126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2276 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2276  hypothetical protein  100 
 
 		 123 aa  242  1.9999999999999999e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.501265 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2582  hypothetical protein  59.02 
 
 		 123 aa  137  4.999999999999999e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.709226  normal  0.0256768 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0343  hypothetical protein  55.75 
 
 		 119 aa  126  9.000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.619973  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6844  hypothetical protein  43.8 
 
 		 121 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51200  hypothetical protein  49.57 
 
 		 128 aa  108  3e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.719355  hitchhiker  0.00000582925 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4369  hypothetical protein  49.57 
 
 		 127 aa  107  6e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1073  hypothetical protein  45.9 
 
 		 128 aa  92  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5775  protein of unknown function DUF35  49.07 
 
 		 129 aa  91.3  4e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0423668  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0128  hypothetical protein  43.1 
 
 		 127 aa  90.9  5e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0146  protein of unknown function DUF35  43.1 
 
 		 127 aa  91.3  5e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3511  hypothetical protein  40.98 
 
 		 131 aa  87.4  7e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5278  hypothetical protein  41.35 
 
 		 135 aa  83.6  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0178  hypothetical protein  36.21 
 
 		 134 aa  78.6  0.00000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.82614  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5112  hypothetical protein  38.84 
 
 		 132 aa  77  0.00000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000923569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5254  hypothetical protein  31.53 
 
 		 133 aa  62.8  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5005  hypothetical protein  31.62 
 
 		 129 aa  62  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.264526  normal  0.0828633 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1758  hypothetical protein  29.82 
 
 		 130 aa  62  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.799098  normal  0.109738 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3482  protein of unknown function DUF35  36.73 
 
 		 319 aa  61.6  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.893274  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4412  hypothetical protein  36.61 
 
 		 132 aa  61.2  0.000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000585754  normal  0.649702 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3806  hypothetical protein  33.33 
 
 		 132 aa  60.1  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5096  hypothetical protein  34.23 
 
 		 128 aa  59.7  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1832  hypothetical protein  31.97 
 
 		 138 aa  58.2  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0184205  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2101  hypothetical protein  40.78 
 
 		 139 aa  58.2  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.416637  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2932  hypothetical protein  35.05 
 
 		 137 aa  57.8  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.241273  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0351  hypothetical protein  38.24 
 
 		 141 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000546433  hitchhiker  0.00000644081 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3214  hypothetical protein  37.29 
 
 		 145 aa  57  0.00000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.907218  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2788  hypothetical protein  35.78 
 
 		 132 aa  57  0.00000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.159844  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3276  hypothetical protein  37.29 
 
 		 145 aa  57  0.00000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3225  hypothetical protein  37.29 
 
 		 145 aa  57  0.00000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.730825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2378  hypothetical protein  36.08 
 
 		 143 aa  57  0.00000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.301734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0860  hypothetical protein  36.73 
 
 		 138 aa  55.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4268  hypothetical protein  34.69 
 
 		 140 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.450465 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1501  hypothetical protein  25.93 
 
 		 133 aa  54.7  0.0000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0859  hypothetical protein  29.63 
 
 		 132 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0302426  normal  0.401608 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4153  hypothetical protein  32.74 
 
 		 132 aa  53.5  0.0000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.280027  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4045  hypothetical protein  32.48 
 
 		 141 aa  53.5  0.0000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.589309 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5500  hypothetical protein  30.77 
 
 		 132 aa  53.1  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0397  hypothetical protein  33.66 
 
 		 177 aa  52.8  0.000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2010  hypothetical protein  28.87 
 
 		 137 aa  53.1  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.392361  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3587  hypothetical protein  30.48 
 
 		 137 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.400148 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0032  hypothetical protein  35.71 
 
 		 138 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.662095  normal  0.14279 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0060  protein of unknown function DUF35  31.31 
 
 		 136 aa  52.4  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3318  hypothetical protein  38.95 
 
 		 312 aa  52.4  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000206651 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7489  hypothetical protein  31.62 
 
 		 139 aa  52  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.840415  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1979  protein of unknown function DUF35  28.04 
 
 		 137 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0353441  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0428  hypothetical protein  33.66 
 
 		 131 aa  51.6  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0261769  normal  0.146814 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2351  hypothetical protein  28.83 
 
 		 130 aa  51.6  0.000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.387375  normal  0.674763 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0510  hypothetical protein  34.69 
 
 		 143 aa  51.6  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3114  hypothetical protein  28.32 
 
 		 130 aa  50.8  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0274298  normal  0.392807 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4265  hypothetical protein  33 
 
 		 146 aa  50.8  0.000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.16799  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3606  protein of unknown function DUF35  28.07 
 
 		 130 aa  50.4  0.000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.215549  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0340  protein of unknown function DUF35  27.27 
 
 		 134 aa  50.4  0.000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.0000262786  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2106  hypothetical protein  32.71 
 
 		 122 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.283808  normal  0.0319762 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0042  hypothetical protein  34.69 
 
 		 138 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0051  hypothetical protein  34.69 
 
 		 138 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0173713  normal  0.0421472 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5255  hypothetical protein  43.18 
 
 		 324 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.338508 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0235  hypothetical protein  31.07 
 
 		 136 aa  50.1  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.737012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2015  hypothetical protein  29.91 
 
 		 136 aa  50.1  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.196649  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1880  hypothetical protein  27.62 
 
 		 137 aa  48.9  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0682045 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5220  hypothetical protein  30.28 
 
 		 330 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.146278  normal  0.27671 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3973  hypothetical protein  35.45 
 
 		 125 aa  49.3  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.370228 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1310  hypothetical protein  30.61 
 
 		 151 aa  48.9  0.00002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.120998 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5301  hypothetical protein  31.31 
 
 		 143 aa  49.3  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.653983 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4674  hypothetical protein  38.37 
 
 		 318 aa  48.1  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4760  hypothetical protein  38.37 
 
 		 318 aa  48.1  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.247642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5059  hypothetical protein  38.37 
 
 		 317 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.945383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0984  hypothetical protein  32.67 
 
 		 132 aa  48.5  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4634  hypothetical protein  29.36 
 
 		 338 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.185588  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8196  hypothetical protein  30.84 
 
 		 319 aa  48.1  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4722  hypothetical protein  29.36 
 
 		 338 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5016  hypothetical protein  29.36 
 
 		 338 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2821  hypothetical protein  36.08 
 
 		 315 aa  47.8  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.875118  normal  0.0237416 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4786  hypothetical protein  31.07 
 
 		 144 aa  47.8  0.00006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.259655  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1687  hypothetical protein  27.83 
 
 		 137 aa  47.4  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0475632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2732  hypothetical protein  29.09 
 
 		 319 aa  47  0.00008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0899  hypothetical protein  35.05 
 
 		 131 aa  46.2  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.312493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1459  hypothetical protein  26.26 
 
 		 130 aa  46.6  0.0001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4493  hypothetical protein  26.89 
 
 		 148 aa  47  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3828  hypothetical protein  30.48 
 
 		 132 aa  46.2  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3818  protein of unknown function DUF35  31.9 
 
 		 320 aa  45.4  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.704476  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0549  hypothetical protein  30.25 
 
 		 132 aa  45.8  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5539  hypothetical protein  27.59 
 
 		 141 aa  45.8  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3402  hypothetical protein  36.14 
 
 		 136 aa  45.4  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0631046 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4633  hypothetical protein  31.9 
 
 		 153 aa  45.8  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1602  hypothetical protein  32.35 
 
 		 143 aa  45.4  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0377  hypothetical protein  26.26 
 
 		 130 aa  45.4  0.0003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.253705  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0436  protein of unknown function DUF35  23.96 
 
 		 128 aa  45.1  0.0004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.686015  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5453  hypothetical protein  31.76 
 
 		 152 aa  44.3  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0654575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5850  hypothetical protein  31.76 
 
 		 152 aa  44.3  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0806522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1538  hypothetical protein  29.36 
 
 		 332 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1934  hypothetical protein  28.1 
 
 		 133 aa  44.3  0.0006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0108502  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0387  hypothetical protein  25.81 
 
 		 129 aa  44.3  0.0006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.448785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3600  hypothetical protein  27.03 
 
 		 140 aa  43.9  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0665674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3313  hypothetical protein  32.38 
 
 		 121 aa  43.9  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8760  protein of unknown function DUF35  32.5 
 
 		 140 aa  43.9  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.108371 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0674  protein of unknown function DUF35  25.23 
 
 		 178 aa  43.1  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5644  hypothetical protein  32.14 
 
 		 152 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2363  hypothetical protein  30.84 
 
 		 130 aa  43.1  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13554  hypothetical protein  26.61 
 
 		 334 aa  43.5  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000150735 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0460  hypothetical protein  24.24 
 
 		 130 aa  43.1  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0490887  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>