138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_5096 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_5096  hypothetical protein  100 
 
 		 128 aa  267  4e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4412  hypothetical protein  54.1 
 
 		 132 aa  125  3e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000585754  normal  0.649702 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1758  hypothetical protein  48.7 
 
 		 130 aa  118  1.9999999999999998e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.799098  normal  0.109738 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4153  hypothetical protein  51.24 
 
 		 132 aa  115  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.280027  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2351  hypothetical protein  47.5 
 
 		 130 aa  114  5e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.387375  normal  0.674763 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3114  hypothetical protein  46.28 
 
 		 130 aa  114  6e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0274298  normal  0.392807 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3806  hypothetical protein  46.28 
 
 		 132 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5005  hypothetical protein  45.53 
 
 		 129 aa  108  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.264526  normal  0.0828633 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3828  hypothetical protein  45.45 
 
 		 132 aa  107  5e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4786  hypothetical protein  42.74 
 
 		 144 aa  107  6e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.259655  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3606  protein of unknown function DUF35  42.98 
 
 		 130 aa  105  1e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.215549  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4566  putative thiolase subunit  44.63 
 
 		 132 aa  105  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00449482  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5500  hypothetical protein  47.93 
 
 		 132 aa  101  3e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2662  hypothetical protein  38.81 
 
 		 136 aa  100  6e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1501  hypothetical protein  38.52 
 
 		 133 aa  100  8e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5254  hypothetical protein  39.68 
 
 		 133 aa  99  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0860  hypothetical protein  41.6 
 
 		 138 aa  93.6  9e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4045  hypothetical protein  40.34 
 
 		 141 aa  85.1  3e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.589309 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0343  hypothetical protein  37.5 
 
 		 119 aa  84.3  5e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.619973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3402  hypothetical protein  40.6 
 
 		 136 aa  84.3  5e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0631046 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1979  protein of unknown function DUF35  38.89 
 
 		 137 aa  81.6  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0353441  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3587  hypothetical protein  38.1 
 
 		 137 aa  79.3  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.400148 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4020  hypothetical protein  41.18 
 
 		 141 aa  78.2  0.00000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.909625 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1880  hypothetical protein  37.3 
 
 		 137 aa  77  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0682045 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2010  hypothetical protein  35.94 
 
 		 137 aa  77  0.00000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.392361  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0510  hypothetical protein  32.54 
 
 		 143 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6630  hypothetical protein  38.14 
 
 		 120 aa  75.1  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0233518  normal  0.987358 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1602  hypothetical protein  35.94 
 
 		 143 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6482  hypothetical protein  37.61 
 
 		 146 aa  73.9  0.0000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0235  hypothetical protein  33.33 
 
 		 136 aa  73.9  0.0000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.737012  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2582  hypothetical protein  36.84 
 
 		 123 aa  73.9  0.0000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.709226  normal  0.0256768 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5112  hypothetical protein  35.71 
 
 		 132 aa  73.6  0.0000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000923569  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51200  hypothetical protein  40.18 
 
 		 128 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.719355  hitchhiker  0.00000582925 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5281  hypothetical protein  35 
 
 		 146 aa  72.8  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6844  hypothetical protein  36.79 
 
 		 121 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1687  hypothetical protein  38.1 
 
 		 137 aa  70.9  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0475632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2101  hypothetical protein  37.5 
 
 		 139 aa  70.5  0.000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.416637  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4493  hypothetical protein  37.98 
 
 		 148 aa  69.3  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4369  hypothetical protein  37.5 
 
 		 127 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5301  hypothetical protein  34.43 
 
 		 143 aa  68.6  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.653983 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2934  hypothetical protein  36.44 
 
 		 144 aa  67.8  0.00000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.431872  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3482  protein of unknown function DUF35  32.28 
 
 		 319 aa  67.4  0.00000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.893274  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3318  hypothetical protein  33.87 
 
 		 312 aa  67.4  0.00000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000206651 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0843  hypothetical protein  34.88 
 
 		 145 aa  67  0.00000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2932  hypothetical protein  33.33 
 
 		 137 aa  66.6  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.241273  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5278  hypothetical protein  30.43 
 
 		 135 aa  64.3  0.0000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2378  hypothetical protein  34.21 
 
 		 143 aa  63.9  0.0000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.301734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3692  hypothetical protein  35.16 
 
 		 550 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3765  hypothetical protein  35.16 
 
 		 550 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.981168 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3705  hypothetical protein  35.16 
 
 		 550 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.724372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4072  hypothetical protein  37.61 
 
 		 142 aa  62.4  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2337  protein of unknown function DUF35  33.05 
 
 		 149 aa  62  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1073  hypothetical protein  31.19 
 
 		 128 aa  62  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1832  hypothetical protein  33.33 
 
 		 138 aa  61.2  0.000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0184205  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5453  hypothetical protein  30.83 
 
 		 152 aa  61.2  0.000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0654575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5850  hypothetical protein  30.83 
 
 		 152 aa  61.2  0.000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0806522  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1994  hypothetical protein  31.48 
 
 		 120 aa  60.8  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.253194  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5539  hypothetical protein  32.48 
 
 		 141 aa  60.5  0.000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1671  hypothetical protein  30.08 
 
 		 152 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2821  hypothetical protein  36.04 
 
 		 315 aa  60.1  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.875118  normal  0.0237416 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5775  protein of unknown function DUF35  33.96 
 
 		 129 aa  60.1  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0423668  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1695  hypothetical protein  30.08 
 
 		 152 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0530  hypothetical protein  30.08 
 
 		 152 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8196  hypothetical protein  29.92 
 
 		 319 aa  60.1  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1644  hypothetical protein  30.08 
 
 		 152 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.982412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0553  hypothetical protein  30.08 
 
 		 152 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0635  hypothetical protein  30.08 
 
 		 152 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.525049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2276  hypothetical protein  34.23 
 
 		 123 aa  59.7  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.501265 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3311  hypothetical protein  32.81 
 
 		 135 aa  59.3  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.367067 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0582  hypothetical protein  33.04 
 
 		 137 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00877368  normal  0.438267 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4268  hypothetical protein  32.46 
 
 		 140 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.450465 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2745  nucleic-acid-binding protein containing a Zn-ribbon  28.23 
 
 		 135 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0775897 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0042  hypothetical protein  31.58 
 
 		 138 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0051  hypothetical protein  31.58 
 
 		 138 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0173713  normal  0.0421472 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0899  hypothetical protein  30.7 
 
 		 131 aa  57.4  0.00000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.312493  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0859  hypothetical protein  29.03 
 
 		 132 aa  57  0.00000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0302426  normal  0.401608 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2840  protein of unknown function DUF35  33.33 
 
 		 132 aa  55.8  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00189293  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7489  hypothetical protein  28.24 
 
 		 139 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.840415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0032  hypothetical protein  31.58 
 
 		 138 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.662095  normal  0.14279 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0178  hypothetical protein  32.46 
 
 		 134 aa  56.2  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.82614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4323  hypothetical protein  33.61 
 
 		 541 aa  55.1  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.51495 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4171  hypothetical protein  32.03 
 
 		 548 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1804  hypothetical protein  31.91 
 
 		 140 aa  54.7  0.0000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.983 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5644  hypothetical protein  28.57 
 
 		 152 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0902  hypothetical protein  29.17 
 
 		 140 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0146  protein of unknown function DUF35  30.7 
 
 		 127 aa  53.9  0.0000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3511  hypothetical protein  33.94 
 
 		 131 aa  53.5  0.0000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0128  hypothetical protein  30.7 
 
 		 127 aa  53.5  0.0000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1903  hypothetical protein  30.65 
 
 		 132 aa  53.1  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.539737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2138  hypothetical protein  26.98 
 
 		 321 aa  52.8  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5220  hypothetical protein  34.86 
 
 		 330 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.146278  normal  0.27671 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0317  protein of unknown function DUF35  30.28 
 
 		 124 aa  52.4  0.000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0616  hypothetical protein  39.85 
 
 		 176 aa  52.8  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.11399  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3214  hypothetical protein  33.65 
 
 		 145 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.907218  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3276  hypothetical protein  33.65 
 
 		 145 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3225  hypothetical protein  33.65 
 
 		 145 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.730825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4017  hypothetical protein  30.77 
 
 		 155 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.188869  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4634  hypothetical protein  32.38 
 
 		 338 aa  51.2  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.185588  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4722  hypothetical protein  32.38 
 
 		 338 aa  51.2  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5016  hypothetical protein  32.38 
 
 		 338 aa  51.2  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>