103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_5554 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_5554  hypothetical protein  100 
 
 		 157 aa  322  1e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3541  hypothetical protein  70 
 
 		 156 aa  230  6e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0915855 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2366  hypothetical protein  66.23 
 
 		 152 aa  214  2.9999999999999998e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.206302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1972  nucleic-acid-binding protein containing a Zn-ribbon-like protein  65.03 
 
 		 150 aa  194  5.000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1027  hypothetical protein  50 
 
 		 175 aa  152  1e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3652  hypothetical protein  35.07 
 
 		 136 aa  86.7  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.92305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5301  hypothetical protein  35.16 
 
 		 143 aa  82  0.000000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.653983 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1804  hypothetical protein  36.89 
 
 		 140 aa  79.7  0.00000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.983 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2101  hypothetical protein  35.11 
 
 		 139 aa  75.1  0.0000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.416637  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0616  hypothetical protein  34.33 
 
 		 176 aa  73.6  0.0000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.11399  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0859  hypothetical protein  29.82 
 
 		 132 aa  67.4  0.00000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0302426  normal  0.401608 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5254  hypothetical protein  29.32 
 
 		 133 aa  66.6  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5281  hypothetical protein  34.23 
 
 		 146 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0458  hypothetical protein  34.94 
 
 		 182 aa  62  0.000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2152  hypothetical protein  27.5 
 
 		 311 aa  62  0.000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0582  hypothetical protein  30.77 
 
 		 137 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00877368  normal  0.438267 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2337  protein of unknown function DUF35  29.46 
 
 		 149 aa  60.5  0.000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3311  hypothetical protein  30.53 
 
 		 135 aa  60.5  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.367067 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1602  hypothetical protein  26.83 
 
 		 143 aa  59.7  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4493  hypothetical protein  25.98 
 
 		 148 aa  58.9  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3600  hypothetical protein  32.71 
 
 		 140 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0665674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4045  hypothetical protein  29.41 
 
 		 141 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.589309 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0860  hypothetical protein  29.63 
 
 		 138 aa  57.4  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3806  hypothetical protein  30.15 
 
 		 132 aa  57  0.00000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5644  hypothetical protein  29 
 
 		 152 aa  57  0.00000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4265  hypothetical protein  28.93 
 
 		 146 aa  57.4  0.00000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.16799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0836  hypothetical protein  32.53 
 
 		 189 aa  57  0.00000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0235  hypothetical protein  30.37 
 
 		 136 aa  56.2  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.737012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4017  hypothetical protein  30.88 
 
 		 155 aa  57  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.188869  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3828  hypothetical protein  32.81 
 
 		 132 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1438  3-hydroxybutyryl-CoA epimerase  30.86 
 
 		 576 aa  55.8  0.0000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.410853  normal  0.0151032 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1758  hypothetical protein  29.75 
 
 		 130 aa  56.2  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.799098  normal  0.109738 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0902  hypothetical protein  33.33 
 
 		 140 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2138  hypothetical protein  35.64 
 
 		 321 aa  54.3  0.0000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0351  hypothetical protein  29.37 
 
 		 141 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000546433  hitchhiker  0.00000644081 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3214  hypothetical protein  29.13 
 
 		 145 aa  54.3  0.0000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.907218  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3276  hypothetical protein  29.13 
 
 		 145 aa  54.3  0.0000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3225  hypothetical protein  29.13 
 
 		 145 aa  54.3  0.0000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.730825  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1903  hypothetical protein  28.33 
 
 		 132 aa  53.9  0.0000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.539737  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5453  hypothetical protein  27.07 
 
 		 152 aa  53.9  0.0000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0654575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5850  hypothetical protein  27.07 
 
 		 152 aa  53.9  0.0000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0806522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2934  hypothetical protein  34.44 
 
 		 144 aa  53.9  0.0000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.431872  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4153  hypothetical protein  29.46 
 
 		 132 aa  53.5  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.280027  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4566  putative thiolase subunit  30.99 
 
 		 132 aa  53.5  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00449482  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1671  hypothetical protein  27.07 
 
 		 152 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1695  hypothetical protein  27.07 
 
 		 152 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0530  hypothetical protein  27.07 
 
 		 152 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1644  hypothetical protein  27.07 
 
 		 152 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.982412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0553  hypothetical protein  27.07 
 
 		 152 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0635  hypothetical protein  27.07 
 
 		 152 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.525049  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4412  hypothetical protein  29.41 
 
 		 132 aa  52.8  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000585754  normal  0.649702 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0905  hypothetical protein  30.4 
 
 		 135 aa  53.1  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00718711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0843  hypothetical protein  29.06 
 
 		 145 aa  52.8  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4268  hypothetical protein  29.41 
 
 		 140 aa  52.4  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.450465 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5539  hypothetical protein  28.7 
 
 		 141 aa  51.6  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4179  hypothetical protein  28.72 
 
 		 145 aa  51.6  0.000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6833  hypothetical protein  33.98 
 
 		 121 aa  51.6  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3606  protein of unknown function DUF35  29.06 
 
 		 130 aa  51.2  0.000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.215549  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3482  protein of unknown function DUF35  32.31 
 
 		 319 aa  50.8  0.000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.893274  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8760  protein of unknown function DUF35  27.78 
 
 		 140 aa  50.8  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.108371 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2094  hypothetical protein  29.85 
 
 		 128 aa  50.8  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8196  hypothetical protein  29.2 
 
 		 319 aa  50.4  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3114  hypothetical protein  29.27 
 
 		 130 aa  50.4  0.000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0274298  normal  0.392807 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4054  hypothetical protein  27.12 
 
 		 151 aa  50.4  0.000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0163629  normal  0.53534 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5005  hypothetical protein  26.36 
 
 		 129 aa  50.1  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.264526  normal  0.0828633 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4786  hypothetical protein  27.5 
 
 		 144 aa  49.3  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.259655  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2788  hypothetical protein  28.18 
 
 		 132 aa  49.3  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.159844  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2378  hypothetical protein  29.41 
 
 		 143 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.301734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2351  hypothetical protein  28.46 
 
 		 130 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.387375  normal  0.674763 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2745  nucleic-acid-binding protein containing a Zn-ribbon  27.64 
 
 		 135 aa  48.9  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0775897 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0032  hypothetical protein  27.61 
 
 		 138 aa  48.9  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.662095  normal  0.14279 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4323  hypothetical protein  30 
 
 		 541 aa  48.5  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.51495 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0042  hypothetical protein  26.12 
 
 		 138 aa  48.1  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2662  hypothetical protein  25.66 
 
 		 136 aa  48.1  0.00005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0051  hypothetical protein  26.12 
 
 		 138 aa  48.1  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0173713  normal  0.0421472 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2483  hypothetical protein  27.42 
 
 		 548 aa  48.1  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.207424 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3973  hypothetical protein  28.57 
 
 		 125 aa  47.8  0.00006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.370228 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3932  protein of unknown function DUF35  28.97 
 
 		 144 aa  47.4  0.00009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4171  hypothetical protein  27.27 
 
 		 548 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4020  hypothetical protein  34.29 
 
 		 141 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.909625 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0397  hypothetical protein  23.97 
 
 		 177 aa  47  0.0001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1501  hypothetical protein  21.6 
 
 		 133 aa  46.2  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3705  hypothetical protein  25.4 
 
 		 550 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.724372  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1832  hypothetical protein  28.33 
 
 		 138 aa  44.7  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0184205  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3692  hypothetical protein  25.4 
 
 		 550 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3765  hypothetical protein  25.4 
 
 		 550 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.981168 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1497  protein of unknown function DUF35  31.4 
 
 		 417 aa  44.3  0.0006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2840  protein of unknown function DUF35  26.09 
 
 		 132 aa  44.3  0.0007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00189293  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0892  hypothetical protein  26.42 
 
 		 142 aa  43.9  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.204366  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3402  hypothetical protein  30 
 
 		 136 aa  43.5  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0631046 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2675  hypothetical protein  31.4 
 
 		 417 aa  42.7  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2932  hypothetical protein  27.47 
 
 		 137 aa  42.7  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.241273  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1994  hypothetical protein  25.71 
 
 		 120 aa  42.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.253194  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0674  protein of unknown function DUF35  25.98 
 
 		 178 aa  42  0.003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1485  hypothetical protein  31.82 
 
 		 134 aa  42  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.208143  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2010  hypothetical protein  27.88 
 
 		 137 aa  42  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.392361  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3885  hypothetical protein  24.77 
 
 		 117 aa  42  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7489  hypothetical protein  33.33 
 
 		 139 aa  41.6  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.840415  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0178  hypothetical protein  31.96 
 
 		 134 aa  41.6  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.82614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2015  hypothetical protein  31.13 
 
 		 136 aa  41.6  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.196649  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>