175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_0235 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_0235  hypothetical protein  100 
 
 
136 aa  281  2.0000000000000002e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.737012  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5254  hypothetical protein  41.86 
 
 
133 aa  113  1.0000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1602  hypothetical protein  34.88 
 
 
143 aa  103  1e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4265  hypothetical protein  35.61 
 
 
146 aa  100  6e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.16799  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0843  hypothetical protein  40.6 
 
 
145 aa  95.1  2e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3587  hypothetical protein  38.58 
 
 
137 aa  94.4  4e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.400148 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1687  hypothetical protein  40.94 
 
 
137 aa  93.6  7e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0475632  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1979  protein of unknown function DUF35  37.8 
 
 
137 aa  93.2  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0353441  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5301  hypothetical protein  45.05 
 
 
143 aa  92.8  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.653983 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4045  hypothetical protein  38.14 
 
 
141 aa  92  3e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.589309 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1758  hypothetical protein  36.89 
 
 
130 aa  90.5  6e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.799098  normal  0.109738 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1880  hypothetical protein  37.8 
 
 
137 aa  89.7  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0682045 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2932  hypothetical protein  38.58 
 
 
137 aa  87.8  5e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.241273  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3606  protein of unknown function DUF35  31.25 
 
 
130 aa  87.8  5e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.215549  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2351  hypothetical protein  31.78 
 
 
130 aa  86.7  1e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.387375  normal  0.674763 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2101  hypothetical protein  37.68 
 
 
139 aa  85.9  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.416637  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5005  hypothetical protein  31.54 
 
 
129 aa  84.7  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.264526  normal  0.0828633 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3828  hypothetical protein  35.38 
 
 
132 aa  84.7  4e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3114  hypothetical protein  30.47 
 
 
130 aa  84.3  6e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0274298  normal  0.392807 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2934  hypothetical protein  37.5 
 
 
144 aa  82  0.000000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.431872  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2010  hypothetical protein  35.66 
 
 
137 aa  82.4  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.392361  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0860  hypothetical protein  31.54 
 
 
138 aa  81.3  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0616  hypothetical protein  34.33 
 
 
176 aa  81.3  0.000000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.11399  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1501  hypothetical protein  29.69 
 
 
133 aa  81.3  0.000000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4017  hypothetical protein  34.51 
 
 
155 aa  80.9  0.000000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.188869  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2745  nucleic-acid-binding protein containing a Zn-ribbon  30.08 
 
 
135 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0775897 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1994  hypothetical protein  36.36 
 
 
120 aa  80.5  0.000000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.253194  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4566  putative thiolase subunit  34.62 
 
 
132 aa  80.1  0.000000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00449482  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2337  protein of unknown function DUF35  35.71 
 
 
149 aa  80.1  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1804  hypothetical protein  36.45 
 
 
140 aa  79.7  0.00000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.983 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3311  hypothetical protein  34.88 
 
 
135 aa  79.7  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.367067 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3214  hypothetical protein  36.51 
 
 
145 aa  79  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.907218  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3276  hypothetical protein  36.51 
 
 
145 aa  79  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3225  hypothetical protein  36.51 
 
 
145 aa  79  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.730825  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0859  hypothetical protein  30.77 
 
 
132 aa  77.8  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0302426  normal  0.401608 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4268  hypothetical protein  32.46 
 
 
140 aa  77.8  0.00000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.450465 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0582  hypothetical protein  35.16 
 
 
137 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00877368  normal  0.438267 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3652  hypothetical protein  37.69 
 
 
136 aa  77  0.00000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.92305  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2152  hypothetical protein  29.23 
 
 
311 aa  77  0.00000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2378  hypothetical protein  32.46 
 
 
143 aa  77  0.00000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.301734  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3806  hypothetical protein  34.4 
 
 
132 aa  75.9  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4179  hypothetical protein  34.62 
 
 
145 aa  75.5  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2788  hypothetical protein  34.4 
 
 
132 aa  75.1  0.0000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.159844  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3973  hypothetical protein  39.42 
 
 
125 aa  74.7  0.0000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.370228 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4493  hypothetical protein  34.17 
 
 
148 aa  74.3  0.0000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4412  hypothetical protein  33.86 
 
 
132 aa  74.3  0.0000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000585754  normal  0.649702 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2662  hypothetical protein  31.11 
 
 
136 aa  74.3  0.0000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4153  hypothetical protein  32.8 
 
 
132 aa  73.9  0.0000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.280027  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0351  hypothetical protein  30.89 
 
 
141 aa  73.9  0.0000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000546433  hitchhiker  0.00000644081 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2582  hypothetical protein  42.39 
 
 
123 aa  73.9  0.0000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.709226  normal  0.0256768 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5096  hypothetical protein  33.33 
 
 
128 aa  73.9  0.0000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1671  hypothetical protein  31.54 
 
 
152 aa  73.9  0.0000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5453  hypothetical protein  31.54 
 
 
152 aa  73.9  0.0000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0654575  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5850  hypothetical protein  31.54 
 
 
152 aa  73.9  0.0000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0806522  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1695  hypothetical protein  31.54 
 
 
152 aa  73.9  0.0000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0530  hypothetical protein  31.54 
 
 
152 aa  73.9  0.0000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1644  hypothetical protein  31.54 
 
 
152 aa  73.9  0.0000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.982412  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0553  hypothetical protein  31.54 
 
 
152 aa  73.9  0.0000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0635  hypothetical protein  31.54 
 
 
152 aa  73.9  0.0000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.525049  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5644  hypothetical protein  32.31 
 
 
152 aa  72.8  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5278  hypothetical protein  44.09 
 
 
135 aa  72.4  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3402  hypothetical protein  38.76 
 
 
136 aa  72.4  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0631046 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1972  nucleic-acid-binding protein containing a Zn-ribbon-like protein  33.33 
 
 
150 aa  72  0.000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4786  hypothetical protein  33.07 
 
 
144 aa  70.9  0.000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.259655  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0042  hypothetical protein  28.57 
 
 
138 aa  71.2  0.000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0051  hypothetical protein  28.57 
 
 
138 aa  71.2  0.000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0173713  normal  0.0421472 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4054  hypothetical protein  34.65 
 
 
151 aa  70.9  0.000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0163629  normal  0.53534 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2821  hypothetical protein  34.65 
 
 
315 aa  70.9  0.000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.875118  normal  0.0237416 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1832  hypothetical protein  34.65 
 
 
138 aa  69.7  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0184205  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3511  hypothetical protein  35.92 
 
 
131 aa  69.3  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5500  hypothetical protein  32.28 
 
 
132 aa  68.9  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0032  hypothetical protein  28.57 
 
 
138 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.662095  normal  0.14279 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3482  protein of unknown function DUF35  33.33 
 
 
319 aa  68.6  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.893274  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3600  hypothetical protein  31.4 
 
 
140 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0665674  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7489  hypothetical protein  34.21 
 
 
139 aa  67  0.00000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.840415  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0317  protein of unknown function DUF35  32.17 
 
 
124 aa  66.6  0.0000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0340  protein of unknown function DUF35  30.17 
 
 
134 aa  66.6  0.0000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.0000262786  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0146  protein of unknown function DUF35  39 
 
 
127 aa  66.2  0.0000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5112  hypothetical protein  35.19 
 
 
132 aa  66.6  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000923569  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0343  hypothetical protein  35.35 
 
 
119 aa  66.2  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.619973  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0899  hypothetical protein  26.12 
 
 
131 aa  65.9  0.0000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.312493  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0128  hypothetical protein  39 
 
 
127 aa  66.2  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5775  protein of unknown function DUF35  40 
 
 
129 aa  64.7  0.0000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0423668  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2138  hypothetical protein  30.23 
 
 
321 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1903  hypothetical protein  31.5 
 
 
132 aa  64.3  0.0000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.539737  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6630  hypothetical protein  34.58 
 
 
120 aa  64.3  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0233518  normal  0.987358 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3932  protein of unknown function DUF35  33.72 
 
 
144 aa  63.9  0.0000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4072  hypothetical protein  37.96 
 
 
142 aa  63.9  0.0000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0892  hypothetical protein  32 
 
 
142 aa  63.2  0.000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.204366  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8760  protein of unknown function DUF35  35.56 
 
 
140 aa  63.2  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.108371 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0178  hypothetical protein  38 
 
 
134 aa  63.2  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.82614  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0549  hypothetical protein  35.65 
 
 
132 aa  61.6  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4020  hypothetical protein  32.77 
 
 
141 aa  61.6  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.909625 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0510  hypothetical protein  28.12 
 
 
143 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4171  hypothetical protein  29.32 
 
 
548 aa  60.8  0.000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3885  hypothetical protein  40.48 
 
 
117 aa  60.5  0.000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2483  hypothetical protein  29.32 
 
 
548 aa  60.1  0.000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.207424 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2106  hypothetical protein  44.93 
 
 
122 aa  59.7  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.283808  normal  0.0319762 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2366  hypothetical protein  33.82 
 
 
152 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.206302  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2363  hypothetical protein  37.66 
 
 
130 aa  58.9  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>