80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1027 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_1027  hypothetical protein  100 
 
 		 175 aa  357  4e-98  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2366  hypothetical protein  56.64 
 
 		 152 aa  177  8e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.206302  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3541  hypothetical protein  55.03 
 
 		 156 aa  174  7e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0915855 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1972  nucleic-acid-binding protein containing a Zn-ribbon-like protein  53.06 
 
 		 150 aa  167  6e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5554  hypothetical protein  50 
 
 		 157 aa  152  2e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3652  hypothetical protein  34.15 
 
 		 136 aa  81.6  0.000000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.92305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0860  hypothetical protein  36.76 
 
 		 138 aa  70.1  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2101  hypothetical protein  31.3 
 
 		 139 aa  68.9  0.00000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.416637  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5301  hypothetical protein  29.09 
 
 		 143 aa  68.6  0.00000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.653983 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0859  hypothetical protein  25.6 
 
 		 132 aa  67.8  0.00000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0302426  normal  0.401608 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5254  hypothetical protein  27.94 
 
 		 133 aa  65.9  0.0000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1804  hypothetical protein  31.25 
 
 		 140 aa  63.9  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.983 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6833  hypothetical protein  38.14 
 
 		 121 aa  61.2  0.000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2378  hypothetical protein  31.36 
 
 		 143 aa  60.8  0.000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.301734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4493  hypothetical protein  25 
 
 		 148 aa  60.5  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4268  hypothetical protein  31.36 
 
 		 140 aa  59.7  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.450465 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0032  hypothetical protein  27.64 
 
 		 138 aa  59.3  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.662095  normal  0.14279 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0042  hypothetical protein  28.46 
 
 		 138 aa  59.3  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0051  hypothetical protein  28.46 
 
 		 138 aa  59.3  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0173713  normal  0.0421472 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2152  hypothetical protein  25.62 
 
 		 311 aa  56.2  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0616  hypothetical protein  29.27 
 
 		 176 aa  55.5  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.11399  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1903  hypothetical protein  30.83 
 
 		 132 aa  55.1  0.0000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.539737  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0582  hypothetical protein  31.62 
 
 		 137 aa  54.3  0.0000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00877368  normal  0.438267 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4323  hypothetical protein  31.45 
 
 		 541 aa  54.3  0.0000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.51495 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5281  hypothetical protein  31.53 
 
 		 146 aa  53.5  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0902  hypothetical protein  29.51 
 
 		 140 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0351  hypothetical protein  28.04 
 
 		 141 aa  53.1  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000546433  hitchhiker  0.00000644081 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1687  hypothetical protein  29.84 
 
 		 137 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0475632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8760  protein of unknown function DUF35  29.66 
 
 		 140 aa  52.4  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.108371 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8196  hypothetical protein  27.27 
 
 		 319 aa  52.4  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1979  protein of unknown function DUF35  29.03 
 
 		 137 aa  52.4  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0353441  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0235  hypothetical protein  29.84 
 
 		 136 aa  52.4  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.737012  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2934  hypothetical protein  29.66 
 
 		 144 aa  51.6  0.000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.431872  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5644  hypothetical protein  26.47 
 
 		 152 aa  51.6  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2138  hypothetical protein  29.01 
 
 		 321 aa  51.2  0.000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5850  hypothetical protein  25.4 
 
 		 152 aa  50.4  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0806522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5453  hypothetical protein  25.4 
 
 		 152 aa  50.4  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0654575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1602  hypothetical protein  23.66 
 
 		 143 aa  50.4  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5255  hypothetical protein  34.13 
 
 		 324 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.338508 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1758  hypothetical protein  31.36 
 
 		 130 aa  48.5  0.00005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.799098  normal  0.109738 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3482  protein of unknown function DUF35  31.07 
 
 		 319 aa  48.5  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.893274  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0843  hypothetical protein  27.97 
 
 		 145 aa  48.1  0.00006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2932  hypothetical protein  27.43 
 
 		 137 aa  48.1  0.00007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.241273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1644  hypothetical protein  25.4 
 
 		 152 aa  47.8  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.982412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0635  hypothetical protein  25.4 
 
 		 152 aa  47.8  0.00007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.525049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0553  hypothetical protein  25.4 
 
 		 152 aa  47.8  0.00007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5059  hypothetical protein  31.2 
 
 		 317 aa  48.1  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.945383  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1695  hypothetical protein  25.4 
 
 		 152 aa  47.8  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1671  hypothetical protein  25.4 
 
 		 152 aa  47.8  0.00007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0530  hypothetical protein  25.4 
 
 		 152 aa  47.8  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2337  protein of unknown function DUF35  27.78 
 
 		 149 aa  47.4  0.00009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4674  hypothetical protein  31.2 
 
 		 318 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2010  hypothetical protein  27.78 
 
 		 137 aa  47  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.392361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3311  hypothetical protein  28.12 
 
 		 135 aa  47  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.367067 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4760  hypothetical protein  31.2 
 
 		 318 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.247642  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3600  hypothetical protein  29.46 
 
 		 140 aa  46.2  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0665674  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4265  hypothetical protein  24.82 
 
 		 146 aa  46.2  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.16799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13575  hypothetical protein  28.99 
 
 		 311 aa  45.4  0.0004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000328171 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4045  hypothetical protein  27.64 
 
 		 141 aa  45.4  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.589309 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3318  hypothetical protein  29.52 
 
 		 312 aa  44.7  0.0007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000206651 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5539  hypothetical protein  30.69 
 
 		 141 aa  44.7  0.0007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0060  protein of unknown function DUF35  26.5 
 
 		 136 aa  43.9  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0899  hypothetical protein  25.89 
 
 		 131 aa  43.5  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.312493  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6844  hypothetical protein  30.09 
 
 		 121 aa  43.9  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2821  hypothetical protein  29.84 
 
 		 315 aa  43.9  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.875118  normal  0.0237416 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2788  hypothetical protein  23.74 
 
 		 132 aa  44.3  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.159844  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2015  hypothetical protein  28.32 
 
 		 136 aa  43.5  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.196649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1310  hypothetical protein  27.93 
 
 		 151 aa  43.5  0.001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.120998 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1832  hypothetical protein  27.1 
 
 		 138 aa  44.3  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0184205  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0885  protein of unknown function DUF35  31.2 
 
 		 333 aa  43.1  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4054  hypothetical protein  25.23 
 
 		 151 aa  43.1  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0163629  normal  0.53534 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3276  hypothetical protein  30 
 
 		 145 aa  42.4  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3225  hypothetical protein  30 
 
 		 145 aa  42.4  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.730825  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3214  hypothetical protein  30 
 
 		 145 aa  42.4  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.907218  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4171  hypothetical protein  25.89 
 
 		 548 aa  42  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4179  hypothetical protein  28.72 
 
 		 145 aa  42  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1511  hypothetical protein  28.69 
 
 		 317 aa  42  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0892  hypothetical protein  27.18 
 
 		 142 aa  41.6  0.006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.204366  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4020  hypothetical protein  31.73 
 
 		 141 aa  40.8  0.01  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.909625 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2483  hypothetical protein  25.4 
 
 		 548 aa  40.8  0.01  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.207424 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>