143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_0042 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_0042  hypothetical protein  100 
 
 		 138 aa  280  4.0000000000000003e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0051  hypothetical protein  100 
 
 		 138 aa  280  4.0000000000000003e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0173713  normal  0.0421472 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0032  hypothetical protein  97.83 
 
 		 138 aa  274  3e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.662095  normal  0.14279 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4268  hypothetical protein  85.71 
 
 		 140 aa  242  9.999999999999999e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.450465 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2378  hypothetical protein  84.44 
 
 		 143 aa  236  9e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.301734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2152  hypothetical protein  44.36 
 
 		 311 aa  118  1.9999999999999998e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5254  hypothetical protein  36.92 
 
 		 133 aa  103  5e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1602  hypothetical protein  33.33 
 
 		 143 aa  81.3  0.000000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0860  hypothetical protein  36.89 
 
 		 138 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2010  hypothetical protein  31.39 
 
 		 137 aa  77.4  0.00000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.392361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1804  hypothetical protein  35.4 
 
 		 140 aa  76.6  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.983 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1501  hypothetical protein  32.56 
 
 		 133 aa  76.6  0.0000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0843  hypothetical protein  35.07 
 
 		 145 aa  75.5  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4179  hypothetical protein  31.45 
 
 		 145 aa  75.5  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0899  hypothetical protein  32.58 
 
 		 131 aa  75.1  0.0000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.312493  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5301  hypothetical protein  30.65 
 
 		 143 aa  75.5  0.0000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.653983 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5278  hypothetical protein  34.15 
 
 		 135 aa  74.3  0.0000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2138  hypothetical protein  30.3 
 
 		 321 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6844  hypothetical protein  40 
 
 		 121 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2934  hypothetical protein  33.33 
 
 		 144 aa  72.8  0.000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.431872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4493  hypothetical protein  31.78 
 
 		 148 aa  72  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5005  hypothetical protein  30.43 
 
 		 129 aa  72.4  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.264526  normal  0.0828633 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4045  hypothetical protein  37.19 
 
 		 141 aa  72  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.589309 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0235  hypothetical protein  28.57 
 
 		 136 aa  71.2  0.000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.737012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1511  hypothetical protein  36.36 
 
 		 317 aa  70.5  0.000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5281  hypothetical protein  34.96 
 
 		 146 aa  68.9  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3587  hypothetical protein  31.06 
 
 		 137 aa  69.3  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.400148 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4674  hypothetical protein  35.07 
 
 		 318 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4760  hypothetical protein  35.07 
 
 		 318 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.247642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2337  protein of unknown function DUF35  35 
 
 		 149 aa  68.9  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5059  hypothetical protein  36.8 
 
 		 317 aa  68.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.945383  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1979  protein of unknown function DUF35  30.3 
 
 		 137 aa  68.2  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0353441  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1687  hypothetical protein  30.66 
 
 		 137 aa  68.2  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0475632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1880  hypothetical protein  30.3 
 
 		 137 aa  67.8  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0682045 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3606  protein of unknown function DUF35  32.17 
 
 		 130 aa  67.8  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.215549  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2101  hypothetical protein  29.91 
 
 		 139 aa  67.8  0.00000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.416637  normal  1 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6482  hypothetical protein  36.94 
 
 		 146 aa  66.2  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0582  hypothetical protein  33.06 
 
 		 137 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00877368  normal  0.438267 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4412  hypothetical protein  35.14 
 
 		 132 aa  66.2  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000585754  normal  0.649702 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4265  hypothetical protein  27.27 
 
 		 146 aa  66.2  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.16799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0343  hypothetical protein  40 
 
 		 119 aa  66.6  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.619973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3511  hypothetical protein  32.17 
 
 		 131 aa  65.5  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4786  hypothetical protein  32.46 
 
 		 144 aa  65.5  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.259655  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2662  hypothetical protein  31.62 
 
 		 136 aa  65.5  0.0000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2788  hypothetical protein  36.28 
 
 		 132 aa  65.5  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.159844  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5255  hypothetical protein  35.77 
 
 		 324 aa  65.5  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.338508 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1832  hypothetical protein  31.09 
 
 		 138 aa  65.1  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0184205  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3114  hypothetical protein  28.95 
 
 		 130 aa  65.1  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0274298  normal  0.392807 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2932  hypothetical protein  29.93 
 
 		 137 aa  64.7  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.241273  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5112  hypothetical protein  33.03 
 
 		 132 aa  64.3  0.0000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000923569  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0885  protein of unknown function DUF35  33.33 
 
 		 333 aa  64.3  0.0000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2351  hypothetical protein  28.07 
 
 		 130 aa  63.9  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.387375  normal  0.674763 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1758  hypothetical protein  30.17 
 
 		 130 aa  63.5  0.0000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.799098  normal  0.109738 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4153  hypothetical protein  32.26 
 
 		 132 aa  63.5  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.280027  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5775  protein of unknown function DUF35  37.08 
 
 		 129 aa  63.2  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0423668  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5644  hypothetical protein  29.41 
 
 		 152 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0859  hypothetical protein  28.21 
 
 		 132 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0302426  normal  0.401608 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5453  hypothetical protein  29.41 
 
 		 152 aa  62  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0654575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5850  hypothetical protein  29.41 
 
 		 152 aa  62  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0806522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2582  hypothetical protein  38.38 
 
 		 123 aa  62.8  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.709226  normal  0.0256768 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3482  protein of unknown function DUF35  33.61 
 
 		 319 aa  62.4  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.893274  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0510  hypothetical protein  32.79 
 
 		 143 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0128  hypothetical protein  37.36 
 
 		 127 aa  61.6  0.000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3806  hypothetical protein  31.45 
 
 		 132 aa  61.6  0.000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0146  protein of unknown function DUF35  37.36 
 
 		 127 aa  61.6  0.000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7489  hypothetical protein  31.82 
 
 		 139 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.840415  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1994  hypothetical protein  30.63 
 
 		 120 aa  60.5  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.253194  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3973  hypothetical protein  31.5 
 
 		 125 aa  60.5  0.000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.370228 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1671  hypothetical protein  27.45 
 
 		 152 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3214  hypothetical protein  28.57 
 
 		 145 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.907218  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1695  hypothetical protein  27.45 
 
 		 152 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3276  hypothetical protein  28.57 
 
 		 145 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0530  hypothetical protein  27.45 
 
 		 152 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1027  hypothetical protein  28.46 
 
 		 175 aa  59.3  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1644  hypothetical protein  27.45 
 
 		 152 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.982412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3225  hypothetical protein  28.57 
 
 		 145 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.730825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0553  hypothetical protein  27.45 
 
 		 152 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0635  hypothetical protein  27.45 
 
 		 152 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.525049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3402  hypothetical protein  32.2 
 
 		 136 aa  58.5  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0631046 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3652  hypothetical protein  30.08 
 
 		 136 aa  58.5  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.92305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1073  hypothetical protein  32.43 
 
 		 128 aa  57.8  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51200  hypothetical protein  33.62 
 
 		 128 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.719355  hitchhiker  0.00000582925 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5096  hypothetical protein  31.58 
 
 		 128 aa  57.8  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13575  hypothetical protein  32.82 
 
 		 311 aa  57  0.00000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000328171 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3828  hypothetical protein  28.57 
 
 		 132 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3600  hypothetical protein  29.09 
 
 		 140 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0665674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3311  hypothetical protein  32.09 
 
 		 135 aa  56.6  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.367067 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4369  hypothetical protein  36.45 
 
 		 127 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5500  hypothetical protein  30.65 
 
 		 132 aa  55.8  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1392  hypothetical protein  32.14 
 
 		 152 aa  55.8  0.0000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0616  hypothetical protein  32.26 
 
 		 176 aa  55.1  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.11399  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2840  protein of unknown function DUF35  28.8 
 
 		 132 aa  55.1  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00189293  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4566  putative thiolase subunit  28.57 
 
 		 132 aa  55.1  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00449482  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8760  protein of unknown function DUF35  27.87 
 
 		 140 aa  54.3  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.108371 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2508  protein of unknown function DUF35  31.09 
 
 		 132 aa  54.3  0.0000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.347955  normal  0.395372 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2745  nucleic-acid-binding protein containing a Zn-ribbon  25.71 
 
 		 135 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0775897 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0351  hypothetical protein  23.7 
 
 		 141 aa  52.8  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000546433  hitchhiker  0.00000644081 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2363  hypothetical protein  30.48 
 
 		 130 aa  52.8  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1485  hypothetical protein  36.52 
 
 		 134 aa  52  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.208143  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4020  hypothetical protein  27.68 
 
 		 141 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.909625 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>