97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B2366 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B2366  hypothetical protein  100 
 
 		 152 aa  311  1.9999999999999998e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.206302  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3541  hypothetical protein  72 
 
 		 156 aa  230  6e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0915855 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5554  hypothetical protein  66.23 
 
 		 157 aa  214  2.9999999999999998e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1972  nucleic-acid-binding protein containing a Zn-ribbon-like protein  60.26 
 
 		 150 aa  189  9e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1027  hypothetical protein  56.64 
 
 		 175 aa  177  4.999999999999999e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3652  hypothetical protein  41.13 
 
 		 136 aa  97.4  7e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.92305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1804  hypothetical protein  37.61 
 
 		 140 aa  89  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.983 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0616  hypothetical protein  38.1 
 
 		 176 aa  84  6e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.11399  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5301  hypothetical protein  34.11 
 
 		 143 aa  81.3  0.000000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.653983 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5254  hypothetical protein  31.58 
 
 		 133 aa  77.8  0.00000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0859  hypothetical protein  27.69 
 
 		 132 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0302426  normal  0.401608 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2101  hypothetical protein  33.6 
 
 		 139 aa  71.6  0.000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.416637  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5453  hypothetical protein  32.26 
 
 		 152 aa  70.9  0.000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0654575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5850  hypothetical protein  32.26 
 
 		 152 aa  70.9  0.000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0806522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5644  hypothetical protein  32.52 
 
 		 152 aa  70.1  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2337  protein of unknown function DUF35  34.55 
 
 		 149 aa  68.9  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0635  hypothetical protein  30.89 
 
 		 152 aa  68.6  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.525049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1671  hypothetical protein  30.89 
 
 		 152 aa  68.6  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0553  hypothetical protein  30.89 
 
 		 152 aa  68.6  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1695  hypothetical protein  30.89 
 
 		 152 aa  68.6  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0530  hypothetical protein  30.89 
 
 		 152 aa  68.6  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1644  hypothetical protein  30.89 
 
 		 152 aa  68.6  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.982412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4493  hypothetical protein  26.4 
 
 		 148 aa  65.9  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1903  hypothetical protein  31.5 
 
 		 132 aa  65.5  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.539737  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8760  protein of unknown function DUF35  33.86 
 
 		 140 aa  62.8  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.108371 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2152  hypothetical protein  25.42 
 
 		 311 aa  62.4  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3482  protein of unknown function DUF35  33.93 
 
 		 319 aa  61.2  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.893274  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2094  hypothetical protein  38.93 
 
 		 128 aa  61.2  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8196  hypothetical protein  31.68 
 
 		 319 aa  60.5  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0582  hypothetical protein  30.65 
 
 		 137 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00877368  normal  0.438267 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0235  hypothetical protein  33.82 
 
 		 136 aa  58.9  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.737012  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0902  hypothetical protein  31.65 
 
 		 140 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3225  hypothetical protein  30.88 
 
 		 145 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.730825  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3214  hypothetical protein  30.88 
 
 		 145 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.907218  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3276  hypothetical protein  30.88 
 
 		 145 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4179  hypothetical protein  29.79 
 
 		 145 aa  57  0.00000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2788  hypothetical protein  28.24 
 
 		 132 aa  57  0.00000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.159844  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0905  hypothetical protein  31.03 
 
 		 135 aa  56.6  0.0000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00718711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2138  hypothetical protein  31.43 
 
 		 321 aa  55.8  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0843  hypothetical protein  31.36 
 
 		 145 aa  55.5  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6833  hypothetical protein  36.08 
 
 		 121 aa  54.3  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4017  hypothetical protein  29.41 
 
 		 155 aa  53.9  0.0000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.188869  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0351  hypothetical protein  31.25 
 
 		 141 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000546433  hitchhiker  0.00000644081 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1602  hypothetical protein  23.33 
 
 		 143 aa  53.9  0.0000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0860  hypothetical protein  31.2 
 
 		 138 aa  53.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2934  hypothetical protein  31.09 
 
 		 144 aa  52.4  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.431872  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4265  hypothetical protein  28.21 
 
 		 146 aa  52.4  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.16799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4045  hypothetical protein  25.58 
 
 		 141 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.589309 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2745  nucleic-acid-binding protein containing a Zn-ribbon  27.78 
 
 		 135 aa  51.6  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0775897 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2010  hypothetical protein  26.36 
 
 		 137 aa  51.6  0.000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.392361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3311  hypothetical protein  27.69 
 
 		 135 aa  51.2  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.367067 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2662  hypothetical protein  28.7 
 
 		 136 aa  50.4  0.000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1758  hypothetical protein  30 
 
 		 130 aa  49.7  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.799098  normal  0.109738 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3600  hypothetical protein  27.27 
 
 		 140 aa  49.7  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0665674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2821  hypothetical protein  35.71 
 
 		 315 aa  50.1  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.875118  normal  0.0237416 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5281  hypothetical protein  31.78 
 
 		 146 aa  49.3  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2623  hypothetical protein  36.21 
 
 		 305 aa  49.7  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.140164  normal  0.486862 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2932  hypothetical protein  26.56 
 
 		 137 aa  48.5  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.241273  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1832  hypothetical protein  30.09 
 
 		 138 aa  48.9  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0184205  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7489  hypothetical protein  25 
 
 		 139 aa  48.5  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.840415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2378  hypothetical protein  28.46 
 
 		 143 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.301734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2483  hypothetical protein  25.45 
 
 		 548 aa  48.5  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.207424 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1687  hypothetical protein  27.27 
 
 		 137 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0475632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4268  hypothetical protein  26.45 
 
 		 140 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.450465 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4171  hypothetical protein  24.79 
 
 		 548 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3606  protein of unknown function DUF35  25.64 
 
 		 130 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.215549  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0032  hypothetical protein  27.64 
 
 		 138 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.662095  normal  0.14279 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5005  hypothetical protein  24.03 
 
 		 129 aa  47.4  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.264526  normal  0.0828633 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3692  hypothetical protein  25.62 
 
 		 550 aa  47.4  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3765  hypothetical protein  25.62 
 
 		 550 aa  47.4  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.981168 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2015  hypothetical protein  33.64 
 
 		 136 aa  47.4  0.00007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.196649  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0042  hypothetical protein  27.64 
 
 		 138 aa  47  0.00008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4323  hypothetical protein  28.23 
 
 		 541 aa  47  0.00008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.51495 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0051  hypothetical protein  27.64 
 
 		 138 aa  47  0.00008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0173713  normal  0.0421472 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0458  hypothetical protein  28.92 
 
 		 182 aa  46.6  0.0001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4054  hypothetical protein  24.56 
 
 		 151 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0163629  normal  0.53534 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1979  protein of unknown function DUF35  26.02 
 
 		 137 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0353441  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0397  hypothetical protein  25.62 
 
 		 177 aa  45.8  0.0002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3587  hypothetical protein  26.02 
 
 		 137 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.400148 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1880  hypothetical protein  26.83 
 
 		 137 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0682045 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4633  hypothetical protein  23.26 
 
 		 153 aa  45.1  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3705  hypothetical protein  24.79 
 
 		 550 aa  45.1  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.724372  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3114  hypothetical protein  26.02 
 
 		 130 aa  45.1  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0274298  normal  0.392807 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1438  3-hydroxybutyryl-CoA epimerase  30.14 
 
 		 576 aa  44.3  0.0006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.410853  normal  0.0151032 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0836  hypothetical protein  27.71 
 
 		 189 aa  43.9  0.0009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3806  hypothetical protein  26.61 
 
 		 132 aa  43.5  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0899  hypothetical protein  24.14 
 
 		 131 aa  43.5  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.312493  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2351  hypothetical protein  25.2 
 
 		 130 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.387375  normal  0.674763 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13575  hypothetical protein  28.15 
 
 		 311 aa  43.1  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000328171 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0674  protein of unknown function DUF35  25.83 
 
 		 178 aa  42  0.003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0510  hypothetical protein  28.57 
 
 		 143 aa  41.2  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4412  hypothetical protein  26.72 
 
 		 132 aa  41.2  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000585754  normal  0.649702 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0387  hypothetical protein  27.78 
 
 		 129 aa  40.8  0.006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.448785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1994  hypothetical protein  25.71 
 
 		 120 aa  40.4  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.253194  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4786  hypothetical protein  26.45 
 
 		 144 aa  40.4  0.008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.259655  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5539  hypothetical protein  21.67 
 
 		 141 aa  40.4  0.009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4020  hypothetical protein  32.08 
 
 		 141 aa  40.4  0.009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.909625 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>