hypothetical protein  38.1 
 
 		 315 aa  95.5  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.875118  normal  0.0237416 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2483  hypothetical protein  38.28 
 
 		 548 aa  95.1  3e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.207424 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0510  hypothetical protein  34.85 
 
 		 143 aa  95.1  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3114  hypothetical protein  35.29 
 
 		 130 aa  93.6  7e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0274298  normal  0.392807 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1804  hypothetical protein  37.01 
 
 		 140 aa  92.8  1e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.983 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5301  hypothetical protein  36.51 
 
 		 143 aa  92  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.653983 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0582  hypothetical protein  34.88 
 
 		 137 aa  92  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00877368  normal  0.438267 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4017  hypothetical protein  34.29 
 
 		 155 aa  92.4  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.188869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2337  protein of unknown function DUF35  39.06 
 
 		 149 aa  90.9  5e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4045  hypothetical protein  40.34 
 
 		 141 aa  90.9  5e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.589309 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1758  hypothetical protein  34.4 
 
 		 130 aa  90.5  7e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.799098  normal  0.109738 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2351  hypothetical protein  35.48 
 
 		 130 aa  89.7  1e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.387375  normal  0.674763 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5453  hypothetical protein  35.43 
 
 		 152 aa  89.7  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0654575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5850  hypothetical protein  35.43 
 
 		 152 aa  89.7  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0806522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0235  hypothetical protein  37.8 
 
 		 136 aa  89.7  1e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.737012  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1671  hypothetical protein  34.65 
 
 		 152 aa  88.2  3e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1695  hypothetical protein  34.65 
 
 		 152 aa  88.2  3e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0530  hypothetical protein  34.65 
 
 		 152 aa  88.2  3e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0553  hypothetical protein  34.65 
 
 		 152 aa  88.2  3e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1644  hypothetical protein  34.65 
 
 		 152 aa  88.2  3e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.982412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0635  hypothetical protein  34.65 
 
 		 152 aa  88.2  3e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.525049  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3856  protein of unknown function DUF35  37.21 
 
 		 322 aa  87.8  4e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.343505  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3318  hypothetical protein  36.51 
 
 		 312 aa  87.4  6e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000206651 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4493  hypothetical protein  36.43 
 
 		 148 aa  86.7  9e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4323  hypothetical protein  35.11 
 
 		 541 aa  86.3  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.51495 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2745  nucleic-acid-binding protein containing a Zn-ribbon  32.28 
 
 		 135 aa  85.5  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0775897 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2101  hypothetical protein  38.28 
 
 		 139 aa  85.1  3e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.416637  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5005  hypothetical protein  34.65 
 
 		 129 aa  85.1  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.264526  normal  0.0828633 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5644  hypothetical protein  33.07 
 
 		 152 aa  84.7  4e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3606  protein of unknown function DUF35  34.65 
 
 		 130 aa  84.7  4e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.215549  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3828  hypothetical protein  37.01 
 
 		 132 aa  84  6e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4566  putative thiolase subunit  37.01 
 
 		 132 aa  82.8  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00449482  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4786  hypothetical protein  35.43 
 
 		 144 aa  82.4  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.259655  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0860  hypothetical protein  33.81 
 
 		 138 aa  81.3  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1994  hypothetical protein  34.65 
 
 		 120 aa  81.6  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.253194  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4265  hypothetical protein  29.13 
 
 		 146 aa  81.3  0.000000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.16799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2662  hypothetical protein  38.71 
 
 		 136 aa  79.3  0.00000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2623  hypothetical protein  37.3 
 
 		 305 aa  79.3  0.00000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.140164  normal  0.486862 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5500  hypothetical protein  35.38 
 
 		 132 aa  79.3  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4054  hypothetical protein  33.83 
 
 		 151 aa  78.2  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0163629  normal  0.53534 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5096  hypothetical protein  37.3 
 
 		 128 aa  77  0.00000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4153  hypothetical protein  35.61 
 
 		 132 aa  76.3  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.280027  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13575  hypothetical protein  41.67 
 
 		 311 aa  75.9  0.0000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000328171 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6630  hypothetical protein  33.06 
 
 		 120 aa  75.5  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0233518  normal  0.987358 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0859  hypothetical protein  30.33 
 
 		 132 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0302426  normal  0.401608 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2015  hypothetical protein  31.62 
 
 		 136 aa  74.3  0.0000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.196649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1501  hypothetical protein  29.37 
 
 		 133 aa  74.3  0.0000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4412  hypothetical protein  35.16 
 
 		 132 aa  73.9  0.0000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000585754  normal  0.649702 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5255  hypothetical protein  33.6 
 
 		 324 aa  74.3  0.0000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.338508 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0060  protein of unknown function DUF35  30.47 
 
 		 136 aa  74.3  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3806  hypothetical protein  34.38 
 
 		 132 aa  72.8  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0616  hypothetical protein  33.82 
 
 		 176 aa  70.9  0.000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.11399  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0340  protein of unknown function DUF35  33.33 
 
 		 134 aa  70.9  0.000000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.0000262786  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1832  hypothetical protein  33.33 
 
 		 138 aa  69.7  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0184205  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0892  hypothetical protein  32.14 
 
 		 142 aa  69.7  0.00000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.204366  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4674  hypothetical protein  32 
 
 		 318 aa  69.7  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4760  hypothetical protein  32 
 
 		 318 aa  69.7  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.247642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8760  protein of unknown function DUF35  35.71 
 
 		 140 aa  69.3  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.108371 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2152  hypothetical protein  31.36 
 
 		 311 aa  68.6  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0032  hypothetical protein  31.06 
 
 		 138 aa  68.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.662095  normal  0.14279 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4633  hypothetical protein  34.92 
 
 		 153 aa  68.9  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5059  hypothetical protein  33.33 
 
 		 317 aa  68.2  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.945383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1511  hypothetical protein  31.2 
 
 		 317 aa  68.2  0.00000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2094  hypothetical protein  29.46 
 
 		 128 aa  68.2  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0042  hypothetical protein  30.3 
 
 		 138 aa  67.8  0.00000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0051  hypothetical protein  30.3 
 
 		 138 aa  67.8  0.00000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0173713  normal  0.0421472 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6833  hypothetical protein  34.26 
 
 		 121 aa  67.4  0.00000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7489  hypothetical protein  31.78 
 
 		 139 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.840415  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4268  hypothetical protein  28.57 
 
 		 140 aa  67  0.00000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.450465 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1934  hypothetical protein  37.76 
 
 		 133 aa  67  0.00000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0108502  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0549  hypothetical protein  34.95 
 
 		 132 aa  66.6  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0377  hypothetical protein  36.08 
 
 		 130 aa  66.6  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.253705  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4179  hypothetical protein  34.44 
 
 		 145 aa  65.5  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4072  hypothetical protein  33.33 
 
 		 142 aa  65.5  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0317  protein of unknown function DUF35  32.41 
 
 		 124 aa  65.1  0.0000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3511  hypothetical protein  33.63 
 
 		 131 aa  65.1  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3932  protein of unknown function DUF35  37.21 
 
 		 144 aa  65.1  0.0000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>