189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_5539 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_5539  hypothetical protein  100 
 
 		 141 aa  292  1e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3600  hypothetical protein  55 
 
 		 140 aa  161  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0665674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5254  hypothetical protein  40.16 
 
 		 133 aa  90.9  5e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5301  hypothetical protein  38.33 
 
 		 143 aa  85.9  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.653983 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1602  hypothetical protein  30.83 
 
 		 143 aa  78.2  0.00000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5005  hypothetical protein  34.51 
 
 		 129 aa  75.1  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.264526  normal  0.0828633 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0899  hypothetical protein  37.61 
 
 		 131 aa  74.3  0.0000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.312493  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5775  protein of unknown function DUF35  39.05 
 
 		 129 aa  73.6  0.0000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0423668  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3932  protein of unknown function DUF35  36.09 
 
 		 144 aa  73.2  0.000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1310  hypothetical protein  34.55 
 
 		 151 aa  73.2  0.000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.120998 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0836  hypothetical protein  36.89 
 
 		 189 aa  72.4  0.000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3114  hypothetical protein  34.17 
 
 		 130 aa  71.6  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0274298  normal  0.392807 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3606  protein of unknown function DUF35  35 
 
 		 130 aa  71.6  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.215549  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2745  nucleic-acid-binding protein containing a Zn-ribbon  29.46 
 
 		 135 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0775897 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1438  3-hydroxybutyryl-CoA epimerase  32.69 
 
 		 576 aa  71.2  0.000000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.410853  normal  0.0151032 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4045  hypothetical protein  33.61 
 
 		 141 aa  71.2  0.000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.589309 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2351  hypothetical protein  34.17 
 
 		 130 aa  70.9  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.387375  normal  0.674763 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3828  hypothetical protein  33.05 
 
 		 132 aa  70.5  0.000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0510  hypothetical protein  38 
 
 		 143 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4493  hypothetical protein  33.02 
 
 		 148 aa  68.9  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0458  hypothetical protein  33.98 
 
 		 182 aa  68.2  0.00000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1804  hypothetical protein  33.61 
 
 		 140 aa  68.2  0.00000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.983 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4265  hypothetical protein  28.18 
 
 		 146 aa  67.8  0.00000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.16799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0528  hypothetical protein  35.29 
 
 		 129 aa  67  0.00000000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.825077  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4566  putative thiolase subunit  32.2 
 
 		 132 aa  66.6  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00449482  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5112  hypothetical protein  30.65 
 
 		 132 aa  65.5  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000923569  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0387  hypothetical protein  33.33 
 
 		 129 aa  65.5  0.0000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.448785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0377  hypothetical protein  32.65 
 
 		 130 aa  65.1  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.253705  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0397  hypothetical protein  36.11 
 
 		 177 aa  64.3  0.0000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1832  hypothetical protein  37.37 
 
 		 138 aa  64.3  0.0000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0184205  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1758  hypothetical protein  27.73 
 
 		 130 aa  63.5  0.0000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.799098  normal  0.109738 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4786  hypothetical protein  30.65 
 
 		 144 aa  63.2  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.259655  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5278  hypothetical protein  34.58 
 
 		 135 aa  62.8  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0859  hypothetical protein  30 
 
 		 132 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0302426  normal  0.401608 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0235  hypothetical protein  27.73 
 
 		 136 aa  62.8  0.000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.737012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5096  hypothetical protein  32.48 
 
 		 128 aa  62.8  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1459  hypothetical protein  31.63 
 
 		 130 aa  62.4  0.000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0340  protein of unknown function DUF35  33.33 
 
 		 134 aa  61.6  0.000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.0000262786  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0023  hypothetical protein  34.44 
 
 		 130 aa  61.6  0.000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7489  hypothetical protein  31.53 
 
 		 139 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.840415  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0766  hypothetical protein  32.99 
 
 		 135 aa  61.2  0.000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.48862  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2138  hypothetical protein  31.09 
 
 		 321 aa  61.2  0.000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1979  protein of unknown function DUF35  29.41 
 
 		 137 aa  61.2  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0353441  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0178  hypothetical protein  32.11 
 
 		 134 aa  61.6  0.000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.82614  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0146  protein of unknown function DUF35  33.03 
 
 		 127 aa  61.2  0.000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2662  hypothetical protein  30.91 
 
 		 136 aa  60.8  0.000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2788  hypothetical protein  32.69 
 
 		 132 aa  61.2  0.000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.159844  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0128  hypothetical protein  33.03 
 
 		 127 aa  60.8  0.000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0460  hypothetical protein  32.35 
 
 		 130 aa  60.8  0.000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0490887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3806  hypothetical protein  29.84 
 
 		 132 aa  60.5  0.000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3541  hypothetical protein  30.7 
 
 		 156 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0915855 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3692  hypothetical protein  33.86 
 
 		 550 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3402  hypothetical protein  30.83 
 
 		 136 aa  60.1  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0631046 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3765  hypothetical protein  33.86 
 
 		 550 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.981168 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1625  hypothetical protein  34.29 
 
 		 130 aa  59.7  0.00000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3705  hypothetical protein  33.86 
 
 		 550 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.724372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1648  hypothetical protein  33.33 
 
 		 135 aa  59.3  0.00000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3511  hypothetical protein  34.88 
 
 		 131 aa  58.9  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0149  hypothetical protein  34.29 
 
 		 129 aa  58.9  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1880  hypothetical protein  31.58 
 
 		 137 aa  58.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0682045 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1671  hypothetical protein  26.98 
 
 		 152 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1695  hypothetical protein  26.98 
 
 		 152 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8196  hypothetical protein  28.33 
 
 		 319 aa  58.9  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0530  hypothetical protein  26.98 
 
 		 152 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1644  hypothetical protein  26.98 
 
 		 152 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.982412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0553  hypothetical protein  26.98 
 
 		 152 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0635  hypothetical protein  26.98 
 
 		 152 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.525049  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0674  protein of unknown function DUF35  28.4 
 
 		 178 aa  58.5  0.00000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1687  hypothetical protein  32.63 
 
 		 137 aa  58.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0475632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1392  hypothetical protein  35.63 
 
 		 152 aa  58.5  0.00000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3311  hypothetical protein  30.6 
 
 		 135 aa  58.2  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.367067 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3388  hypothetical protein  32.08 
 
 		 138 aa  58.2  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.809106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0860  hypothetical protein  28.83 
 
 		 138 aa  57.8  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5453  hypothetical protein  26.98 
 
 		 152 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0654575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5850  hypothetical protein  26.98 
 
 		 152 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0806522  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2508  protein of unknown function DUF35  32.95 
 
 		 132 aa  57.8  0.00000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.347955  normal  0.395372 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1501  hypothetical protein  26.85 
 
 		 133 aa  57.8  0.00000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2934  hypothetical protein  30.58 
 
 		 144 aa  57.8  0.00000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.431872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0155  hypothetical protein  36.26 
 
 		 130 aa  57.4  0.00000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3780  protein of unknown function DUF35  33.94 
 
 		 126 aa  57.8  0.00000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.000111928  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5281  hypothetical protein  28.57 
 
 		 146 aa  57.4  0.00000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2010  hypothetical protein  32.58 
 
 		 137 aa  57.4  0.00000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.392361  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0317  protein of unknown function DUF35  23.58 
 
 		 124 aa  57  0.00000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0436  protein of unknown function DUF35  27.06 
 
 		 128 aa  57  0.00000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.686015  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4412  hypothetical protein  28.21 
 
 		 132 aa  57  0.00000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000585754  normal  0.649702 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5644  hypothetical protein  26.19 
 
 		 152 aa  57  0.00000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2932  hypothetical protein  33.01 
 
 		 137 aa  57  0.00000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.241273  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0549  hypothetical protein  31.46 
 
 		 132 aa  56.2  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4138  hypothetical protein  32.77 
 
 		 146 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.67568  normal  0.342554 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2582  hypothetical protein  30.23 
 
 		 123 aa  56.6  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.709226  normal  0.0256768 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2675  hypothetical protein  35 
 
 		 417 aa  56.2  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2363  hypothetical protein  31.78 
 
 		 130 aa  56.2  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1497  protein of unknown function DUF35  35 
 
 		 417 aa  55.8  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0351  hypothetical protein  29.46 
 
 		 141 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000546433  hitchhiker  0.00000644081 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1934  hypothetical protein  32.22 
 
 		 133 aa  55.8  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0108502  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5554  hypothetical protein  28.95 
 
 		 157 aa  55.8  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0892  hypothetical protein  33.01 
 
 		 142 aa  55.8  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.204366  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0794  hypothetical protein  30.39 
 
 		 133 aa  55.8  0.0000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1005  protein of unknown function DUF35  33.73 
 
 		 133 aa  55.5  0.0000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.966695  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3482  protein of unknown function DUF35  36.36 
 
 		 319 aa  55.1  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.893274  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>