178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0859 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0859  hypothetical protein  100 
 
 		 132 aa  270  5.000000000000001e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0302426  normal  0.401608 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5254  hypothetical protein  34.48 
 
 		 133 aa  103  9e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5301  hypothetical protein  39.2 
 
 		 143 aa  97.1  7e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.653983 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1602  hypothetical protein  32.33 
 
 		 143 aa  95.9  1e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2101  hypothetical protein  39.1 
 
 		 139 aa  96.7  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.416637  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3606  protein of unknown function DUF35  33.87 
 
 		 130 aa  87  8e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.215549  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3951  hypothetical protein  40 
 
 		 121 aa  86.7  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.26677  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1832  hypothetical protein  34.51 
 
 		 138 aa  85.9  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0184205  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2337  protein of unknown function DUF35  36.29 
 
 		 149 aa  85.5  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5005  hypothetical protein  34.96 
 
 		 129 aa  85.9  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.264526  normal  0.0828633 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3973  hypothetical protein  41.28 
 
 		 125 aa  83.2  0.000000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.370228 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1671  hypothetical protein  38.54 
 
 		 152 aa  82.4  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5644  hypothetical protein  35.71 
 
 		 152 aa  82.4  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1695  hypothetical protein  38.54 
 
 		 152 aa  82.4  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0530  hypothetical protein  38.54 
 
 		 152 aa  82.4  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1644  hypothetical protein  38.54 
 
 		 152 aa  82.4  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.982412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0553  hypothetical protein  38.54 
 
 		 152 aa  82.4  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0635  hypothetical protein  38.54 
 
 		 152 aa  82.4  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.525049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1804  hypothetical protein  30.43 
 
 		 140 aa  81.3  0.000000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.983 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7489  hypothetical protein  30.91 
 
 		 139 aa  80.5  0.000000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.840415  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2351  hypothetical protein  33.33 
 
 		 130 aa  80.5  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.387375  normal  0.674763 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4045  hypothetical protein  31.62 
 
 		 141 aa  80.1  0.000000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.589309 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5453  hypothetical protein  37.5 
 
 		 152 aa  79.7  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0654575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5850  hypothetical protein  37.5 
 
 		 152 aa  79.7  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0806522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2745  nucleic-acid-binding protein containing a Zn-ribbon  29.92 
 
 		 135 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0775897 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2138  hypothetical protein  32.23 
 
 		 321 aa  79  0.00000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4005  hypothetical protein  36.84 
 
 		 134 aa  78.2  0.00000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.214613  normal  0.145061 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0510  hypothetical protein  34.17 
 
 		 143 aa  77.8  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3114  hypothetical protein  32.26 
 
 		 130 aa  77.8  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0274298  normal  0.392807 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2932  hypothetical protein  33.9 
 
 		 137 aa  78.2  0.00000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.241273  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0235  hypothetical protein  30.77 
 
 		 136 aa  77.8  0.00000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.737012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2152  hypothetical protein  29.41 
 
 		 311 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3600  hypothetical protein  33.05 
 
 		 140 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0665674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2010  hypothetical protein  33.61 
 
 		 137 aa  77  0.00000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.392361  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1687  hypothetical protein  31.97 
 
 		 137 aa  75.5  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0475632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1979  protein of unknown function DUF35  29.51 
 
 		 137 aa  75.5  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0353441  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1903  hypothetical protein  33.33 
 
 		 132 aa  75.1  0.0000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.539737  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2106  hypothetical protein  36.61 
 
 		 122 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.283808  normal  0.0319762 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1880  hypothetical protein  30.33 
 
 		 137 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0682045 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4072  hypothetical protein  40.32 
 
 		 142 aa  74.7  0.0000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3482  protein of unknown function DUF35  31.09 
 
 		 319 aa  73.9  0.0000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.893274  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3885  hypothetical protein  38.68 
 
 		 117 aa  73.6  0.0000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2366  hypothetical protein  27.69 
 
 		 152 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.206302  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0582  hypothetical protein  31.82 
 
 		 137 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00877368  normal  0.438267 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1758  hypothetical protein  29.41 
 
 		 130 aa  73.2  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.799098  normal  0.109738 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3652  hypothetical protein  30 
 
 		 136 aa  73.2  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.92305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5278  hypothetical protein  39.6 
 
 		 135 aa  73.2  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0860  hypothetical protein  31.4 
 
 		 138 aa  72.4  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3214  hypothetical protein  34.19 
 
 		 145 aa  72.4  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.907218  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3276  hypothetical protein  34.19 
 
 		 145 aa  72.4  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3225  hypothetical protein  34.19 
 
 		 145 aa  72.4  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.730825  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3587  hypothetical protein  28.69 
 
 		 137 aa  71.6  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.400148 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4493  hypothetical protein  30.3 
 
 		 148 aa  71.6  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2821  hypothetical protein  32.76 
 
 		 315 aa  71.2  0.000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.875118  normal  0.0237416 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1501  hypothetical protein  27.59 
 
 		 133 aa  71.2  0.000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0616  hypothetical protein  30.77 
 
 		 176 aa  70.5  0.000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.11399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1972  nucleic-acid-binding protein containing a Zn-ribbon-like protein  29.17 
 
 		 150 aa  70.5  0.000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3402  hypothetical protein  33.33 
 
 		 136 aa  70.5  0.000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0631046 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1994  hypothetical protein  33.03 
 
 		 120 aa  70.5  0.000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.253194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6630  hypothetical protein  38.94 
 
 		 120 aa  70.1  0.000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0233518  normal  0.987358 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3568  hypothetical protein  36.11 
 
 		 118 aa  69.7  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2662  hypothetical protein  31.25 
 
 		 136 aa  69.7  0.00000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8196  hypothetical protein  31.03 
 
 		 319 aa  69.7  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4265  hypothetical protein  27.59 
 
 		 146 aa  69.7  0.00000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.16799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4786  hypothetical protein  30.65 
 
 		 144 aa  69.3  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.259655  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3806  hypothetical protein  30.25 
 
 		 132 aa  69.3  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2015  hypothetical protein  32.73 
 
 		 136 aa  68.9  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.196649  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3313  hypothetical protein  39.42 
 
 		 121 aa  68.6  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4268  hypothetical protein  30.77 
 
 		 140 aa  68.2  0.00000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.450465 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1497  protein of unknown function DUF35  36.63 
 
 		 417 aa  68.2  0.00000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3692  hypothetical protein  31.5 
 
 		 550 aa  67.8  0.00000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3765  hypothetical protein  31.5 
 
 		 550 aa  67.8  0.00000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.981168 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2675  hypothetical protein  35.9 
 
 		 417 aa  67.4  0.00000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1027  hypothetical protein  25.6 
 
 		 175 aa  67.8  0.00000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5554  hypothetical protein  29.82 
 
 		 157 aa  67.4  0.00000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4054  hypothetical protein  32.48 
 
 		 151 aa  67.4  0.00000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0163629  normal  0.53534 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0351  hypothetical protein  31.73 
 
 		 141 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000546433  hitchhiker  0.00000644081 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3323  protein of unknown function DUF35  38.53 
 
 		 125 aa  67  0.00000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00494403  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2788  hypothetical protein  31.78 
 
 		 132 aa  67  0.00000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.159844  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0032  hypothetical protein  29.91 
 
 		 138 aa  67  0.00000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.662095  normal  0.14279 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1310  hypothetical protein  31.82 
 
 		 151 aa  66.2  0.0000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.120998 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3705  hypothetical protein  31.5 
 
 		 550 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.724372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2378  hypothetical protein  29.06 
 
 		 143 aa  65.5  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.301734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4323  hypothetical protein  34.4 
 
 		 541 aa  65.9  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.51495 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3541  hypothetical protein  30 
 
 		 156 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0915855 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0899  hypothetical protein  29.55 
 
 		 131 aa  65.9  0.0000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.312493  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0843  hypothetical protein  32.98 
 
 		 145 aa  66.2  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8760  protein of unknown function DUF35  27.69 
 
 		 140 aa  65.9  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.108371 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0836  hypothetical protein  37.65 
 
 		 189 aa  64.7  0.0000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0060  protein of unknown function DUF35  30.47 
 
 		 136 aa  63.9  0.0000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0387  hypothetical protein  31.03 
 
 		 129 aa  63.2  0.000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.448785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5500  hypothetical protein  30.65 
 
 		 132 aa  62.8  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2934  hypothetical protein  32.61 
 
 		 144 aa  62.8  0.000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.431872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2623  hypothetical protein  35.34 
 
 		 305 aa  62.4  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.140164  normal  0.486862 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3828  hypothetical protein  29.51 
 
 		 132 aa  62.8  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0892  hypothetical protein  27.68 
 
 		 142 aa  62.4  0.000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.204366  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0042  hypothetical protein  28.21 
 
 		 138 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0051  hypothetical protein  28.21 
 
 		 138 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0173713  normal  0.0421472 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3511  hypothetical protein  30.09 
 
 		 131 aa  61.6  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5281  hypothetical protein  32.41 
 
 		 146 aa  62  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>