103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_1073 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_1073  hypothetical protein  100 
 
 		 128 aa  260  4e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2582  hypothetical protein  51.72 
 
 		 123 aa  100  6e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.709226  normal  0.0256768 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3511  hypothetical protein  44 
 
 		 131 aa  98.2  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0343  hypothetical protein  49.57 
 
 		 119 aa  98.6  3e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.619973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0128  hypothetical protein  50.51 
 
 		 127 aa  95.5  2e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0146  protein of unknown function DUF35  50.51 
 
 		 127 aa  95.5  2e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6844  hypothetical protein  45.76 
 
 		 121 aa  94.4  5e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2276  hypothetical protein  45.9 
 
 		 123 aa  92  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.501265 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5112  hypothetical protein  48.45 
 
 		 132 aa  89.4  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000923569  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5775  protein of unknown function DUF35  45.95 
 
 		 129 aa  89.7  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0423668  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5278  hypothetical protein  41.38 
 
 		 135 aa  87.8  4e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4369  hypothetical protein  43.86 
 
 		 127 aa  88.2  4e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51200  hypothetical protein  44.66 
 
 		 128 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.719355  hitchhiker  0.00000582925 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0178  hypothetical protein  45.45 
 
 		 134 aa  85.5  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.82614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3214  hypothetical protein  38.53 
 
 		 145 aa  69.7  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.907218  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3276  hypothetical protein  38.53 
 
 		 145 aa  69.7  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3225  hypothetical protein  38.53 
 
 		 145 aa  69.7  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.730825  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5301  hypothetical protein  35.04 
 
 		 143 aa  70.1  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.653983 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4786  hypothetical protein  35.63 
 
 		 144 aa  66.6  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.259655  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1832  hypothetical protein  35.25 
 
 		 138 aa  65.5  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0184205  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1602  hypothetical protein  31.19 
 
 		 143 aa  65.9  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2337  protein of unknown function DUF35  38.21 
 
 		 149 aa  65.5  0.0000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5254  hypothetical protein  33.9 
 
 		 133 aa  63.9  0.0000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3828  hypothetical protein  32.26 
 
 		 132 aa  62.8  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0317  protein of unknown function DUF35  25.21 
 
 		 124 aa  62.4  0.000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0032  hypothetical protein  34.23 
 
 		 138 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.662095  normal  0.14279 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2378  hypothetical protein  33.33 
 
 		 143 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.301734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5096  hypothetical protein  31.19 
 
 		 128 aa  62  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4268  hypothetical protein  34.23 
 
 		 140 aa  61.6  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.450465 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0860  hypothetical protein  33.33 
 
 		 138 aa  60.8  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4566  putative thiolase subunit  31.45 
 
 		 132 aa  60.1  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00449482  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3806  hypothetical protein  29.17 
 
 		 132 aa  60.1  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5644  hypothetical protein  32.52 
 
 		 152 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3114  hypothetical protein  30.1 
 
 		 130 aa  58.2  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0274298  normal  0.392807 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5500  hypothetical protein  26.23 
 
 		 132 aa  58.2  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0042  hypothetical protein  32.43 
 
 		 138 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0051  hypothetical protein  32.43 
 
 		 138 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0173713  normal  0.0421472 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2351  hypothetical protein  29.81 
 
 		 130 aa  57.4  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.387375  normal  0.674763 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4412  hypothetical protein  30.77 
 
 		 132 aa  57  0.00000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000585754  normal  0.649702 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4674  hypothetical protein  35.96 
 
 		 318 aa  57  0.00000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4760  hypothetical protein  35.96 
 
 		 318 aa  57  0.00000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.247642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5255  hypothetical protein  35.96 
 
 		 324 aa  57  0.00000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.338508 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7489  hypothetical protein  31.3 
 
 		 139 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.840415  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0859  hypothetical protein  33.91 
 
 		 132 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0302426  normal  0.401608 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1671  hypothetical protein  30.08 
 
 		 152 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1695  hypothetical protein  30.08 
 
 		 152 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0530  hypothetical protein  30.08 
 
 		 152 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1644  hypothetical protein  30.08 
 
 		 152 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.982412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0553  hypothetical protein  30.08 
 
 		 152 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0635  hypothetical protein  30.08 
 
 		 152 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.525049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1501  hypothetical protein  23.39 
 
 		 133 aa  55.8  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1758  hypothetical protein  27.27 
 
 		 130 aa  55.5  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.799098  normal  0.109738 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5453  hypothetical protein  30.08 
 
 		 152 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0654575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5850  hypothetical protein  30.08 
 
 		 152 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0806522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5059  hypothetical protein  35.96 
 
 		 317 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.945383  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0235  hypothetical protein  32.99 
 
 		 136 aa  54.3  0.0000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.737012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1994  hypothetical protein  33.64 
 
 		 120 aa  53.9  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.253194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1511  hypothetical protein  36.26 
 
 		 317 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1804  hypothetical protein  29.25 
 
 		 140 aa  53.1  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.983 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5539  hypothetical protein  29.31 
 
 		 141 aa  52.8  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3606  protein of unknown function DUF35  28.16 
 
 		 130 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.215549  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0885  protein of unknown function DUF35  33.33 
 
 		 333 aa  51.6  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0899  hypothetical protein  35.79 
 
 		 131 aa  51.6  0.000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.312493  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2662  hypothetical protein  31.25 
 
 		 136 aa  51.2  0.000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5005  hypothetical protein  28.85 
 
 		 129 aa  51.6  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.264526  normal  0.0828633 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8760  protein of unknown function DUF35  30 
 
 		 140 aa  50.8  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.108371 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4153  hypothetical protein  26.37 
 
 		 132 aa  50.4  0.000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.280027  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2788  hypothetical protein  35.19 
 
 		 132 aa  50.4  0.000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.159844  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2934  hypothetical protein  28.44 
 
 		 144 aa  50.4  0.000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.431872  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4265  hypothetical protein  31.25 
 
 		 146 aa  50.4  0.000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.16799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13575  hypothetical protein  32.58 
 
 		 311 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000328171 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1005  protein of unknown function DUF35  34.56 
 
 		 133 aa  48.1  0.00004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.966695  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2745  nucleic-acid-binding protein containing a Zn-ribbon  30.83 
 
 		 135 aa  48.1  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0775897 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2821  hypothetical protein  31.9 
 
 		 315 aa  47.8  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.875118  normal  0.0237416 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2101  hypothetical protein  32.76 
 
 		 139 aa  47.4  0.00006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.416637  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2932  hypothetical protein  30.56 
 
 		 137 aa  47.4  0.00007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.241273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4493  hypothetical protein  30.25 
 
 		 148 aa  46.6  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0854  protein of unknown function DUF35  28.28 
 
 		 116 aa  46.2  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0219431  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0340  protein of unknown function DUF35  35.79 
 
 		 134 aa  45.4  0.0002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.0000262786  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3600  hypothetical protein  29.41 
 
 		 140 aa  45.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0665674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4045  hypothetical protein  30.26 
 
 		 141 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.589309 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3856  protein of unknown function DUF35  34.65 
 
 		 322 aa  45.8  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.343505  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3402  hypothetical protein  28.7 
 
 		 136 aa  45.8  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0631046 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6630  hypothetical protein  32.76 
 
 		 120 aa  45.4  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0233518  normal  0.987358 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2138  hypothetical protein  25.84 
 
 		 321 aa  45.4  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1979  protein of unknown function DUF35  28.18 
 
 		 137 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0353441  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3482  protein of unknown function DUF35  33.71 
 
 		 319 aa  44.7  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.893274  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1392  hypothetical protein  28.97 
 
 		 152 aa  44.3  0.0005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3587  hypothetical protein  26.85 
 
 		 137 aa  43.9  0.0007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.400148 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0351  hypothetical protein  32.98 
 
 		 141 aa  43.9  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000546433  hitchhiker  0.00000644081 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0458  hypothetical protein  26.92 
 
 		 182 aa  43.9  0.0007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2840  protein of unknown function DUF35  32.56 
 
 		 132 aa  43.9  0.0007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00189293  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3568  hypothetical protein  29.57 
 
 		 118 aa  43.5  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4179  hypothetical protein  31.82 
 
 		 145 aa  43.5  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2106  hypothetical protein  32.35 
 
 		 122 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.283808  normal  0.0319762 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3313  hypothetical protein  32.71 
 
 		 121 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2623  hypothetical protein  31.48 
 
 		 305 aa  42.4  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.140164  normal  0.486862 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2152  hypothetical protein  26.21 
 
 		 311 aa  41.2  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4020  hypothetical protein  31.07 
 
 		 141 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.909625 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4054  hypothetical protein  34.02 
 
 		 151 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0163629  normal  0.53534 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>