188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1602 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_1602  hypothetical protein  100 
 
 
143 aa  301  2.0000000000000002e-81  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2010  hypothetical protein  41.91 
 
 
137 aa  114  3.9999999999999997e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.392361  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5301  hypothetical protein  36.36 
 
 
143 aa  113  8.999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.653983 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5254  hypothetical protein  38.28 
 
 
133 aa  112  2.0000000000000002e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1979  protein of unknown function DUF35  39.55 
 
 
137 aa  110  5e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0353441  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1880  hypothetical protein  38.81 
 
 
137 aa  110  7.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0682045 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4786  hypothetical protein  38.76 
 
 
144 aa  110  8.000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.259655  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3587  hypothetical protein  38.06 
 
 
137 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.400148 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1804  hypothetical protein  37.88 
 
 
140 aa  107  5e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.983 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1687  hypothetical protein  39.55 
 
 
137 aa  107  8.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0475632  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3402  hypothetical protein  41.35 
 
 
136 aa  105  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0631046 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0843  hypothetical protein  37.31 
 
 
145 aa  104  4e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1758  hypothetical protein  40.68 
 
 
130 aa  103  6e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.799098  normal  0.109738 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0235  hypothetical protein  34.88 
 
 
136 aa  103  1e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.737012  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4045  hypothetical protein  38.06 
 
 
141 aa  102  1e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.589309 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3828  hypothetical protein  37.01 
 
 
132 aa  102  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2932  hypothetical protein  36.76 
 
 
137 aa  101  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.241273  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4566  putative thiolase subunit  37.01 
 
 
132 aa  101  3e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00449482  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2934  hypothetical protein  38.52 
 
 
144 aa  100  6e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.431872  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5005  hypothetical protein  37.98 
 
 
129 aa  99.4  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.264526  normal  0.0828633 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3806  hypothetical protein  37.01 
 
 
132 aa  98.6  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0860  hypothetical protein  38.64 
 
 
138 aa  98.6  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2351  hypothetical protein  36.43 
 
 
130 aa  97.8  5e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.387375  normal  0.674763 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0899  hypothetical protein  35.34 
 
 
131 aa  97.4  6e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.312493  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4323  hypothetical protein  37.4 
 
 
541 aa  97.1  7e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.51495 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0859  hypothetical protein  32.33 
 
 
132 aa  95.9  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0302426  normal  0.401608 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3606  protein of unknown function DUF35  34.92 
 
 
130 aa  95.5  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.215549  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3114  hypothetical protein  34.92 
 
 
130 aa  95.5  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0274298  normal  0.392807 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4171  hypothetical protein  40.3 
 
 
548 aa  95.5  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4153  hypothetical protein  36.22 
 
 
132 aa  94.7  4e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.280027  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4412  hypothetical protein  38.76 
 
 
132 aa  94.7  4e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000585754  normal  0.649702 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2745  nucleic-acid-binding protein containing a Zn-ribbon  32 
 
 
135 aa  92.8  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0775897 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4493  hypothetical protein  35.29 
 
 
148 aa  92  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2101  hypothetical protein  31.85 
 
 
139 aa  92.4  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.416637  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1501  hypothetical protein  31.01 
 
 
133 aa  91.7  3e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3692  hypothetical protein  36.36 
 
 
550 aa  90.5  7e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3765  hypothetical protein  36.36 
 
 
550 aa  90.5  7e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.981168 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3705  hypothetical protein  36.36 
 
 
550 aa  90.5  7e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.724372  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2483  hypothetical protein  39.55 
 
 
548 aa  89.7  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.207424 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4265  hypothetical protein  28.12 
 
 
146 aa  90.1  1e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.16799  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2378  hypothetical protein  35.65 
 
 
143 aa  89  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.301734  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8196  hypothetical protein  35.04 
 
 
319 aa  89.4  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2337  protein of unknown function DUF35  31.88 
 
 
149 aa  87.8  4e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4054  hypothetical protein  34.71 
 
 
151 aa  87.4  6e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0163629  normal  0.53534 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5278  hypothetical protein  38.39 
 
 
135 aa  85.5  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3311  hypothetical protein  34.09 
 
 
135 aa  85.9  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.367067 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1903  hypothetical protein  35.38 
 
 
132 aa  85.5  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.539737  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2152  hypothetical protein  31.93 
 
 
311 aa  85.1  3e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1994  hypothetical protein  33.33 
 
 
120 aa  84.3  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.253194  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0582  hypothetical protein  34.85 
 
 
137 aa  84.3  5e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00877368  normal  0.438267 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4179  hypothetical protein  39.13 
 
 
145 aa  84.3  5e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5453  hypothetical protein  31.78 
 
 
152 aa  84.3  5e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0654575  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5644  hypothetical protein  31.78 
 
 
152 aa  84.3  5e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5850  hypothetical protein  31.78 
 
 
152 aa  84.3  5e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0806522  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4268  hypothetical protein  33.91 
 
 
140 aa  84  6e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.450465 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0032  hypothetical protein  34.17 
 
 
138 aa  84.3  6e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.662095  normal  0.14279 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1671  hypothetical protein  31.78 
 
 
152 aa  84  7e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1695  hypothetical protein  31.78 
 
 
152 aa  84  7e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0530  hypothetical protein  31.78 
 
 
152 aa  84  7e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1644  hypothetical protein  31.78 
 
 
152 aa  84  7e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.982412  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0635  hypothetical protein  31.78 
 
 
152 aa  84  7e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.525049  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0553  hypothetical protein  31.78 
 
 
152 aa  84  7e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0178  hypothetical protein  36.94 
 
 
134 aa  83.6  8e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.82614  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0905  hypothetical protein  34.33 
 
 
135 aa  83.6  9e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00718711  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3511  hypothetical protein  34.15 
 
 
131 aa  82.8  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0351  hypothetical protein  32.52 
 
 
141 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000546433  hitchhiker  0.00000644081 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2138  hypothetical protein  34.35 
 
 
321 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0128  hypothetical protein  33.63 
 
 
127 aa  81.6  0.000000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0042  hypothetical protein  33.33 
 
 
138 aa  81.3  0.000000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0146  protein of unknown function DUF35  33.63 
 
 
127 aa  81.3  0.000000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2788  hypothetical protein  33.61 
 
 
132 aa  81.3  0.000000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.159844  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0051  hypothetical protein  33.33 
 
 
138 aa  81.3  0.000000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0173713  normal  0.0421472 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3482  protein of unknown function DUF35  36.97 
 
 
319 aa  80.9  0.000000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.893274  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0892  hypothetical protein  32.8 
 
 
142 aa  79.7  0.00000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.204366  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2821  hypothetical protein  33.62 
 
 
315 aa  80.1  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.875118  normal  0.0237416 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2662  hypothetical protein  28.89 
 
 
136 aa  79.3  0.00000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5500  hypothetical protein  32.58 
 
 
132 aa  77.4  0.00000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3214  hypothetical protein  30.16 
 
 
145 aa  75.9  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.907218  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3276  hypothetical protein  30.16 
 
 
145 aa  75.9  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3225  hypothetical protein  30.16 
 
 
145 aa  75.9  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.730825  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5096  hypothetical protein  35.94 
 
 
128 aa  75.1  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6630  hypothetical protein  32.77 
 
 
120 aa  74.7  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0233518  normal  0.987358 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0377  hypothetical protein  40.2 
 
 
130 aa  73.6  0.0000000000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.253705  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5539  hypothetical protein  30.08 
 
 
141 aa  72  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3600  hypothetical protein  27.03 
 
 
140 aa  72  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0665674  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5775  protein of unknown function DUF35  31.25 
 
 
129 aa  70.9  0.000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0423668  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2623  hypothetical protein  34.26 
 
 
305 aa  70.5  0.000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.140164  normal  0.486862 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7489  hypothetical protein  29.81 
 
 
139 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.840415  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1459  hypothetical protein  37.25 
 
 
130 aa  69.3  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5112  hypothetical protein  31.01 
 
 
132 aa  69.3  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000923569  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0340  protein of unknown function DUF35  34.51 
 
 
134 aa  69.3  0.00000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.0000262786  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8760  protein of unknown function DUF35  30.89 
 
 
140 aa  68.6  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.108371 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0460  hypothetical protein  38.24 
 
 
130 aa  68.2  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0490887  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3652  hypothetical protein  27.27 
 
 
136 aa  68.6  0.00000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.92305  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0510  hypothetical protein  28.26 
 
 
143 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1832  hypothetical protein  29.91 
 
 
138 aa  67.4  0.00000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0184205  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0766  hypothetical protein  35 
 
 
135 aa  66.2  0.0000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.48862  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6833  hypothetical protein  28.32 
 
 
121 aa  66.2  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4017  hypothetical protein  32.31 
 
 
155 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.188869  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1073  hypothetical protein  31.19 
 
 
128 aa  65.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>