137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0836 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_0836  hypothetical protein  100 
 
 		 189 aa  391  1e-108  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0458  hypothetical protein  83.98 
 
 		 182 aa  327  8e-89  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1438  3-hydroxybutyryl-CoA epimerase  78.26 
 
 		 576 aa  316  1e-85  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.410853  normal  0.0151032 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0397  hypothetical protein  50.29 
 
 		 177 aa  183  1.0000000000000001e-45  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0674  protein of unknown function DUF35  48.59 
 
 		 178 aa  177  5.999999999999999e-44  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0436  protein of unknown function DUF35  46 
 
 		 128 aa  108  3e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.686015  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0387  hypothetical protein  39.81 
 
 		 129 aa  103  2e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.448785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1310  hypothetical protein  40.87 
 
 		 151 aa  96.3  2e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.120998 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1832  hypothetical protein  33.93 
 
 		 138 aa  75.5  0.0000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0184205  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1357  hypothetical protein  35.96 
 
 		 132 aa  69.3  0.00000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3600  hypothetical protein  30.56 
 
 		 140 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0665674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0377  hypothetical protein  31.52 
 
 		 130 aa  67  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.253705  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1459  hypothetical protein  31.52 
 
 		 130 aa  66.6  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0155  hypothetical protein  32.69 
 
 		 130 aa  66.6  0.0000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0859  hypothetical protein  37.65 
 
 		 132 aa  64.7  0.0000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0302426  normal  0.401608 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0794  hypothetical protein  33.33 
 
 		 133 aa  63.2  0.000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1934  hypothetical protein  32.99 
 
 		 133 aa  62.4  0.000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0108502  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5539  hypothetical protein  36.89 
 
 		 141 aa  62.8  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0460  hypothetical protein  30.43 
 
 		 130 aa  62.8  0.000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0490887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1083  hypothetical protein  37.93 
 
 		 134 aa  61.6  0.000000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2508  protein of unknown function DUF35  33.33 
 
 		 132 aa  61.6  0.000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.347955  normal  0.395372 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0766  hypothetical protein  30.43 
 
 		 135 aa  61.2  0.000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.48862  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0023  hypothetical protein  31.03 
 
 		 130 aa  60.8  0.00000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5278  hypothetical protein  27.35 
 
 		 135 aa  60.1  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0598  protein of unknown function DUF35  30.43 
 
 		 127 aa  60.1  0.00000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1392  hypothetical protein  31.48 
 
 		 152 aa  60.5  0.00000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0812  hypothetical protein  32.46 
 
 		 134 aa  60.5  0.00000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.553396  hitchhiker  0.000113363 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5005  hypothetical protein  29.06 
 
 		 129 aa  60.1  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.264526  normal  0.0828633 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0340  protein of unknown function DUF35  30.61 
 
 		 134 aa  59.3  0.00000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.0000262786  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1625  hypothetical protein  30.36 
 
 		 130 aa  59.7  0.00000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2840  protein of unknown function DUF35  29.84 
 
 		 132 aa  59.3  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00189293  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0528  hypothetical protein  28.26 
 
 		 129 aa  59.3  0.00000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.825077  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0549  hypothetical protein  28.87 
 
 		 132 aa  58.9  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1602  hypothetical protein  29.66 
 
 		 143 aa  59.3  0.00000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2363  hypothetical protein  30.21 
 
 		 130 aa  58.9  0.00000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3114  hypothetical protein  31.68 
 
 		 130 aa  58.5  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0274298  normal  0.392807 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3606  protein of unknown function DUF35  30.69 
 
 		 130 aa  57.8  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.215549  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2351  hypothetical protein  30.69 
 
 		 130 aa  57.4  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.387375  normal  0.674763 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3090  protein of unknown function DUF35  34.19 
 
 		 335 aa  57  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.736409  normal  0.697465 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5554  hypothetical protein  32.53 
 
 		 157 aa  57  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0317  protein of unknown function DUF35  35.63 
 
 		 124 aa  56.6  0.0000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5112  hypothetical protein  30.17 
 
 		 132 aa  56.6  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000923569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7489  hypothetical protein  25.71 
 
 		 139 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.840415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3906  hypothetical protein  29.17 
 
 		 143 aa  56.2  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0256992  normal  0.0925623 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3932  protein of unknown function DUF35  32.56 
 
 		 144 aa  55.8  0.0000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3672  hypothetical protein  31.45 
 
 		 141 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.108807  normal  0.573153 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1979  protein of unknown function DUF35  28.21 
 
 		 137 aa  55.5  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0353441  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5301  hypothetical protein  29.41 
 
 		 143 aa  54.7  0.0000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.653983 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3659  hypothetical protein  30 
 
 		 137 aa  54.7  0.0000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.17734  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3732  hypothetical protein  30 
 
 		 137 aa  54.7  0.0000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.315586 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5281  hypothetical protein  33.73 
 
 		 146 aa  54.3  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1687  hypothetical protein  28.97 
 
 		 137 aa  54.3  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0475632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5254  hypothetical protein  28.57 
 
 		 133 aa  53.9  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4138  hypothetical protein  30.83 
 
 		 146 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.67568  normal  0.342554 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1609  protein of unknown function DUF35  31.37 
 
 		 133 aa  53.1  0.000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2520  hypothetical protein  30 
 
 		 146 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.167569  normal  0.666068 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3388  hypothetical protein  28.93 
 
 		 138 aa  53.1  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.809106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2932  hypothetical protein  28.57 
 
 		 137 aa  52.8  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.241273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2010  hypothetical protein  29.59 
 
 		 137 aa  52.8  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.392361  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1497  protein of unknown function DUF35  32.61 
 
 		 417 aa  52.4  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3311  hypothetical protein  30 
 
 		 135 aa  52.4  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.367067 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0149  hypothetical protein  26.73 
 
 		 129 aa  52  0.000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1880  hypothetical protein  27.59 
 
 		 137 aa  52  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0682045 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5775  protein of unknown function DUF35  25.69 
 
 		 129 aa  52  0.000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0423668  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3511  hypothetical protein  30 
 
 		 131 aa  51.6  0.000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1804  hypothetical protein  28.1 
 
 		 140 aa  51.6  0.000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.983 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1758  hypothetical protein  29.06 
 
 		 130 aa  51.2  0.000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.799098  normal  0.109738 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3587  hypothetical protein  27.35 
 
 		 137 aa  50.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.400148 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1485  hypothetical protein  36.25 
 
 		 134 aa  50.1  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.208143  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0178  hypothetical protein  24.35 
 
 		 134 aa  49.7  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.82614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0902  hypothetical protein  31.45 
 
 		 140 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0235  hypothetical protein  24.36 
 
 		 136 aa  50.1  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.737012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0268  hypothetical protein  33.33 
 
 		 141 aa  50.1  0.00002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00125281  normal  0.120379 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8196  hypothetical protein  26.23 
 
 		 319 aa  50.1  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0899  hypothetical protein  33.01 
 
 		 131 aa  49.7  0.00003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.312493  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3818  protein of unknown function DUF35  30.17 
 
 		 320 aa  49.7  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.704476  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1501  hypothetical protein  25 
 
 		 133 aa  49.3  0.00003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0510  hypothetical protein  33 
 
 		 143 aa  48.9  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2476  protein of unknown function DUF35  26.47 
 
 		 134 aa  49.3  0.00004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.73466  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2783  protein of unknown function DUF35  30.26 
 
 		 165 aa  48.5  0.00005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.103009  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3255  putative short chain dehydrogenase  29.55 
 
 		 413 aa  48.9  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.695501  normal  0.516031 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4132  hypothetical protein  28.45 
 
 		 149 aa  48.5  0.00006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.479777  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2582  hypothetical protein  24.56 
 
 		 123 aa  48.5  0.00006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.709226  normal  0.0256768 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2094  hypothetical protein  29.11 
 
 		 128 aa  48.1  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2152  hypothetical protein  26.67 
 
 		 311 aa  48.1  0.00007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1336  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.05 
 
 		 418 aa  48.1  0.00008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4045  hypothetical protein  28.85 
 
 		 141 aa  48.1  0.00008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.589309 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2378  hypothetical protein  28.93 
 
 		 143 aa  47.8  0.00009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.301734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3652  hypothetical protein  31.09 
 
 		 136 aa  47.8  0.00009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.92305  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0854  protein of unknown function DUF35  30.12 
 
 		 116 aa  47.4  0.0001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0219431  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3806  hypothetical protein  27.72 
 
 		 132 aa  47  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2337  protein of unknown function DUF35  27.72 
 
 		 149 aa  47.4  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3780  protein of unknown function DUF35  26.05 
 
 		 126 aa  47.4  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.000111928  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0128  hypothetical protein  23.85 
 
 		 127 aa  47.8  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0269  hypothetical protein  30.38 
 
 		 165 aa  47.8  0.0001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000709024  normal  0.121609 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1009  hypothetical protein  30.12 
 
 		 97 aa  47.8  0.0001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00901236 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0146  protein of unknown function DUF35  23.85 
 
 		 127 aa  47.8  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4786  hypothetical protein  23.76 
 
 		 144 aa  47  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.259655  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3541  hypothetical protein  27.71 
 
 		 156 aa  46.6  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0915855 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2934  hypothetical protein  27.27 
 
 		 144 aa  47  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.431872  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>