142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0387 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_0387  hypothetical protein  100 
 
 		 129 aa  266  7e-71  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.448785  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0436  protein of unknown function DUF35  51.18 
 
 		 128 aa  154  3e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.686015  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0674  protein of unknown function DUF35  44.14 
 
 		 178 aa  114  6.9999999999999995e-25  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1438  3-hydroxybutyryl-CoA epimerase  44.66 
 
 		 576 aa  110  5e-24  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.410853  normal  0.0151032 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1310  hypothetical protein  44.23 
 
 		 151 aa  107  4.0000000000000004e-23  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.120998 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0397  hypothetical protein  44.74 
 
 		 177 aa  105  2e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0836  hypothetical protein  39.81 
 
 		 189 aa  103  1e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0458  hypothetical protein  39.81 
 
 		 182 aa  100  6e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0377  hypothetical protein  37.08 
 
 		 130 aa  65.5  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.253705  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1459  hypothetical protein  35.96 
 
 		 130 aa  65.1  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0023  hypothetical protein  38.16 
 
 		 130 aa  64.7  0.0000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2932  hypothetical protein  29.13 
 
 		 137 aa  64.3  0.0000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.241273  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0549  hypothetical protein  28.57 
 
 		 132 aa  63.5  0.0000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0859  hypothetical protein  31.03 
 
 		 132 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0302426  normal  0.401608 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0460  hypothetical protein  36.47 
 
 		 130 aa  63.5  0.000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0490887  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0340  protein of unknown function DUF35  32.67 
 
 		 134 aa  62.4  0.000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.0000262786  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5254  hypothetical protein  26.79 
 
 		 133 aa  61.2  0.000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2010  hypothetical protein  28.85 
 
 		 137 aa  60.5  0.000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.392361  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3600  hypothetical protein  28.09 
 
 		 140 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0665674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0510  hypothetical protein  34.94 
 
 		 143 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1934  hypothetical protein  32.08 
 
 		 133 aa  59.3  0.00000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0108502  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2934  hypothetical protein  28.26 
 
 		 144 aa  59.3  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.431872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4493  hypothetical protein  30.61 
 
 		 148 aa  58.5  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1979  protein of unknown function DUF35  27.55 
 
 		 137 aa  58.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0353441  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0528  hypothetical protein  32.94 
 
 		 129 aa  58.5  0.00000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.825077  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5278  hypothetical protein  29.09 
 
 		 135 aa  58.2  0.00000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0766  hypothetical protein  35.21 
 
 		 135 aa  57.8  0.00000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.48862  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1609  protein of unknown function DUF35  29.47 
 
 		 133 aa  56.6  0.0000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1687  hypothetical protein  25.24 
 
 		 137 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0475632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1241  hypothetical protein  36.49 
 
 		 137 aa  55.8  0.0000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0148077  normal  0.0127741 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3652  hypothetical protein  28.23 
 
 		 136 aa  55.8  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.92305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3932  protein of unknown function DUF35  26.14 
 
 		 144 aa  55.5  0.0000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5539  hypothetical protein  33.33 
 
 		 141 aa  54.7  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2784  protein of unknown function DUF35  25.45 
 
 		 144 aa  54.3  0.0000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0211194  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0268  hypothetical protein  28.83 
 
 		 141 aa  54.3  0.0000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00125281  normal  0.120379 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3587  hypothetical protein  25.51 
 
 		 137 aa  53.9  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.400148 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1671  hypothetical protein  27.45 
 
 		 152 aa  53.9  0.0000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1695  hypothetical protein  27.45 
 
 		 152 aa  53.9  0.0000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0530  hypothetical protein  27.45 
 
 		 152 aa  53.9  0.0000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1644  hypothetical protein  27.45 
 
 		 152 aa  53.9  0.0000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.982412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0553  hypothetical protein  27.45 
 
 		 152 aa  53.9  0.0000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0635  hypothetical protein  27.45 
 
 		 152 aa  53.9  0.0000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.525049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2363  hypothetical protein  29.55 
 
 		 130 aa  53.5  0.0000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1357  hypothetical protein  32.98 
 
 		 132 aa  53.5  0.000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0155  hypothetical protein  29.67 
 
 		 130 aa  53.5  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5281  hypothetical protein  27.66 
 
 		 146 aa  53.1  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3090  protein of unknown function DUF35  31.96 
 
 		 335 aa  52.8  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.736409  normal  0.697465 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2152  hypothetical protein  24.81 
 
 		 311 aa  53.1  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1880  hypothetical protein  25.51 
 
 		 137 aa  53.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0682045 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1083  hypothetical protein  36 
 
 		 134 aa  52.8  0.000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1758  hypothetical protein  27.88 
 
 		 130 aa  53.5  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.799098  normal  0.109738 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1648  hypothetical protein  32.88 
 
 		 135 aa  53.5  0.000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1832  hypothetical protein  27.66 
 
 		 138 aa  52.8  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0184205  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6630  hypothetical protein  31.46 
 
 		 120 aa  52.4  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0233518  normal  0.987358 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1625  hypothetical protein  26.42 
 
 		 130 aa  52.4  0.000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3311  hypothetical protein  32.04 
 
 		 135 aa  52.8  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.367067 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0794  hypothetical protein  29.79 
 
 		 133 aa  52.4  0.000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0812  hypothetical protein  34.67 
 
 		 134 aa  52  0.000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.553396  hitchhiker  0.000113363 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8196  hypothetical protein  33.33 
 
 		 319 aa  52  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2783  protein of unknown function DUF35  29.49 
 
 		 165 aa  51.2  0.000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.103009  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2745  nucleic-acid-binding protein containing a Zn-ribbon  27.38 
 
 		 135 aa  50.8  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0775897 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0235  hypothetical protein  21 
 
 		 136 aa  51.2  0.000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.737012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4045  hypothetical protein  26.88 
 
 		 141 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.589309 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4054  hypothetical protein  29.73 
 
 		 151 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0163629  normal  0.53534 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7489  hypothetical protein  23.42 
 
 		 139 aa  50.8  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.840415  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5453  hypothetical protein  27.72 
 
 		 152 aa  50.4  0.000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0654575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5850  hypothetical protein  27.72 
 
 		 152 aa  50.4  0.000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0806522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4072  hypothetical protein  35.23 
 
 		 142 aa  50.4  0.000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0351  hypothetical protein  28.12 
 
 		 141 aa  49.7  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000546433  hitchhiker  0.00000644081 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4179  hypothetical protein  25.3 
 
 		 145 aa  50.1  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2508  protein of unknown function DUF35  24.18 
 
 		 132 aa  49.7  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.347955  normal  0.395372 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0598  protein of unknown function DUF35  29.76 
 
 		 127 aa  50.1  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1602  hypothetical protein  19.49 
 
 		 143 aa  48.9  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1392  hypothetical protein  26.37 
 
 		 152 aa  49.3  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5644  hypothetical protein  25 
 
 		 152 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4017  hypothetical protein  28.42 
 
 		 155 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.188869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0269  hypothetical protein  29.49 
 
 		 165 aa  48.9  0.00002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000709024  normal  0.121609 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3606  protein of unknown function DUF35  23.16 
 
 		 130 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.215549  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1497  protein of unknown function DUF35  32.88 
 
 		 417 aa  48.1  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5005  hypothetical protein  25.53 
 
 		 129 aa  48.1  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.264526  normal  0.0828633 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3806  hypothetical protein  25.24 
 
 		 132 aa  47.8  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2138  hypothetical protein  29.07 
 
 		 321 aa  47.8  0.00005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1630  hypothetical protein  28.21 
 
 		 128 aa  47.8  0.00006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3541  hypothetical protein  25 
 
 		 156 aa  47  0.00009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0915855 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0892  hypothetical protein  26.53 
 
 		 142 aa  47  0.00009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.204366  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0060  protein of unknown function DUF35  29.33 
 
 		 136 aa  46.6  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1485  hypothetical protein  28.21 
 
 		 134 aa  46.2  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.208143  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0149  hypothetical protein  25 
 
 		 129 aa  45.4  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0582  hypothetical protein  24.49 
 
 		 137 aa  45.4  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00877368  normal  0.438267 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3114  hypothetical protein  22.11 
 
 		 130 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0274298  normal  0.392807 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0905  hypothetical protein  26.32 
 
 		 135 aa  45.8  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00718711  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5301  hypothetical protein  24.53 
 
 		 143 aa  45.4  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.653983 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2675  hypothetical protein  31.51 
 
 		 417 aa  45.8  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0178  hypothetical protein  27.27 
 
 		 134 aa  45.1  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.82614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2788  hypothetical protein  28.4 
 
 		 132 aa  45.4  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.159844  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2094  hypothetical protein  27.06 
 
 		 128 aa  45.4  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2351  hypothetical protein  21.05 
 
 		 130 aa  44.7  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.387375  normal  0.674763 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0843  hypothetical protein  23.96 
 
 		 145 aa  44.7  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2732  hypothetical protein  28.57 
 
 		 319 aa  44.7  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1972  nucleic-acid-binding protein containing a Zn-ribbon-like protein  29.63 
 
 		 150 aa  44.7  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>