168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4265 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_4265  hypothetical protein  100 
 
 
146 aa  303  5.0000000000000004e-82  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.16799  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5254  hypothetical protein  37.12 
 
 
133 aa  113  8.999999999999998e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4493  hypothetical protein  40 
 
 
148 aa  105  3e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0235  hypothetical protein  35.61 
 
 
136 aa  100  6e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.737012  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2138  hypothetical protein  33.08 
 
 
321 aa  96.7  1e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0351  hypothetical protein  38.52 
 
 
141 aa  95.5  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000546433  hitchhiker  0.00000644081 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3482  protein of unknown function DUF35  36.92 
 
 
319 aa  93.6  8e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.893274  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1602  hypothetical protein  28.12 
 
 
143 aa  90.1  9e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5301  hypothetical protein  34.81 
 
 
143 aa  89.4  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.653983 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2101  hypothetical protein  36.96 
 
 
139 aa  87.4  5e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.416637  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3828  hypothetical protein  35 
 
 
132 aa  86.7  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0616  hypothetical protein  34.35 
 
 
176 aa  84  6e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.11399  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5500  hypothetical protein  32.26 
 
 
132 aa  83.6  7e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4566  putative thiolase subunit  34.17 
 
 
132 aa  83.2  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00449482  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2010  hypothetical protein  29.1 
 
 
137 aa  83.2  0.000000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.392361  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0510  hypothetical protein  33.85 
 
 
143 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3806  hypothetical protein  33.59 
 
 
132 aa  82.4  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1880  hypothetical protein  29.13 
 
 
137 aa  81.3  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0682045 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1979  protein of unknown function DUF35  28.35 
 
 
137 aa  81.3  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0353441  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2152  hypothetical protein  34.11 
 
 
311 aa  80.9  0.000000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3214  hypothetical protein  34.13 
 
 
145 aa  79.7  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.907218  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3276  hypothetical protein  34.13 
 
 
145 aa  79.7  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2932  hypothetical protein  29.92 
 
 
137 aa  79.7  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.241273  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3225  hypothetical protein  34.13 
 
 
145 aa  79.7  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.730825  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4786  hypothetical protein  33.33 
 
 
144 aa  79  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.259655  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0860  hypothetical protein  30.23 
 
 
138 aa  78.2  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0582  hypothetical protein  36.43 
 
 
137 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00877368  normal  0.438267 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0899  hypothetical protein  32.5 
 
 
131 aa  77.4  0.00000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.312493  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3114  hypothetical protein  27.78 
 
 
130 aa  77  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0274298  normal  0.392807 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3652  hypothetical protein  35.04 
 
 
136 aa  76.6  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.92305  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3587  hypothetical protein  26.77 
 
 
137 aa  75.5  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.400148 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2821  hypothetical protein  33.86 
 
 
315 aa  75.9  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.875118  normal  0.0237416 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1804  hypothetical protein  29.1 
 
 
140 aa  75.9  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.983 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3318  hypothetical protein  32.59 
 
 
312 aa  75.5  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000206651 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1903  hypothetical protein  34.62 
 
 
132 aa  75.1  0.0000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.539737  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4153  hypothetical protein  31.45 
 
 
132 aa  74.7  0.0000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.280027  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1972  nucleic-acid-binding protein containing a Zn-ribbon-like protein  34.21 
 
 
150 aa  74.3  0.0000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4045  hypothetical protein  28.45 
 
 
141 aa  73.6  0.0000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.589309 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3402  hypothetical protein  35.38 
 
 
136 aa  73.6  0.0000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0631046 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4412  hypothetical protein  33.59 
 
 
132 aa  73.2  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000585754  normal  0.649702 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5644  hypothetical protein  30.23 
 
 
152 aa  72.8  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2351  hypothetical protein  26.19 
 
 
130 aa  72.4  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.387375  normal  0.674763 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5453  hypothetical protein  30.23 
 
 
152 aa  72.4  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0654575  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5850  hypothetical protein  30.23 
 
 
152 aa  72.4  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0806522  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2337  protein of unknown function DUF35  33.59 
 
 
149 aa  72.4  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4054  hypothetical protein  32.03 
 
 
151 aa  71.6  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0163629  normal  0.53534 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2788  hypothetical protein  31.3 
 
 
132 aa  70.9  0.000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.159844  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2378  hypothetical protein  26.81 
 
 
143 aa  70.1  0.000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.301734  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0859  hypothetical protein  27.59 
 
 
132 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0302426  normal  0.401608 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5112  hypothetical protein  34.17 
 
 
132 aa  69.7  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000923569  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0892  hypothetical protein  30.65 
 
 
142 aa  70.1  0.00000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.204366  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1671  hypothetical protein  29.46 
 
 
152 aa  69.7  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1695  hypothetical protein  29.46 
 
 
152 aa  69.7  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0530  hypothetical protein  29.46 
 
 
152 aa  69.7  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1644  hypothetical protein  29.46 
 
 
152 aa  69.7  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.982412  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0553  hypothetical protein  29.46 
 
 
152 aa  69.7  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0635  hypothetical protein  29.46 
 
 
152 aa  69.7  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.525049  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3606  protein of unknown function DUF35  25.4 
 
 
130 aa  69.3  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.215549  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4268  hypothetical protein  28.24 
 
 
140 aa  68.9  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.450465 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3311  hypothetical protein  30.3 
 
 
135 aa  69.3  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.367067 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1687  hypothetical protein  26.15 
 
 
137 aa  68.6  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0475632  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5278  hypothetical protein  38 
 
 
135 aa  68.2  0.00000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2745  nucleic-acid-binding protein containing a Zn-ribbon  25.2 
 
 
135 aa  67.8  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0775897 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8196  hypothetical protein  28.68 
 
 
319 aa  68.2  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2934  hypothetical protein  33.9 
 
 
144 aa  68.2  0.00000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.431872  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5005  hypothetical protein  26.02 
 
 
129 aa  67.8  0.00000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.264526  normal  0.0828633 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1994  hypothetical protein  33.64 
 
 
120 aa  67.8  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.253194  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5775  protein of unknown function DUF35  37.61 
 
 
129 aa  67.4  0.00000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0423668  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0905  hypothetical protein  31.25 
 
 
135 aa  67  0.00000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00718711  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0843  hypothetical protein  33.96 
 
 
145 aa  67  0.00000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4017  hypothetical protein  28.85 
 
 
155 aa  67  0.00000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.188869  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0042  hypothetical protein  27.27 
 
 
138 aa  66.2  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0051  hypothetical protein  27.27 
 
 
138 aa  66.2  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0173713  normal  0.0421472 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0032  hypothetical protein  27.27 
 
 
138 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.662095  normal  0.14279 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0128  hypothetical protein  39.13 
 
 
127 aa  65.5  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0146  protein of unknown function DUF35  39.13 
 
 
127 aa  65.9  0.0000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1501  hypothetical protein  28.93 
 
 
133 aa  65.5  0.0000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3511  hypothetical protein  39.33 
 
 
131 aa  65.1  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1497  protein of unknown function DUF35  33.64 
 
 
417 aa  65.5  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2675  hypothetical protein  33.64 
 
 
417 aa  65.1  0.0000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2483  hypothetical protein  28.99 
 
 
548 aa  63.9  0.0000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.207424 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0178  hypothetical protein  38.46 
 
 
134 aa  63.9  0.0000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.82614  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3932  protein of unknown function DUF35  35.64 
 
 
144 aa  63.5  0.0000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7489  hypothetical protein  28.83 
 
 
139 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.840415  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1758  hypothetical protein  24.59 
 
 
130 aa  63.5  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.799098  normal  0.109738 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2623  hypothetical protein  33.94 
 
 
305 aa  62  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.140164  normal  0.486862 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4323  hypothetical protein  31.93 
 
 
541 aa  62.4  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.51495 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2360  hypothetical protein  33.87 
 
 
131 aa  61.6  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.116484 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4171  hypothetical protein  27.94 
 
 
548 aa  61.6  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3692  hypothetical protein  29.01 
 
 
550 aa  61.2  0.000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3765  hypothetical protein  29.01 
 
 
550 aa  61.2  0.000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.981168 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2094  hypothetical protein  28 
 
 
128 aa  61.2  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3705  hypothetical protein  29.01 
 
 
550 aa  60.5  0.000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.724372  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1392  hypothetical protein  32.71 
 
 
152 aa  59.7  0.00000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4179  hypothetical protein  31.52 
 
 
145 aa  59.3  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1832  hypothetical protein  28.21 
 
 
138 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0184205  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8760  protein of unknown function DUF35  32.22 
 
 
140 aa  58.9  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.108371 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5539  hypothetical protein  26.36 
 
 
141 aa  59.3  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2662  hypothetical protein  28.57 
 
 
136 aa  58.9  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4072  hypothetical protein  26.98 
 
 
142 aa  59.3  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>