154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0582 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0582  hypothetical protein  100 
 
 
137 aa  282  1.0000000000000001e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00877368  normal  0.438267 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1903  hypothetical protein  62.2 
 
 
132 aa  170  6.999999999999999e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.539737  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0899  hypothetical protein  45.67 
 
 
131 aa  132  9.999999999999999e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.312493  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4323  hypothetical protein  48.82 
 
 
541 aa  132  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.51495 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0905  hypothetical protein  43.75 
 
 
135 aa  130  6e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00718711  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3311  hypothetical protein  49.61 
 
 
135 aa  130  9e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.367067 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4017  hypothetical protein  47.76 
 
 
155 aa  127  8.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.188869  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3692  hypothetical protein  48.41 
 
 
550 aa  125  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3765  hypothetical protein  48.41 
 
 
550 aa  125  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.981168 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3705  hypothetical protein  47.62 
 
 
550 aa  123  8.000000000000001e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.724372  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2483  hypothetical protein  47.58 
 
 
548 aa  117  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.207424 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4171  hypothetical protein  45.16 
 
 
548 aa  116  9.999999999999999e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8196  hypothetical protein  42.86 
 
 
319 aa  103  8e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2101  hypothetical protein  38.76 
 
 
139 aa  97.4  6e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.416637  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1979  protein of unknown function DUF35  36.43 
 
 
137 aa  95.1  3e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0353441  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2932  hypothetical protein  37.69 
 
 
137 aa  94.7  4e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.241273  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0616  hypothetical protein  38.41 
 
 
176 aa  93.6  8e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.11399  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3587  hypothetical protein  35.66 
 
 
137 aa  92.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.400148 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1880  hypothetical protein  34.88 
 
 
137 aa  92  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0682045 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3402  hypothetical protein  40.6 
 
 
136 aa  92  3e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0631046 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1687  hypothetical protein  35.66 
 
 
137 aa  88.6  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0475632  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4493  hypothetical protein  36.36 
 
 
148 aa  88.6  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8760  protein of unknown function DUF35  38.69 
 
 
140 aa  88.2  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.108371 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2138  hypothetical protein  36.43 
 
 
321 aa  88.2  4e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1758  hypothetical protein  37.7 
 
 
130 aa  88.2  4e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.799098  normal  0.109738 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2010  hypothetical protein  38.17 
 
 
137 aa  87.4  5e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.392361  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1602  hypothetical protein  34.85 
 
 
143 aa  84.3  5e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0510  hypothetical protein  36.09 
 
 
143 aa  84  7e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3482  protein of unknown function DUF35  37.01 
 
 
319 aa  83.2  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.893274  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2788  hypothetical protein  36.75 
 
 
132 aa  82  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.159844  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4054  hypothetical protein  38.89 
 
 
151 aa  81.3  0.000000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0163629  normal  0.53534 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2821  hypothetical protein  37.3 
 
 
315 aa  81.3  0.000000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.875118  normal  0.0237416 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0892  hypothetical protein  34.96 
 
 
142 aa  81.3  0.000000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.204366  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4045  hypothetical protein  33.87 
 
 
141 aa  78.2  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.589309 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0235  hypothetical protein  35.16 
 
 
136 aa  77.4  0.00000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.737012  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4265  hypothetical protein  36.43 
 
 
146 aa  77.4  0.00000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.16799  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1994  hypothetical protein  37.19 
 
 
120 aa  76.6  0.00000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.253194  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6833  hypothetical protein  38.26 
 
 
121 aa  76.6  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4633  hypothetical protein  37.07 
 
 
153 aa  75.1  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0902  hypothetical protein  33.63 
 
 
140 aa  74.7  0.0000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5254  hypothetical protein  31.06 
 
 
133 aa  74.3  0.0000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1804  hypothetical protein  33.33 
 
 
140 aa  74.3  0.0000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.983 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0859  hypothetical protein  31.82 
 
 
132 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0302426  normal  0.401608 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5005  hypothetical protein  32.03 
 
 
129 aa  73.2  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.264526  normal  0.0828633 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2623  hypothetical protein  38.89 
 
 
305 aa  72.4  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.140164  normal  0.486862 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5644  hypothetical protein  38.17 
 
 
152 aa  71.6  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2934  hypothetical protein  37.19 
 
 
144 aa  70.1  0.000000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.431872  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0860  hypothetical protein  36.92 
 
 
138 aa  70.1  0.000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0843  hypothetical protein  34.71 
 
 
145 aa  68.9  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4020  hypothetical protein  36.04 
 
 
141 aa  68.6  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.909625 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1671  hypothetical protein  37.4 
 
 
152 aa  67.8  0.00000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1695  hypothetical protein  37.4 
 
 
152 aa  67.8  0.00000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0530  hypothetical protein  37.4 
 
 
152 aa  67.8  0.00000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1644  hypothetical protein  37.4 
 
 
152 aa  67.8  0.00000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.982412  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0553  hypothetical protein  37.4 
 
 
152 aa  67.8  0.00000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0635  hypothetical protein  37.4 
 
 
152 aa  67.8  0.00000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.525049  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5301  hypothetical protein  32.52 
 
 
143 aa  67.8  0.00000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.653983 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2662  hypothetical protein  35.65 
 
 
136 aa  67.8  0.00000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3652  hypothetical protein  30.65 
 
 
136 aa  67.8  0.00000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.92305  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13575  hypothetical protein  37.01 
 
 
311 aa  67.4  0.00000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000328171 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3806  hypothetical protein  29.66 
 
 
132 aa  66.6  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0042  hypothetical protein  33.06 
 
 
138 aa  66.2  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5453  hypothetical protein  36.64 
 
 
152 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0654575  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5850  hypothetical protein  36.64 
 
 
152 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0806522  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0051  hypothetical protein  33.06 
 
 
138 aa  66.2  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0173713  normal  0.0421472 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4268  hypothetical protein  35.59 
 
 
140 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.450465 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1972  nucleic-acid-binding protein containing a Zn-ribbon-like protein  29.31 
 
 
150 aa  65.9  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2745  nucleic-acid-binding protein containing a Zn-ribbon  31.01 
 
 
135 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0775897 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0032  hypothetical protein  32.26 
 
 
138 aa  65.1  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.662095  normal  0.14279 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1501  hypothetical protein  29.27 
 
 
133 aa  65.1  0.0000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3856  protein of unknown function DUF35  34.65 
 
 
322 aa  64.7  0.0000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.343505  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0060  protein of unknown function DUF35  29.51 
 
 
136 aa  64.7  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2015  hypothetical protein  33.05 
 
 
136 aa  63.2  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.196649  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3318  hypothetical protein  34.17 
 
 
312 aa  63.5  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000206651 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2152  hypothetical protein  28.23 
 
 
311 aa  62.8  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4412  hypothetical protein  33.33 
 
 
132 aa  62  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000585754  normal  0.649702 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5554  hypothetical protein  30.77 
 
 
157 aa  61.6  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3214  hypothetical protein  34.62 
 
 
145 aa  62  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.907218  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3276  hypothetical protein  34.62 
 
 
145 aa  62  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3225  hypothetical protein  34.62 
 
 
145 aa  62  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.730825  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2351  hypothetical protein  30.97 
 
 
130 aa  61.2  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.387375  normal  0.674763 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0351  hypothetical protein  30.17 
 
 
141 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000546433  hitchhiker  0.00000644081 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3828  hypothetical protein  29.06 
 
 
132 aa  60.8  0.000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3606  protein of unknown function DUF35  28.57 
 
 
130 aa  60.5  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.215549  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4566  putative thiolase subunit  29.06 
 
 
132 aa  60.1  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00449482  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0149  hypothetical protein  32.99 
 
 
129 aa  60.1  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3541  hypothetical protein  30.77 
 
 
156 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0915855 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2366  hypothetical protein  30.65 
 
 
152 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.206302  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3114  hypothetical protein  29.2 
 
 
130 aa  60.1  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0274298  normal  0.392807 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0885  protein of unknown function DUF35  36.67 
 
 
333 aa  59.7  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0340  protein of unknown function DUF35  34.69 
 
 
134 aa  60.1  0.00000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.0000262786  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2378  hypothetical protein  34.45 
 
 
143 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.301734  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4153  hypothetical protein  29.75 
 
 
132 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.280027  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4786  hypothetical protein  32.23 
 
 
144 aa  58.9  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.259655  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5255  hypothetical protein  31.62 
 
 
324 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.338508 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2337  protein of unknown function DUF35  34.65 
 
 
149 aa  59.3  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5096  hypothetical protein  33.04 
 
 
128 aa  58.5  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3932  protein of unknown function DUF35  34.62 
 
 
144 aa  58.2  0.00000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1934  hypothetical protein  34.74 
 
 
133 aa  58.2  0.00000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0108502  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4179  hypothetical protein  33.33 
 
 
145 aa  57.8  0.00000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>