153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3311 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_3311  hypothetical protein  100 
 
 		 135 aa  274  3e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.367067 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0905  hypothetical protein  48.46 
 
 		 135 aa  135  1e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00718711  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0582  hypothetical protein  49.61 
 
 		 137 aa  130  9e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00877368  normal  0.438267 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4017  hypothetical protein  45.52 
 
 		 155 aa  127  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.188869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2483  hypothetical protein  48.03 
 
 		 548 aa  127  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.207424 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3692  hypothetical protein  48.06 
 
 		 550 aa  125  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3765  hypothetical protein  48.06 
 
 		 550 aa  125  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.981168 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3705  hypothetical protein  48.06 
 
 		 550 aa  125  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.724372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4171  hypothetical protein  45.67 
 
 		 548 aa  124  6e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1903  hypothetical protein  46.83 
 
 		 132 aa  121  4e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.539737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4323  hypothetical protein  44.53 
 
 		 541 aa  118  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.51495 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2101  hypothetical protein  41.98 
 
 		 139 aa  107  5e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.416637  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1758  hypothetical protein  41.46 
 
 		 130 aa  105  2e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.799098  normal  0.109738 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0899  hypothetical protein  36.43 
 
 		 131 aa  104  5e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.312493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2138  hypothetical protein  41.54 
 
 		 321 aa  101  4e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1880  hypothetical protein  36.76 
 
 		 137 aa  99.4  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0682045 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2932  hypothetical protein  37.5 
 
 		 137 aa  99.4  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.241273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2010  hypothetical protein  38.24 
 
 		 137 aa  99  2e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.392361  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1687  hypothetical protein  38.97 
 
 		 137 aa  98.2  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0475632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3587  hypothetical protein  34.56 
 
 		 137 aa  94.7  4e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.400148 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1979  protein of unknown function DUF35  34.56 
 
 		 137 aa  94.7  4e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0353441  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4493  hypothetical protein  35.66 
 
 		 148 aa  92.8  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0616  hypothetical protein  41.98 
 
 		 176 aa  91.7  3e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.11399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3402  hypothetical protein  37.04 
 
 		 136 aa  90.9  6e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0631046 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8196  hypothetical protein  40.48 
 
 		 319 aa  90.1  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5254  hypothetical protein  37.4 
 
 		 133 aa  88.6  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2788  hypothetical protein  40.8 
 
 		 132 aa  89  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.159844  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5005  hypothetical protein  31.82 
 
 		 129 aa  87.8  5e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.264526  normal  0.0828633 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0510  hypothetical protein  38.28 
 
 		 143 aa  85.9  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1602  hypothetical protein  34.09 
 
 		 143 aa  85.9  2e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1994  hypothetical protein  42.73 
 
 		 120 aa  81.3  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.253194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3482  protein of unknown function DUF35  37.98 
 
 		 319 aa  80.1  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.893274  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0235  hypothetical protein  34.88 
 
 		 136 aa  79.7  0.00000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.737012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4045  hypothetical protein  37.23 
 
 		 141 aa  79  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.589309 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5500  hypothetical protein  34.85 
 
 		 132 aa  77.8  0.00000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2337  protein of unknown function DUF35  41.54 
 
 		 149 aa  77.4  0.00000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3114  hypothetical protein  31.75 
 
 		 130 aa  77  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0274298  normal  0.392807 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8760  protein of unknown function DUF35  35.56 
 
 		 140 aa  76.6  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.108371 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2351  hypothetical protein  31.75 
 
 		 130 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.387375  normal  0.674763 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3606  protein of unknown function DUF35  32.54 
 
 		 130 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.215549  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4153  hypothetical protein  34.71 
 
 		 132 aa  74.3  0.0000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.280027  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2934  hypothetical protein  40.16 
 
 		 144 aa  73.9  0.0000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.431872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1501  hypothetical protein  31.78 
 
 		 133 aa  73.6  0.0000000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0060  protein of unknown function DUF35  39.78 
 
 		 136 aa  72.4  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3652  hypothetical protein  34.43 
 
 		 136 aa  71.6  0.000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.92305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6630  hypothetical protein  39.83 
 
 		 120 aa  70.9  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0233518  normal  0.987358 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4633  hypothetical protein  33.33 
 
 		 153 aa  70.9  0.000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4020  hypothetical protein  39.29 
 
 		 141 aa  70.1  0.000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.909625 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1804  hypothetical protein  34.11 
 
 		 140 aa  70.1  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.983 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6833  hypothetical protein  39.62 
 
 		 121 aa  70.1  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4072  hypothetical protein  40.21 
 
 		 142 aa  69.7  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3318  hypothetical protein  33.59 
 
 		 312 aa  69.7  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000206651 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3828  hypothetical protein  33.61 
 
 		 132 aa  69.3  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0860  hypothetical protein  36.43 
 
 		 138 aa  68.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4265  hypothetical protein  30.3 
 
 		 146 aa  69.3  0.00000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.16799  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5301  hypothetical protein  33.59 
 
 		 143 aa  67.8  0.00000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.653983 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4566  putative thiolase subunit  32.79 
 
 		 132 aa  66.6  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00449482  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2821  hypothetical protein  35.16 
 
 		 315 aa  66.6  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.875118  normal  0.0237416 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0902  hypothetical protein  30.16 
 
 		 140 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4786  hypothetical protein  32.03 
 
 		 144 aa  65.5  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.259655  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4412  hypothetical protein  32.56 
 
 		 132 aa  65.1  0.0000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000585754  normal  0.649702 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3806  hypothetical protein  30.33 
 
 		 132 aa  63.9  0.0000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0892  hypothetical protein  31.45 
 
 		 142 aa  63.9  0.0000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.204366  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2152  hypothetical protein  29.41 
 
 		 311 aa  63.5  0.0000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5453  hypothetical protein  32.06 
 
 		 152 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0654575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5850  hypothetical protein  32.06 
 
 		 152 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0806522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4054  hypothetical protein  30.65 
 
 		 151 aa  63.5  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0163629  normal  0.53534 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0843  hypothetical protein  32.59 
 
 		 145 aa  62.8  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4179  hypothetical protein  35.8 
 
 		 145 aa  61.6  0.000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1671  hypothetical protein  32.06 
 
 		 152 aa  62  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1695  hypothetical protein  32.06 
 
 		 152 aa  62  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0530  hypothetical protein  32.06 
 
 		 152 aa  62  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1644  hypothetical protein  32.06 
 
 		 152 aa  62  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.982412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0553  hypothetical protein  32.06 
 
 		 152 aa  62  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0635  hypothetical protein  32.06 
 
 		 152 aa  62  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.525049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2015  hypothetical protein  32.2 
 
 		 136 aa  60.5  0.000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.196649  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5554  hypothetical protein  30.53 
 
 		 157 aa  60.5  0.000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3856  protein of unknown function DUF35  37.29 
 
 		 322 aa  60.1  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.343505  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5096  hypothetical protein  32.81 
 
 		 128 aa  59.3  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2662  hypothetical protein  31.36 
 
 		 136 aa  58.9  0.00000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2094  hypothetical protein  30.85 
 
 		 128 aa  58.5  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3932  protein of unknown function DUF35  39.74 
 
 		 144 aa  58.5  0.00000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3541  hypothetical protein  28.35 
 
 		 156 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0915855 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0340  protein of unknown function DUF35  32.73 
 
 		 134 aa  57  0.00000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.0000262786  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0042  hypothetical protein  32.09 
 
 		 138 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0051  hypothetical protein  32.09 
 
 		 138 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0173713  normal  0.0421472 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2623  hypothetical protein  37.5 
 
 		 305 aa  56.6  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.140164  normal  0.486862 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5281  hypothetical protein  37.62 
 
 		 146 aa  55.1  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0032  hypothetical protein  32.09 
 
 		 138 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.662095  normal  0.14279 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0766  hypothetical protein  35.71 
 
 		 135 aa  55.1  0.0000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.48862  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0859  hypothetical protein  28.35 
 
 		 132 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0302426  normal  0.401608 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5644  hypothetical protein  29.77 
 
 		 152 aa  53.9  0.0000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2363  hypothetical protein  36.7 
 
 		 130 aa  53.9  0.0000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1972  nucleic-acid-binding protein containing a Zn-ribbon-like protein  28.21 
 
 		 150 aa  53.5  0.0000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7489  hypothetical protein  27.56 
 
 		 139 aa  53.1  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.840415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2378  hypothetical protein  31.36 
 
 		 143 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.301734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4268  hypothetical protein  31.36 
 
 		 140 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.450465 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0836  hypothetical protein  30 
 
 		 189 aa  52.4  0.000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0387  hypothetical protein  32.04 
 
 		 129 aa  52.8  0.000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.448785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0351  hypothetical protein  26.83 
 
 		 141 aa  52  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000546433  hitchhiker  0.00000644081 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>