107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1648 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009440  Msed_1648  hypothetical protein  100 
 
 
135 aa  278  2e-74  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1609  protein of unknown function DUF35  58.02 
 
 
133 aa  160  5.0000000000000005e-39  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0812  hypothetical protein  44.96 
 
 
134 aa  98.6  3e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.553396  hitchhiker  0.000113363 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0340  protein of unknown function DUF35  40.48 
 
 
134 aa  97.4  6e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.0000262786  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0794  hypothetical protein  42.52 
 
 
133 aa  95.9  1e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0766  hypothetical protein  37.1 
 
 
135 aa  91.7  3e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.48862  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0023  hypothetical protein  37.3 
 
 
130 aa  90.9  6e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1459  hypothetical protein  36.89 
 
 
130 aa  89.7  1e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0377  hypothetical protein  36.89 
 
 
130 aa  89  2e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.253705  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1357  hypothetical protein  38.58 
 
 
132 aa  89  2e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0549  hypothetical protein  34.15 
 
 
132 aa  88.2  4e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0155  hypothetical protein  31.15 
 
 
130 aa  87  7e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0460  hypothetical protein  36.07 
 
 
130 aa  87  8e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0490887  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0528  hypothetical protein  37.19 
 
 
129 aa  86.7  9e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.825077  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1241  hypothetical protein  39.2 
 
 
137 aa  85.5  2e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0148077  normal  0.0127741 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1083  hypothetical protein  43.31 
 
 
134 aa  85.1  3e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2508  protein of unknown function DUF35  34.62 
 
 
132 aa  85.1  3e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.347955  normal  0.395372 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2363  hypothetical protein  33.61 
 
 
130 aa  82.4  0.000000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1392  hypothetical protein  32.56 
 
 
152 aa  81.3  0.000000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1625  hypothetical protein  32.79 
 
 
130 aa  77  0.00000000000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1934  hypothetical protein  30.33 
 
 
133 aa  73.2  0.000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0108502  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0149  hypothetical protein  30.33 
 
 
129 aa  69.7  0.00000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0984  hypothetical protein  33.6 
 
 
132 aa  60.8  0.000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1145  protein of unknown function DUF35  33.06 
 
 
133 aa  60.5  0.000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0574924  hitchhiker  0.0000746026 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0428  hypothetical protein  32.8 
 
 
131 aa  58.9  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0261769  normal  0.146814 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1979  protein of unknown function DUF35  29.03 
 
 
137 aa  57  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0353441  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5301  hypothetical protein  35.87 
 
 
143 aa  57  0.00000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.653983 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0436  protein of unknown function DUF35  27.84 
 
 
128 aa  56.6  0.0000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.686015  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3587  hypothetical protein  30.11 
 
 
137 aa  56.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.400148 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1880  hypothetical protein  33.33 
 
 
137 aa  55.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0682045 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5539  hypothetical protein  33.33 
 
 
141 aa  55.8  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5453  hypothetical protein  31.48 
 
 
152 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0654575  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5850  hypothetical protein  31.48 
 
 
152 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0806522  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3652  hypothetical protein  31.87 
 
 
136 aa  55.8  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.92305  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4021  protein of unknown function DUF35  30.43 
 
 
481 aa  55.5  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.605764  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2788  hypothetical protein  36.17 
 
 
132 aa  55.1  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.159844  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2932  hypothetical protein  34.62 
 
 
137 aa  55.5  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.241273  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1687  hypothetical protein  30.11 
 
 
137 aa  53.9  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0475632  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0510  hypothetical protein  36.26 
 
 
143 aa  53.5  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0387  hypothetical protein  32.88 
 
 
129 aa  53.5  0.000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.448785  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7489  hypothetical protein  34.09 
 
 
139 aa  52.4  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.840415  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1671  hypothetical protein  35.14 
 
 
152 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1695  hypothetical protein  35.14 
 
 
152 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0530  hypothetical protein  35.14 
 
 
152 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1644  hypothetical protein  35.14 
 
 
152 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.982412  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0553  hypothetical protein  35.14 
 
 
152 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0635  hypothetical protein  35.14 
 
 
152 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.525049  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1758  hypothetical protein  33.71 
 
 
130 aa  51.6  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.799098  normal  0.109738 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2010  hypothetical protein  33.33 
 
 
137 aa  51.6  0.000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.392361  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3871  hypothetical protein  32.54 
 
 
131 aa  51.6  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1501  hypothetical protein  33.02 
 
 
133 aa  50.8  0.000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4786  hypothetical protein  35.42 
 
 
144 aa  50.8  0.000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.259655  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2934  hypothetical protein  34.62 
 
 
144 aa  50.1  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.431872  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2015  hypothetical protein  30.49 
 
 
136 aa  49.7  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.196649  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3402  hypothetical protein  27.17 
 
 
136 aa  49.7  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0631046 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4633  hypothetical protein  30.43 
 
 
153 aa  49.7  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5644  hypothetical protein  33.78 
 
 
152 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2138  hypothetical protein  31.52 
 
 
321 aa  48.9  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0843  hypothetical protein  29.6 
 
 
145 aa  48.5  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2094  hypothetical protein  30.17 
 
 
128 aa  47.8  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3482  protein of unknown function DUF35  32.58 
 
 
319 aa  47.4  0.00008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.893274  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5254  hypothetical protein  32.94 
 
 
133 aa  46.6  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4194  protein of unknown function DUF35  28.87 
 
 
473 aa  46.6  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.492043  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4265  hypothetical protein  28.33 
 
 
146 aa  46.2  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.16799  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3388  hypothetical protein  24.8 
 
 
138 aa  46.6  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.809106  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3828  hypothetical protein  32.26 
 
 
132 aa  45.4  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2476  protein of unknown function DUF35  33.33 
 
 
134 aa  45.4  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.73466  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5112  hypothetical protein  32.28 
 
 
132 aa  46.2  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000923569  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0899  hypothetical protein  28.32 
 
 
131 aa  45.4  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.312493  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2675  hypothetical protein  31.96 
 
 
417 aa  46.2  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1497  protein of unknown function DUF35  32.58 
 
 
417 aa  45.4  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1925  protein of unknown function DUF35  28.78 
 
 
474 aa  45.1  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4072  hypothetical protein  30.12 
 
 
142 aa  45.4  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2520  hypothetical protein  27.05 
 
 
146 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.167569  normal  0.666068 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1804  hypothetical protein  29.87 
 
 
140 aa  45.1  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.983 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2106  hypothetical protein  36.23 
 
 
122 aa  44.7  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.283808  normal  0.0319762 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3906  hypothetical protein  26.27 
 
 
143 aa  44.3  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0256992  normal  0.0925623 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2152  hypothetical protein  38.46 
 
 
311 aa  44.3  0.0006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2840  protein of unknown function DUF35  31.91 
 
 
132 aa  44.3  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00189293  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3600  hypothetical protein  24.47 
 
 
140 aa  43.9  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0665674  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3240  hypothetical protein  26.15 
 
 
485 aa  43.9  0.0008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.57921  normal  0.496079 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0060  protein of unknown function DUF35  34.62 
 
 
136 aa  43.5  0.0009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4138  hypothetical protein  26.61 
 
 
146 aa  43.1  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.67568  normal  0.342554 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4045  hypothetical protein  29.91 
 
 
141 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.589309 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8196  hypothetical protein  31.87 
 
 
319 aa  43.5  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4566  putative thiolase subunit  33.33 
 
 
132 aa  42.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00449482  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2351  hypothetical protein  24.76 
 
 
130 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.387375  normal  0.674763 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2745  nucleic-acid-binding protein containing a Zn-ribbon  29.33 
 
 
135 aa  42.4  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0775897 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3114  hypothetical protein  25.71 
 
 
130 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0274298  normal  0.392807 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2337  protein of unknown function DUF35  32.47 
 
 
149 aa  42.4  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1903  hypothetical protein  32.26 
 
 
132 aa  42  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.539737  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6630  hypothetical protein  34.21 
 
 
120 aa  42.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0233518  normal  0.987358 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4153  hypothetical protein  30.11 
 
 
132 aa  42  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.280027  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3692  hypothetical protein  30.11 
 
 
550 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3765  hypothetical protein  30.11 
 
 
550 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.981168 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3705  hypothetical protein  29.49 
 
 
550 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.724372  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4017  hypothetical protein  31.52 
 
 
155 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.188869  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2483  hypothetical protein  32.14 
 
 
548 aa  41.6  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.207424 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5005  hypothetical protein  25.84 
 
 
129 aa  41.6  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.264526  normal  0.0828633 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1550  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25 
 
 
913 aa  41.2  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>