52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1005 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_1005  protein of unknown function DUF35  100 
 
 		 133 aa  265  2e-70  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.966695  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2808  protein of unknown function DUF35  60.47 
 
 		 128 aa  154  3e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0884467  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2476  protein of unknown function DUF35  51.24 
 
 		 134 aa  126  1.0000000000000001e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.73466  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3780  protein of unknown function DUF35  52.71 
 
 		 126 aa  125  2.0000000000000002e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.000111928  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0598  protein of unknown function DUF35  50.39 
 
 		 127 aa  125  2.0000000000000002e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0897  protein of unknown function DUF35  50.41 
 
 		 131 aa  114  6e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0397  hypothetical protein  30.63 
 
 		 177 aa  57  0.00000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0155  hypothetical protein  37 
 
 		 130 aa  55.8  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5112  hypothetical protein  36.15 
 
 		 132 aa  53.9  0.0000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000923569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5254  hypothetical protein  32.56 
 
 		 133 aa  52.4  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2337  protein of unknown function DUF35  38.46 
 
 		 149 aa  51.2  0.000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2363  hypothetical protein  35.42 
 
 		 130 aa  50.1  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5539  hypothetical protein  33.73 
 
 		 141 aa  49.7  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2642  hypothetical protein  35.2 
 
 		 329 aa  48.9  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.13056  normal  0.212134 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0340  protein of unknown function DUF35  37.23 
 
 		 134 aa  48.1  0.00003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.0000262786  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1073  hypothetical protein  34.56 
 
 		 128 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4493  hypothetical protein  33.58 
 
 		 148 aa  47.8  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2508  protein of unknown function DUF35  33.66 
 
 		 132 aa  47.8  0.00006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.347955  normal  0.395372 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0178  hypothetical protein  36.63 
 
 		 134 aa  47.8  0.00006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.82614  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0674  protein of unknown function DUF35  29.46 
 
 		 178 aa  47  0.00008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5301  hypothetical protein  32.41 
 
 		 143 aa  47  0.00009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.653983 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0766  hypothetical protein  41.54 
 
 		 135 aa  46.6  0.0001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.48862  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6630  hypothetical protein  34.62 
 
 		 120 aa  45.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0233518  normal  0.987358 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3225  hypothetical protein  36.36 
 
 		 145 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.730825  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3214  hypothetical protein  36.36 
 
 		 145 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.907218  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3276  hypothetical protein  36.36 
 
 		 145 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2015  hypothetical protein  33.61 
 
 		 136 aa  45.8  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.196649  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0549  hypothetical protein  34.65 
 
 		 132 aa  45.1  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1392  hypothetical protein  32.67 
 
 		 152 aa  45.1  0.0004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0235  hypothetical protein  36.76 
 
 		 136 aa  44.7  0.0005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.737012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3828  hypothetical protein  33.08 
 
 		 132 aa  44.3  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1979  protein of unknown function DUF35  29.92 
 
 		 137 aa  43.9  0.0007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0353441  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3511  hypothetical protein  33.33 
 
 		 131 aa  43.9  0.0007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2839  hypothetical protein  36.27 
 
 		 319 aa  43.9  0.0007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.11529  normal  0.0470778 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4072  hypothetical protein  35.82 
 
 		 142 aa  43.9  0.0008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2934  hypothetical protein  31.51 
 
 		 144 aa  42.7  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.431872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1602  hypothetical protein  26.4 
 
 		 143 aa  42.4  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0528  hypothetical protein  32.91 
 
 		 129 aa  42.7  0.002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.825077  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4045  hypothetical protein  30.88 
 
 		 141 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.589309 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5005  hypothetical protein  29.55 
 
 		 129 aa  41.2  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.264526  normal  0.0828633 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0377  hypothetical protein  36.71 
 
 		 130 aa  41.6  0.004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.253705  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0128  hypothetical protein  33.33 
 
 		 127 aa  41.6  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1459  hypothetical protein  36.71 
 
 		 130 aa  41.2  0.005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3587  hypothetical protein  29.91 
 
 		 137 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.400148 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0146  protein of unknown function DUF35  33.33 
 
 		 127 aa  41.2  0.005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0460  hypothetical protein  36.71 
 
 		 130 aa  41.2  0.005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0490887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2732  hypothetical protein  35.05 
 
 		 319 aa  40.8  0.006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3818  protein of unknown function DUF35  33.94 
 
 		 320 aa  40.8  0.006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.704476  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4566  putative thiolase subunit  32.31 
 
 		 132 aa  40.4  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00449482  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0436  protein of unknown function DUF35  30.67 
 
 		 128 aa  40.4  0.007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.686015  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0859  hypothetical protein  30.19 
 
 		 132 aa  40.4  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0302426  normal  0.401608 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5500  hypothetical protein  35.05 
 
 		 132 aa  40.4  0.008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>