149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_0146 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_0146  protein of unknown function DUF35  100 
 
 
127 aa  264  2.9999999999999995e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0128  hypothetical protein  99.21 
 
 
127 aa  262  1e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0178  hypothetical protein  81.34 
 
 
134 aa  226  1e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.82614  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5775  protein of unknown function DUF35  62.93 
 
 
129 aa  153  6e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0423668  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3511  hypothetical protein  60 
 
 
131 aa  146  1.0000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5278  hypothetical protein  54.39 
 
 
135 aa  131  3e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5112  hypothetical protein  53.33 
 
 
132 aa  120  5e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000923569  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51200  hypothetical protein  52.1 
 
 
128 aa  115  3e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.719355  hitchhiker  0.00000582925 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4369  hypothetical protein  52.17 
 
 
127 aa  110  5e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2582  hypothetical protein  50 
 
 
123 aa  107  6e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.709226  normal  0.0256768 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0343  hypothetical protein  44.54 
 
 
119 aa  106  8.000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.619973  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6844  hypothetical protein  45.83 
 
 
121 aa  101  3e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1073  hypothetical protein  50.51 
 
 
128 aa  95.5  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2276  hypothetical protein  43.1 
 
 
123 aa  91.3  5e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.501265 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5254  hypothetical protein  46.08 
 
 
133 aa  86.3  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4786  hypothetical protein  42.2 
 
 
144 aa  85.9  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.259655  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1602  hypothetical protein  33.63 
 
 
143 aa  81.3  0.000000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7489  hypothetical protein  37.5 
 
 
139 aa  81.6  0.000000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.840415  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1832  hypothetical protein  34.13 
 
 
138 aa  77  0.00000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0184205  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1501  hypothetical protein  31.13 
 
 
133 aa  75.5  0.0000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4493  hypothetical protein  35.59 
 
 
148 aa  72.8  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4045  hypothetical protein  33.33 
 
 
141 aa  72  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.589309 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2934  hypothetical protein  35.71 
 
 
144 aa  71.2  0.000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.431872  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2662  hypothetical protein  33.33 
 
 
136 aa  68.6  0.00000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3806  hypothetical protein  38.32 
 
 
132 aa  67.8  0.00000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4268  hypothetical protein  41.49 
 
 
140 aa  68.2  0.00000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.450465 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4566  putative thiolase subunit  35 
 
 
132 aa  67.8  0.00000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00449482  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1758  hypothetical protein  33.64 
 
 
130 aa  67  0.00000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.799098  normal  0.109738 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1979  protein of unknown function DUF35  33.61 
 
 
137 aa  66.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0353441  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0235  hypothetical protein  39 
 
 
136 aa  66.2  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.737012  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0854  protein of unknown function DUF35  32.14 
 
 
116 aa  65.5  0.0000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0219431  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3828  hypothetical protein  34.17 
 
 
132 aa  65.9  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3600  hypothetical protein  31.53 
 
 
140 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0665674  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4265  hypothetical protein  39.13 
 
 
146 aa  65.9  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.16799  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2101  hypothetical protein  35.09 
 
 
139 aa  65.1  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.416637  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2932  hypothetical protein  33.61 
 
 
137 aa  65.1  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.241273  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4412  hypothetical protein  38.32 
 
 
132 aa  64.3  0.0000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000585754  normal  0.649702 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0032  hypothetical protein  38.46 
 
 
138 aa  63.9  0.0000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.662095  normal  0.14279 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3587  hypothetical protein  32.77 
 
 
137 aa  63.9  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.400148 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5301  hypothetical protein  37.17 
 
 
143 aa  63.5  0.0000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.653983 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1880  hypothetical protein  32.77 
 
 
137 aa  63.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0682045 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2152  hypothetical protein  35.24 
 
 
311 aa  63.2  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0317  protein of unknown function DUF35  26.72 
 
 
124 aa  62.4  0.000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2106  hypothetical protein  35.92 
 
 
122 aa  61.2  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.283808  normal  0.0319762 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0042  hypothetical protein  37.36 
 
 
138 aa  61.6  0.000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0051  hypothetical protein  37.36 
 
 
138 aa  61.6  0.000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0173713  normal  0.0421472 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2378  hypothetical protein  33.04 
 
 
143 aa  61.6  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.301734  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0860  hypothetical protein  37.63 
 
 
138 aa  60.8  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3482  protein of unknown function DUF35  34.26 
 
 
319 aa  61.2  0.000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.893274  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2138  hypothetical protein  32.08 
 
 
321 aa  61.2  0.000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5005  hypothetical protein  28.57 
 
 
129 aa  61.2  0.000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.264526  normal  0.0828633 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5539  hypothetical protein  33.03 
 
 
141 aa  60.8  0.000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1994  hypothetical protein  39.13 
 
 
120 aa  60.8  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.253194  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3214  hypothetical protein  35.54 
 
 
145 aa  60.5  0.000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.907218  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3276  hypothetical protein  35.54 
 
 
145 aa  60.5  0.000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4179  hypothetical protein  39.19 
 
 
145 aa  60.5  0.000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3973  hypothetical protein  35.54 
 
 
125 aa  60.5  0.000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.370228 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3225  hypothetical protein  35.54 
 
 
145 aa  60.5  0.000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.730825  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0859  hypothetical protein  34.38 
 
 
132 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0302426  normal  0.401608 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2788  hypothetical protein  37.76 
 
 
132 aa  60.1  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.159844  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4153  hypothetical protein  36.11 
 
 
132 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.280027  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1687  hypothetical protein  31.93 
 
 
137 aa  58.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0475632  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3313  hypothetical protein  35.51 
 
 
121 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5500  hypothetical protein  34.58 
 
 
132 aa  59.7  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2010  hypothetical protein  31.09 
 
 
137 aa  59.3  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.392361  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1392  hypothetical protein  35.58 
 
 
152 aa  58.2  0.00000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2360  hypothetical protein  33.91 
 
 
131 aa  58.2  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.116484 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3885  hypothetical protein  39.5 
 
 
117 aa  57.8  0.00000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3932  protein of unknown function DUF35  36.84 
 
 
144 aa  57.8  0.00000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2337  protein of unknown function DUF35  33.06 
 
 
149 aa  57.4  0.00000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1497  protein of unknown function DUF35  35.42 
 
 
417 aa  57  0.00000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0843  hypothetical protein  42.68 
 
 
145 aa  56.6  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4323  hypothetical protein  33.64 
 
 
541 aa  56.6  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.51495 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1671  hypothetical protein  35.16 
 
 
152 aa  55.5  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5644  hypothetical protein  36.25 
 
 
152 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1695  hypothetical protein  35.16 
 
 
152 aa  55.5  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0530  hypothetical protein  35.16 
 
 
152 aa  55.5  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1644  hypothetical protein  35.16 
 
 
152 aa  55.5  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.982412  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0553  hypothetical protein  35.16 
 
 
152 aa  55.5  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0635  hypothetical protein  35.16 
 
 
152 aa  55.5  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.525049  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3402  hypothetical protein  34.82 
 
 
136 aa  55.5  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0631046 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3568  hypothetical protein  32.04 
 
 
118 aa  56.2  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0340  protein of unknown function DUF35  32.38 
 
 
134 aa  55.1  0.0000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.0000262786  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0899  hypothetical protein  30.28 
 
 
131 aa  55.5  0.0000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.312493  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2675  hypothetical protein  33.68 
 
 
417 aa  54.3  0.0000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1804  hypothetical protein  30 
 
 
140 aa  53.9  0.0000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.983 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5453  hypothetical protein  37.84 
 
 
152 aa  53.9  0.0000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0654575  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5850  hypothetical protein  37.84 
 
 
152 aa  53.9  0.0000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0806522  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5096  hypothetical protein  30.7 
 
 
128 aa  53.9  0.0000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0674  protein of unknown function DUF35  24.35 
 
 
178 aa  53.5  0.0000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2351  hypothetical protein  28.16 
 
 
130 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.387375  normal  0.674763 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3114  hypothetical protein  28.16 
 
 
130 aa  53.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0274298  normal  0.392807 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2363  hypothetical protein  35.63 
 
 
130 aa  53.5  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0397  hypothetical protein  24.35 
 
 
177 aa  53.1  0.000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1009  hypothetical protein  34.41 
 
 
97 aa  53.1  0.000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.00901236 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2015  hypothetical protein  30.84 
 
 
136 aa  53.5  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.196649  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2840  protein of unknown function DUF35  31.82 
 
 
132 aa  52.4  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00189293  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2821  hypothetical protein  36.19 
 
 
315 aa  52.8  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.875118  normal  0.0237416 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0351  hypothetical protein  31.71 
 
 
141 aa  51.6  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000546433  hitchhiker  0.00000644081 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1934  hypothetical protein  26.02 
 
 
133 aa  50.8  0.000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0108502  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>