160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_2363 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_2363  hypothetical protein  100 
 
 
130 aa  271  2.0000000000000002e-72  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0155  hypothetical protein  70.77 
 
 
130 aa  207  6e-53  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2508  protein of unknown function DUF35  70.77 
 
 
132 aa  204  3e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.347955  normal  0.395372 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0149  hypothetical protein  63.57 
 
 
129 aa  187  4e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1392  hypothetical protein  58.14 
 
 
152 aa  176  5.999999999999999e-44  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1625  hypothetical protein  59.38 
 
 
130 aa  174  4e-43  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0549  hypothetical protein  57.36 
 
 
132 aa  171  2.9999999999999996e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1934  hypothetical protein  56.25 
 
 
133 aa  168  2e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0108502  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0528  hypothetical protein  52.76 
 
 
129 aa  158  2e-38  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.825077  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0460  hypothetical protein  53.91 
 
 
130 aa  157  4e-38  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0490887  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1459  hypothetical protein  54.69 
 
 
130 aa  157  6e-38  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0377  hypothetical protein  53.91 
 
 
130 aa  153  7e-37  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.253705  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0023  hypothetical protein  48.41 
 
 
130 aa  140  7e-33  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0340  protein of unknown function DUF35  48.12 
 
 
134 aa  132  9.999999999999999e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.0000262786  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0766  hypothetical protein  39.84 
 
 
135 aa  98.2  3e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.48862  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0794  hypothetical protein  39.53 
 
 
133 aa  93.6  7e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1241  hypothetical protein  35.88 
 
 
137 aa  93.2  9e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0148077  normal  0.0127741 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1357  hypothetical protein  38.35 
 
 
132 aa  90.5  7e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0812  hypothetical protein  36.92 
 
 
134 aa  89  2e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.553396  hitchhiker  0.000113363 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1083  hypothetical protein  43.51 
 
 
134 aa  87  8e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1145  protein of unknown function DUF35  36.64 
 
 
133 aa  82.4  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0574924  hitchhiker  0.0000746026 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1648  hypothetical protein  33.61 
 
 
135 aa  82.4  0.000000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0984  hypothetical protein  36.09 
 
 
132 aa  80.9  0.000000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0428  hypothetical protein  34.11 
 
 
131 aa  79.7  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0261769  normal  0.146814 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1609  protein of unknown function DUF35  33.86 
 
 
133 aa  78.2  0.00000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5254  hypothetical protein  40.2 
 
 
133 aa  73.2  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4045  hypothetical protein  37.8 
 
 
141 aa  70.9  0.000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.589309 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5005  hypothetical protein  36.19 
 
 
129 aa  67.4  0.00000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.264526  normal  0.0828633 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1979  protein of unknown function DUF35  36.46 
 
 
137 aa  64.3  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0353441  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3114  hypothetical protein  35.24 
 
 
130 aa  63.5  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0274298  normal  0.392807 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3587  hypothetical protein  36.46 
 
 
137 aa  63.5  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.400148 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1687  hypothetical protein  36.46 
 
 
137 aa  63.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0475632  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3606  protein of unknown function DUF35  36.19 
 
 
130 aa  63.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.215549  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1438  3-hydroxybutyryl-CoA epimerase  31.25 
 
 
576 aa  63.5  0.000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.410853  normal  0.0151032 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1925  protein of unknown function DUF35  32.19 
 
 
474 aa  62.8  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1832  hypothetical protein  33.33 
 
 
138 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0184205  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5500  hypothetical protein  33.33 
 
 
132 aa  62.4  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5301  hypothetical protein  34.86 
 
 
143 aa  62  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.653983 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0397  hypothetical protein  31.73 
 
 
177 aa  62.4  0.000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2351  hypothetical protein  34.29 
 
 
130 aa  62  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.387375  normal  0.674763 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1880  hypothetical protein  35.42 
 
 
137 aa  62  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0682045 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2152  hypothetical protein  30.7 
 
 
311 aa  60.8  0.000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8196  hypothetical protein  35.51 
 
 
319 aa  61.2  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2932  hypothetical protein  36.46 
 
 
137 aa  60.8  0.000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.241273  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3214  hypothetical protein  33.33 
 
 
145 aa  60.8  0.000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.907218  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3276  hypothetical protein  33.33 
 
 
145 aa  60.8  0.000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3225  hypothetical protein  33.33 
 
 
145 aa  60.8  0.000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.730825  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4268  hypothetical protein  33.03 
 
 
140 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.450465 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1758  hypothetical protein  35.14 
 
 
130 aa  59.7  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.799098  normal  0.109738 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0235  hypothetical protein  37.66 
 
 
136 aa  58.9  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.737012  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2934  hypothetical protein  35.87 
 
 
144 aa  59.3  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.431872  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0836  hypothetical protein  30.21 
 
 
189 aa  58.9  0.00000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2010  hypothetical protein  32.41 
 
 
137 aa  58.5  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.392361  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4072  hypothetical protein  34.38 
 
 
142 aa  58.2  0.00000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0859  hypothetical protein  33.03 
 
 
132 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0302426  normal  0.401608 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2378  hypothetical protein  33.96 
 
 
143 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.301734  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4017  hypothetical protein  34.68 
 
 
155 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.188869  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1602  hypothetical protein  33.33 
 
 
143 aa  57  0.00000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0436  protein of unknown function DUF35  32.5 
 
 
128 aa  56.6  0.0000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.686015  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1994  hypothetical protein  38.38 
 
 
120 aa  56.2  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.253194  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0032  hypothetical protein  32.11 
 
 
138 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.662095  normal  0.14279 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1550  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.08 
 
 
913 aa  56.2  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3402  hypothetical protein  32.41 
 
 
136 aa  56.2  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0631046 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0674  protein of unknown function DUF35  28.89 
 
 
178 aa  56.2  0.0000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3828  hypothetical protein  33.96 
 
 
132 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0458  hypothetical protein  27.83 
 
 
182 aa  56.2  0.0000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1903  hypothetical protein  35.79 
 
 
132 aa  55.8  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.539737  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0582  hypothetical protein  34.04 
 
 
137 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00877368  normal  0.438267 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2337  protein of unknown function DUF35  36.46 
 
 
149 aa  55.5  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5278  hypothetical protein  37.5 
 
 
135 aa  54.7  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4021  protein of unknown function DUF35  29.86 
 
 
481 aa  54.3  0.0000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.605764  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3311  hypothetical protein  36.7 
 
 
135 aa  53.9  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.367067 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1501  hypothetical protein  31.13 
 
 
133 aa  53.9  0.0000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0387  hypothetical protein  29.55 
 
 
129 aa  53.5  0.0000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.448785  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4323  hypothetical protein  38.95 
 
 
541 aa  53.1  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.51495 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3511  hypothetical protein  32.69 
 
 
131 aa  53.5  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0146  protein of unknown function DUF35  35.63 
 
 
127 aa  53.5  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0128  hypothetical protein  35.63 
 
 
127 aa  53.1  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4265  hypothetical protein  27.93 
 
 
146 aa  53.1  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.16799  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0899  hypothetical protein  30.63 
 
 
131 aa  52.8  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.312493  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0042  hypothetical protein  30.48 
 
 
138 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2788  hypothetical protein  34.21 
 
 
132 aa  52  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.159844  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4633  hypothetical protein  36.08 
 
 
153 aa  52.4  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0051  hypothetical protein  30.48 
 
 
138 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0173713  normal  0.0421472 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4566  putative thiolase subunit  33.02 
 
 
132 aa  52  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00449482  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4412  hypothetical protein  31.86 
 
 
132 aa  52  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000585754  normal  0.649702 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3932  protein of unknown function DUF35  31 
 
 
144 aa  51.6  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5539  hypothetical protein  31.78 
 
 
141 aa  51.2  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3871  hypothetical protein  25.56 
 
 
131 aa  51.6  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0178  hypothetical protein  32.95 
 
 
134 aa  51.6  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.82614  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4493  hypothetical protein  31.96 
 
 
148 aa  50.8  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1804  hypothetical protein  33.33 
 
 
140 aa  50.4  0.000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.983 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2138  hypothetical protein  33.33 
 
 
321 aa  50.4  0.000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3973  hypothetical protein  36.26 
 
 
125 aa  50.4  0.000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.370228 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4153  hypothetical protein  31.73 
 
 
132 aa  50.4  0.000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.280027  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3806  hypothetical protein  29.25 
 
 
132 aa  50.1  0.000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7489  hypothetical protein  27.97 
 
 
139 aa  49.7  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.840415  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3600  hypothetical protein  28.71 
 
 
140 aa  49.7  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0665674  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8760  protein of unknown function DUF35  33.01 
 
 
140 aa  50.1  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.108371 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2732  hypothetical protein  32.11 
 
 
319 aa  50.1  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>