111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4633 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_4633  hypothetical protein  100 
 
 		 153 aa  313  7e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1903  hypothetical protein  37.8 
 
 		 132 aa  83.6  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.539737  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3482  protein of unknown function DUF35  36.49 
 
 		 319 aa  82.8  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.893274  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0905  hypothetical protein  35.71 
 
 		 135 aa  75.5  0.0000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00718711  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0582  hypothetical protein  37.07 
 
 		 137 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00877368  normal  0.438267 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1979  protein of unknown function DUF35  37.3 
 
 		 137 aa  75.5  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0353441  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0899  hypothetical protein  33.61 
 
 		 131 aa  72  0.000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.312493  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3587  hypothetical protein  35.71 
 
 		 137 aa  70.9  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.400148 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3311  hypothetical protein  33.33 
 
 		 135 aa  70.9  0.000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.367067 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2101  hypothetical protein  35.04 
 
 		 139 aa  70.5  0.000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.416637  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1880  hypothetical protein  34.92 
 
 		 137 aa  68.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0682045 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1994  hypothetical protein  36.94 
 
 		 120 aa  67.8  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.253194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1804  hypothetical protein  35.43 
 
 		 140 aa  66.2  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.983 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2010  hypothetical protein  36.13 
 
 		 137 aa  66.2  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.392361  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5301  hypothetical protein  36.13 
 
 		 143 aa  66.2  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.653983 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1758  hypothetical protein  31.01 
 
 		 130 aa  66.2  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.799098  normal  0.109738 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2015  hypothetical protein  31.15 
 
 		 136 aa  63.9  0.0000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.196649  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8196  hypothetical protein  32.76 
 
 		 319 aa  63.2  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1687  hypothetical protein  33.61 
 
 		 137 aa  63.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0475632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4045  hypothetical protein  35.19 
 
 		 141 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.589309 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2932  hypothetical protein  33.61 
 
 		 137 aa  60.8  0.000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.241273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4323  hypothetical protein  33.94 
 
 		 541 aa  60.8  0.000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.51495 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2138  hypothetical protein  31.54 
 
 		 321 aa  60.5  0.000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1602  hypothetical protein  29.66 
 
 		 143 aa  59.3  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4017  hypothetical protein  32.43 
 
 		 155 aa  57  0.00000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.188869  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0510  hypothetical protein  26.57 
 
 		 143 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4412  hypothetical protein  28.57 
 
 		 132 aa  56.2  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000585754  normal  0.649702 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5005  hypothetical protein  25.58 
 
 		 129 aa  55.8  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.264526  normal  0.0828633 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5254  hypothetical protein  29.66 
 
 		 133 aa  55.5  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3652  hypothetical protein  28.89 
 
 		 136 aa  55.5  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.92305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0060  protein of unknown function DUF35  30 
 
 		 136 aa  54.7  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0616  hypothetical protein  30.4 
 
 		 176 aa  54.7  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.11399  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3114  hypothetical protein  27.42 
 
 		 130 aa  54.7  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0274298  normal  0.392807 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1609  protein of unknown function DUF35  31.07 
 
 		 133 aa  53.9  0.0000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2351  hypothetical protein  28.23 
 
 		 130 aa  54.3  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.387375  normal  0.674763 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4493  hypothetical protein  27.78 
 
 		 148 aa  53.9  0.0000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8760  protein of unknown function DUF35  26.87 
 
 		 140 aa  52.8  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.108371 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2363  hypothetical protein  36.08 
 
 		 130 aa  52.4  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1972  nucleic-acid-binding protein containing a Zn-ribbon-like protein  27.78 
 
 		 150 aa  52.4  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3318  hypothetical protein  31.45 
 
 		 312 aa  52.8  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000206651 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1832  hypothetical protein  28.57 
 
 		 138 aa  52  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0184205  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3402  hypothetical protein  32.74 
 
 		 136 aa  52  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0631046 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1501  hypothetical protein  25.19 
 
 		 133 aa  51.2  0.000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5453  hypothetical protein  32.8 
 
 		 152 aa  50.8  0.000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0654575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5850  hypothetical protein  32.8 
 
 		 152 aa  50.8  0.000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0806522  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3606  protein of unknown function DUF35  26.61 
 
 		 130 aa  50.8  0.000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.215549  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2106  hypothetical protein  38.36 
 
 		 122 aa  50.4  0.000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.283808  normal  0.0319762 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0149  hypothetical protein  30.91 
 
 		 129 aa  50.1  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4171  hypothetical protein  26.77 
 
 		 548 aa  50.4  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4265  hypothetical protein  26.19 
 
 		 146 aa  50.1  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.16799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1625  hypothetical protein  31.73 
 
 		 130 aa  50.1  0.00001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1648  hypothetical protein  30.43 
 
 		 135 aa  49.7  0.00001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5278  hypothetical protein  33.64 
 
 		 135 aa  48.9  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3313  hypothetical protein  30.56 
 
 		 121 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2788  hypothetical protein  28.68 
 
 		 132 aa  49.3  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.159844  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4054  hypothetical protein  27.56 
 
 		 151 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0163629  normal  0.53534 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2840  protein of unknown function DUF35  29.82 
 
 		 132 aa  48.9  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00189293  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6844  hypothetical protein  27.64 
 
 		 121 aa  49.7  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6482  hypothetical protein  30.4 
 
 		 146 aa  48.9  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1671  hypothetical protein  32 
 
 		 152 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5644  hypothetical protein  30.66 
 
 		 152 aa  48.9  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1695  hypothetical protein  32 
 
 		 152 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0530  hypothetical protein  32 
 
 		 152 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1644  hypothetical protein  32 
 
 		 152 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.982412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0553  hypothetical protein  32 
 
 		 152 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0635  hypothetical protein  32 
 
 		 152 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.525049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2337  protein of unknown function DUF35  31.97 
 
 		 149 aa  48.5  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0235  hypothetical protein  27.69 
 
 		 136 aa  48.1  0.00004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.737012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0860  hypothetical protein  29.03 
 
 		 138 aa  47.8  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2483  hypothetical protein  26.92 
 
 		 548 aa  47.4  0.00006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.207424 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0340  protein of unknown function DUF35  30.56 
 
 		 134 aa  47.8  0.00006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.0000262786  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4606  hypothetical protein  32.81 
 
 		 109 aa  47  0.00009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4153  hypothetical protein  26.98 
 
 		 132 aa  47  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.280027  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2821  hypothetical protein  28.21 
 
 		 315 aa  46.6  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.875118  normal  0.0237416 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5775  protein of unknown function DUF35  29.66 
 
 		 129 aa  46.6  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0423668  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3828  hypothetical protein  28 
 
 		 132 aa  46.2  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2276  hypothetical protein  31.9 
 
 		 123 aa  45.8  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.501265 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6833  hypothetical protein  30.56 
 
 		 121 aa  46.2  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2366  hypothetical protein  23.26 
 
 		 152 aa  45.1  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.206302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2582  hypothetical protein  29.03 
 
 		 123 aa  45.1  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.709226  normal  0.0256768 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0528  hypothetical protein  24.56 
 
 		 129 aa  45.4  0.0003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.825077  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6630  hypothetical protein  34.96 
 
 		 120 aa  45.1  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0233518  normal  0.987358 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3692  hypothetical protein  28.44 
 
 		 550 aa  44.3  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3765  hypothetical protein  28.44 
 
 		 550 aa  44.3  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.981168 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0178  hypothetical protein  24.79 
 
 		 134 aa  44.7  0.0005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.82614  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0146  protein of unknown function DUF35  26.45 
 
 		 127 aa  44.7  0.0005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0317  protein of unknown function DUF35  24.19 
 
 		 124 aa  44.3  0.0006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7489  hypothetical protein  26.28 
 
 		 139 aa  44.3  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.840415  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3806  hypothetical protein  28.8 
 
 		 132 aa  44.3  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0128  hypothetical protein  26.45 
 
 		 127 aa  44.3  0.0006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4020  hypothetical protein  32.41 
 
 		 141 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.909625 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0397  hypothetical protein  29.87 
 
 		 177 aa  44.3  0.0006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3541  hypothetical protein  22.88 
 
 		 156 aa  44.3  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0915855 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3951  hypothetical protein  28.57 
 
 		 121 aa  43.9  0.0007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.26677  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2623  hypothetical protein  28.21 
 
 		 305 aa  43.9  0.0008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.140164  normal  0.486862 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2498  2-oxoacid dehydrogenase subunit E1  30.83 
 
 		 902 aa  43.9  0.0008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.710638  normal  0.585556 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5281  hypothetical protein  33.04 
 
 		 146 aa  43.9  0.0009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0859  hypothetical protein  25.23 
 
 		 132 aa  43.5  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0302426  normal  0.401608 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3705  hypothetical protein  28.44 
 
 		 550 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.724372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0460  hypothetical protein  28.16 
 
 		 130 aa  43.5  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0490887  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>