156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0397 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_0397  hypothetical protein  100 
 
 		 177 aa  362  2e-99  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0674  protein of unknown function DUF35  60.45 
 
 		 178 aa  227  6e-59  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1438  3-hydroxybutyryl-CoA epimerase  52.02 
 
 		 576 aa  191  4e-48  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.410853  normal  0.0151032 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0836  hypothetical protein  50.29 
 
 		 189 aa  183  1.0000000000000001e-45  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0458  hypothetical protein  50.29 
 
 		 182 aa  182  3e-45  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0436  protein of unknown function DUF35  42.74 
 
 		 128 aa  108  4.0000000000000004e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.686015  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0387  hypothetical protein  44.74 
 
 		 129 aa  105  3e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.448785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1310  hypothetical protein  43.86 
 
 		 151 aa  98.2  5e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.120998 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0598  protein of unknown function DUF35  37.07 
 
 		 127 aa  77.4  0.00000000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0023  hypothetical protein  32.73 
 
 		 130 aa  64.3  0.0000000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0460  hypothetical protein  33 
 
 		 130 aa  63.9  0.000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0490887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1459  hypothetical protein  33 
 
 		 130 aa  63.5  0.000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0377  hypothetical protein  34 
 
 		 130 aa  63.2  0.000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.253705  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1832  hypothetical protein  26.85 
 
 		 138 aa  62.4  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0184205  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2363  hypothetical protein  31.73 
 
 		 130 aa  62.4  0.000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2476  protein of unknown function DUF35  31.48 
 
 		 134 aa  60.1  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.73466  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5005  hypothetical protein  32 
 
 		 129 aa  60.1  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.264526  normal  0.0828633 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3606  protein of unknown function DUF35  31 
 
 		 130 aa  58.9  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.215549  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3090  protein of unknown function DUF35  30.97 
 
 		 335 aa  58.9  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.736409  normal  0.697465 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3780  protein of unknown function DUF35  29.75 
 
 		 126 aa  58.9  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.000111928  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7489  hypothetical protein  29.52 
 
 		 139 aa  58.2  0.00000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.840415  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2508  protein of unknown function DUF35  30.97 
 
 		 132 aa  57.8  0.00000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.347955  normal  0.395372 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2808  protein of unknown function DUF35  29.46 
 
 		 128 aa  57.4  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0884467  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0155  hypothetical protein  29.13 
 
 		 130 aa  57.4  0.0000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2351  hypothetical protein  32.35 
 
 		 130 aa  57.4  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.387375  normal  0.674763 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1005  protein of unknown function DUF35  30.63 
 
 		 133 aa  57  0.0000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.966695  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5254  hypothetical protein  31.37 
 
 		 133 aa  56.6  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2762  hypothetical protein  29.38 
 
 		 158 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.10983  normal  0.416635 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3114  hypothetical protein  31.37 
 
 		 130 aa  55.8  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0274298  normal  0.392807 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2732  hypothetical protein  32.2 
 
 		 319 aa  55.8  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0528  hypothetical protein  29 
 
 		 129 aa  55.8  0.0000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.825077  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5539  hypothetical protein  36.11 
 
 		 141 aa  55.5  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5775  protein of unknown function DUF35  29.75 
 
 		 129 aa  55.1  0.0000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0423668  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1392  hypothetical protein  30.85 
 
 		 152 aa  54.7  0.0000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0549  hypothetical protein  30.68 
 
 		 132 aa  53.5  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0859  hypothetical protein  27.88 
 
 		 132 aa  53.5  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0302426  normal  0.401608 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1758  hypothetical protein  28.16 
 
 		 130 aa  53.9  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.799098  normal  0.109738 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8760  protein of unknown function DUF35  33.77 
 
 		 140 aa  54.3  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.108371 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0146  protein of unknown function DUF35  24.35 
 
 		 127 aa  53.1  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4132  hypothetical protein  33.68 
 
 		 149 aa  53.1  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.479777  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0128  hypothetical protein  24.35 
 
 		 127 aa  53.1  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1994  hypothetical protein  28.71 
 
 		 120 aa  52.8  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.253194  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1625  hypothetical protein  28.33 
 
 		 130 aa  53.1  0.000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4054  hypothetical protein  25.66 
 
 		 151 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0163629  normal  0.53534 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2932  hypothetical protein  29.79 
 
 		 137 aa  53.5  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.241273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2276  hypothetical protein  33.66 
 
 		 123 aa  52.8  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.501265 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3652  hypothetical protein  24.39 
 
 		 136 aa  53.1  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.92305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3932  protein of unknown function DUF35  26.61 
 
 		 144 aa  52.4  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1497  protein of unknown function DUF35  41.67 
 
 		 417 aa  52.4  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1687  hypothetical protein  26.36 
 
 		 137 aa  52.4  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0475632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0178  hypothetical protein  23.14 
 
 		 134 aa  52.4  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.82614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3482  protein of unknown function DUF35  29.63 
 
 		 319 aa  52.8  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.893274  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3818  protein of unknown function DUF35  32.56 
 
 		 320 aa  52.4  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.704476  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0268  hypothetical protein  31.91 
 
 		 141 aa  52.8  0.000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00125281  normal  0.120379 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5278  hypothetical protein  28.16 
 
 		 135 aa  52  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0340  protein of unknown function DUF35  30.77 
 
 		 134 aa  52  0.000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.0000262786  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4493  hypothetical protein  23.81 
 
 		 148 aa  52  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0794  hypothetical protein  34.78 
 
 		 133 aa  52  0.000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5301  hypothetical protein  26.73 
 
 		 143 aa  50.8  0.000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.653983 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1083  hypothetical protein  35.63 
 
 		 134 aa  50.8  0.000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1934  hypothetical protein  27.63 
 
 		 133 aa  50.4  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0108502  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3806  hypothetical protein  25 
 
 		 132 aa  50.4  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0812  hypothetical protein  35.16 
 
 		 134 aa  50.8  0.00001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.553396  hitchhiker  0.000113363 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4268  hypothetical protein  28.21 
 
 		 140 aa  50.4  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.450465 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0269  hypothetical protein  36.36 
 
 		 165 aa  50.8  0.00001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000709024  normal  0.121609 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2101  hypothetical protein  21.32 
 
 		 139 aa  50.8  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.416637  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1357  hypothetical protein  32.97 
 
 		 132 aa  49.7  0.00002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2783  protein of unknown function DUF35  38.46 
 
 		 165 aa  48.9  0.00003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.103009  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4153  hypothetical protein  26.23 
 
 		 132 aa  49.3  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.280027  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4634  hypothetical protein  34.25 
 
 		 338 aa  49.3  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.185588  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0766  hypothetical protein  31.43 
 
 		 135 aa  49.3  0.00003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.48862  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4722  hypothetical protein  34.25 
 
 		 338 aa  49.3  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0897  protein of unknown function DUF35  38.37 
 
 		 131 aa  49.3  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5016  hypothetical protein  34.25 
 
 		 338 aa  49.3  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2784  protein of unknown function DUF35  27.13 
 
 		 144 aa  48.5  0.00004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0211194  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1609  protein of unknown function DUF35  29.41 
 
 		 133 aa  48.5  0.00005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0510  hypothetical protein  27.72 
 
 		 143 aa  48.5  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3311  hypothetical protein  27.1 
 
 		 135 aa  48.5  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.367067 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1630  hypothetical protein  24.07 
 
 		 128 aa  48.5  0.00005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3983  protein of unknown function DUF35  27.19 
 
 		 309 aa  48.5  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.411104  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0899  hypothetical protein  28.43 
 
 		 131 aa  48.1  0.00006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.312493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2010  hypothetical protein  25.23 
 
 		 137 aa  48.1  0.00006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.392361  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1482  nucleic-acid-binding protein containing a Zn- ribbon-like protein  27.36 
 
 		 295 aa  48.1  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0235  hypothetical protein  26.39 
 
 		 136 aa  48.1  0.00007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.737012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2378  hypothetical protein  28.21 
 
 		 143 aa  47.8  0.00008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.301734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2582  hypothetical protein  31.67 
 
 		 123 aa  47.8  0.00009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.709226  normal  0.0256768 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4786  hypothetical protein  31.48 
 
 		 144 aa  47.4  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.259655  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2745  nucleic-acid-binding protein containing a Zn-ribbon  31.63 
 
 		 135 aa  47.4  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0775897 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3600  hypothetical protein  23.94 
 
 		 140 aa  47  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0665674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0351  hypothetical protein  30.88 
 
 		 141 aa  47  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000546433  hitchhiker  0.00000644081 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4021  protein of unknown function DUF35  33.77 
 
 		 481 aa  47.4  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.605764  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2015  hypothetical protein  23.73 
 
 		 136 aa  47  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.196649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3906  hypothetical protein  29.49 
 
 		 143 aa  46.6  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0256992  normal  0.0925623 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1925  protein of unknown function DUF35  31.19 
 
 		 474 aa  46.6  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5554  hypothetical protein  23.97 
 
 		 157 aa  47  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5220  hypothetical protein  28.3 
 
 		 330 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.146278  normal  0.27671 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1538  hypothetical protein  32.88 
 
 		 332 aa  47  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1501  hypothetical protein  26 
 
 		 133 aa  46.6  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2840  protein of unknown function DUF35  29.03 
 
 		 132 aa  46.6  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00189293  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1009  hypothetical protein  27.88 
 
 		 97 aa  47  0.0002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00901236 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>