166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_2821 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_2821  hypothetical protein  100 
 
 
315 aa  625  1e-178  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.875118  normal  0.0237416 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2623  hypothetical protein  83.49 
 
 
305 aa  489  1e-137  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.140164  normal  0.486862 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3856  protein of unknown function DUF35  57.54 
 
 
322 aa  337  9.999999999999999e-92  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.343505  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0885  protein of unknown function DUF35  53.05 
 
 
333 aa  300  1e-80  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8196  hypothetical protein  51.26 
 
 
319 aa  300  2e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13575  hypothetical protein  50.63 
 
 
311 aa  290  2e-77  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000328171 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5255  hypothetical protein  48.9 
 
 
324 aa  282  5.000000000000001e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.338508 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4674  hypothetical protein  48.26 
 
 
318 aa  276  2e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4760  hypothetical protein  48.26 
 
 
318 aa  276  2e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.247642  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5059  hypothetical protein  48.9 
 
 
317 aa  277  2e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.945383  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1511  hypothetical protein  47.85 
 
 
317 aa  276  2e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3482  protein of unknown function DUF35  44.01 
 
 
319 aa  245  6.999999999999999e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.893274  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3318  hypothetical protein  44.95 
 
 
312 aa  217  2e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000206651 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2138  hypothetical protein  38.51 
 
 
321 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2788  hypothetical protein  60.32 
 
 
132 aa  166  4e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.159844  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2789  hypothetical protein  52.83 
 
 
177 aa  154  2e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.705189  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0059  hypothetical protein  45.78 
 
 
173 aa  118  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2015  hypothetical protein  48.7 
 
 
136 aa  114  3e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.196649  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0510  hypothetical protein  41.6 
 
 
143 aa  107  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3587  hypothetical protein  40.48 
 
 
137 aa  103  3e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.400148 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2932  hypothetical protein  40.48 
 
 
137 aa  103  4e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.241273  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1979  protein of unknown function DUF35  38.89 
 
 
137 aa  101  1e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0353441  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1687  hypothetical protein  40 
 
 
137 aa  100  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0475632  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1880  hypothetical protein  38.1 
 
 
137 aa  95.9  9e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0682045 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2010  hypothetical protein  35.2 
 
 
137 aa  86.7  5e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.392361  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0899  hypothetical protein  36.8 
 
 
131 aa  84.7  0.000000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.312493  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5254  hypothetical protein  37.01 
 
 
133 aa  84  0.000000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5644  hypothetical protein  41.01 
 
 
152 aa  82.8  0.000000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0892  hypothetical protein  34.31 
 
 
142 aa  82.8  0.000000000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.204366  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4493  hypothetical protein  42.86 
 
 
148 aa  81.6  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0582  hypothetical protein  37.3 
 
 
137 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00877368  normal  0.438267 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4171  hypothetical protein  37.6 
 
 
548 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2483  hypothetical protein  36 
 
 
548 aa  80.9  0.00000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.207424 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1602  hypothetical protein  33.62 
 
 
143 aa  80.1  0.00000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0860  hypothetical protein  36.22 
 
 
138 aa  79.3  0.00000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5301  hypothetical protein  38.46 
 
 
143 aa  79  0.00000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.653983 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1903  hypothetical protein  37.07 
 
 
132 aa  78.6  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.539737  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5453  hypothetical protein  39.57 
 
 
152 aa  78.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0654575  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1994  hypothetical protein  40.65 
 
 
120 aa  78.6  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.253194  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5850  hypothetical protein  39.57 
 
 
152 aa  78.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0806522  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2745  nucleic-acid-binding protein containing a Zn-ribbon  33.59 
 
 
135 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0775897 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0060  protein of unknown function DUF35  41.46 
 
 
136 aa  77.4  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1758  hypothetical protein  32.26 
 
 
130 aa  76.3  0.0000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.799098  normal  0.109738 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2101  hypothetical protein  37.5 
 
 
139 aa  76.3  0.0000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.416637  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4323  hypothetical protein  39.29 
 
 
541 aa  76.3  0.0000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.51495 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4265  hypothetical protein  33.86 
 
 
146 aa  75.9  0.0000000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.16799  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3692  hypothetical protein  36.8 
 
 
550 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3765  hypothetical protein  36.8 
 
 
550 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.981168 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4045  hypothetical protein  36.21 
 
 
141 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.589309 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3652  hypothetical protein  42.61 
 
 
136 aa  74.7  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.92305  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2094  hypothetical protein  38.76 
 
 
128 aa  74.3  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0905  hypothetical protein  35.16 
 
 
135 aa  74.3  0.000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00718711  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4017  hypothetical protein  35.96 
 
 
155 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.188869  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3705  hypothetical protein  36.8 
 
 
550 aa  73.9  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.724372  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8760  protein of unknown function DUF35  35.04 
 
 
140 aa  73.9  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.108371 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3402  hypothetical protein  36 
 
 
136 aa  73.6  0.000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0631046 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2337  protein of unknown function DUF35  37.9 
 
 
149 aa  72.8  0.000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1832  hypothetical protein  34.75 
 
 
138 aa  72  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0184205  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1671  hypothetical protein  38.13 
 
 
152 aa  72.4  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1695  hypothetical protein  38.13 
 
 
152 aa  72.4  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0530  hypothetical protein  38.13 
 
 
152 aa  72.4  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1644  hypothetical protein  38.13 
 
 
152 aa  72.4  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.982412  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0553  hypothetical protein  38.13 
 
 
152 aa  72.4  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0635  hypothetical protein  38.13 
 
 
152 aa  72.4  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.525049  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0859  hypothetical protein  32.76 
 
 
132 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0302426  normal  0.401608 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0235  hypothetical protein  34.65 
 
 
136 aa  70.5  0.00000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.737012  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4054  hypothetical protein  34.88 
 
 
151 aa  68.9  0.00000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0163629  normal  0.53534 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2934  hypothetical protein  45.65 
 
 
144 aa  68.6  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.431872  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1501  hypothetical protein  29.09 
 
 
133 aa  68.2  0.0000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3311  hypothetical protein  35.16 
 
 
135 aa  66.6  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.367067 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0843  hypothetical protein  38.52 
 
 
145 aa  66.2  0.0000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1804  hypothetical protein  31.03 
 
 
140 aa  66.2  0.0000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.983 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4020  hypothetical protein  38.66 
 
 
141 aa  63.5  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.909625 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3606  protein of unknown function DUF35  28.23 
 
 
130 aa  63.2  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.215549  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3214  hypothetical protein  36.57 
 
 
145 aa  62  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.907218  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3276  hypothetical protein  36.57 
 
 
145 aa  62  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3225  hypothetical protein  36.57 
 
 
145 aa  62  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.730825  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3511  hypothetical protein  40.86 
 
 
131 aa  60.8  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2351  hypothetical protein  28.33 
 
 
130 aa  60.8  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.387375  normal  0.674763 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0351  hypothetical protein  35.14 
 
 
141 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000546433  hitchhiker  0.00000644081 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5005  hypothetical protein  28.07 
 
 
129 aa  60.5  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.264526  normal  0.0828633 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5096  hypothetical protein  36.04 
 
 
128 aa  60.1  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0340  protein of unknown function DUF35  29.46 
 
 
134 aa  59.7  0.00000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.0000262786  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3114  hypothetical protein  27.73 
 
 
130 aa  58.9  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0274298  normal  0.392807 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3806  hypothetical protein  31.67 
 
 
132 aa  58.5  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5278  hypothetical protein  38 
 
 
135 aa  58.2  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0794  hypothetical protein  35.45 
 
 
133 aa  58.2  0.0000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4786  hypothetical protein  30.97 
 
 
144 aa  57  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.259655  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6833  hypothetical protein  33.02 
 
 
121 aa  56.2  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2360  hypothetical protein  32.03 
 
 
131 aa  55.8  0.0000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.116484 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4072  hypothetical protein  37.04 
 
 
142 aa  55.8  0.0000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5775  protein of unknown function DUF35  37 
 
 
129 aa  55.1  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0423668  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1609  protein of unknown function DUF35  30.7 
 
 
133 aa  54.7  0.000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0812  hypothetical protein  30.91 
 
 
134 aa  55.1  0.000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.553396  hitchhiker  0.000113363 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0902  hypothetical protein  32.77 
 
 
140 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6630  hypothetical protein  36.47 
 
 
120 aa  53.9  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0233518  normal  0.987358 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1972  nucleic-acid-binding protein containing a Zn-ribbon-like protein  34.15 
 
 
150 aa  54.3  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2662  hypothetical protein  31.07 
 
 
136 aa  53.5  0.000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0178  hypothetical protein  36.19 
 
 
134 aa  52.4  0.000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.82614  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0146  protein of unknown function DUF35  36.19 
 
 
127 aa  52.8  0.000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>