79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_51200 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_51200  hypothetical protein  100 
 
 		 128 aa  261  3e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.719355  hitchhiker  0.00000582925 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4369  hypothetical protein  91.41 
 
 		 127 aa  236  1e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0343  hypothetical protein  55.65 
 
 		 119 aa  123  1e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.619973  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6844  hypothetical protein  52.17 
 
 		 121 aa  115  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5278  hypothetical protein  49.17 
 
 		 135 aa  115  1.9999999999999998e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0146  protein of unknown function DUF35  52.1 
 
 		 127 aa  115  3e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0128  hypothetical protein  52.1 
 
 		 127 aa  114  3.9999999999999997e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2582  hypothetical protein  52.46 
 
 		 123 aa  112  2.0000000000000002e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.709226  normal  0.0256768 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2276  hypothetical protein  49.57 
 
 		 123 aa  108  3e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.501265 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5775  protein of unknown function DUF35  49.57 
 
 		 129 aa  104  4e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0423668  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0178  hypothetical protein  47.83 
 
 		 134 aa  102  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.82614  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3511  hypothetical protein  44.95 
 
 		 131 aa  100  6e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5112  hypothetical protein  41.8 
 
 		 132 aa  99.4  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000923569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1073  hypothetical protein  44.66 
 
 		 128 aa  85.5  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5254  hypothetical protein  38.17 
 
 		 133 aa  79.7  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5096  hypothetical protein  40.18 
 
 		 128 aa  73.2  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3806  hypothetical protein  40 
 
 		 132 aa  71.6  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4412  hypothetical protein  38.52 
 
 		 132 aa  68.9  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000585754  normal  0.649702 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2378  hypothetical protein  37.07 
 
 		 143 aa  67.8  0.00000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.301734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4268  hypothetical protein  35.34 
 
 		 140 aa  64.7  0.0000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.450465 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1602  hypothetical protein  26.5 
 
 		 143 aa  61.6  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5301  hypothetical protein  33.58 
 
 		 143 aa  60.8  0.000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.653983 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0860  hypothetical protein  38.71 
 
 		 138 aa  59.7  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0032  hypothetical protein  34.48 
 
 		 138 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.662095  normal  0.14279 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2010  hypothetical protein  38.89 
 
 		 137 aa  59.3  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.392361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1758  hypothetical protein  33.01 
 
 		 130 aa  58.9  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.799098  normal  0.109738 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5500  hypothetical protein  35.4 
 
 		 132 aa  58.9  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1832  hypothetical protein  34.48 
 
 		 138 aa  58.2  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0184205  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0051  hypothetical protein  33.62 
 
 		 138 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0173713  normal  0.0421472 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0042  hypothetical protein  33.62 
 
 		 138 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0317  protein of unknown function DUF35  29.25 
 
 		 124 aa  57.4  0.00000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3828  hypothetical protein  33.6 
 
 		 132 aa  57  0.00000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0235  hypothetical protein  35.19 
 
 		 136 aa  57  0.00000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.737012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4566  putative thiolase subunit  32.76 
 
 		 132 aa  56.2  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00449482  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4786  hypothetical protein  33.04 
 
 		 144 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.259655  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4153  hypothetical protein  38.68 
 
 		 132 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.280027  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2337  protein of unknown function DUF35  30.33 
 
 		 149 aa  55.1  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5005  hypothetical protein  28.57 
 
 		 129 aa  55.5  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.264526  normal  0.0828633 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2934  hypothetical protein  34.18 
 
 		 144 aa  54.3  0.0000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.431872  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2662  hypothetical protein  31.68 
 
 		 136 aa  54.3  0.0000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1880  hypothetical protein  38.64 
 
 		 137 aa  54.3  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0682045 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4045  hypothetical protein  32.54 
 
 		 141 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.589309 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1979  protein of unknown function DUF35  37.5 
 
 		 137 aa  53.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0353441  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1501  hypothetical protein  29.66 
 
 		 133 aa  52.4  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3587  hypothetical protein  37.5 
 
 		 137 aa  51.6  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.400148 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5539  hypothetical protein  27.52 
 
 		 141 aa  51.2  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0843  hypothetical protein  29.03 
 
 		 145 aa  51.2  0.000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7489  hypothetical protein  29.57 
 
 		 139 aa  50.4  0.000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.840415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2932  hypothetical protein  31.96 
 
 		 137 aa  49.3  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.241273  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0859  hypothetical protein  30.58 
 
 		 132 aa  48.1  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0302426  normal  0.401608 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4493  hypothetical protein  32.54 
 
 		 148 aa  48.1  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1994  hypothetical protein  36.47 
 
 		 120 aa  45.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.253194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3402  hypothetical protein  34.91 
 
 		 136 aa  45.8  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0631046 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3932  protein of unknown function DUF35  31.87 
 
 		 144 aa  45.8  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3568  hypothetical protein  32.67 
 
 		 118 aa  46.2  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2152  hypothetical protein  34.94 
 
 		 311 aa  45.1  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0854  protein of unknown function DUF35  28.4 
 
 		 116 aa  44.7  0.0004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0219431  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1804  hypothetical protein  26.14 
 
 		 140 aa  44.7  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.983 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3600  hypothetical protein  27.27 
 
 		 140 aa  44.3  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0665674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1687  hypothetical protein  31.11 
 
 		 137 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0475632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2101  hypothetical protein  31.07 
 
 		 139 aa  42.7  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.416637  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5281  hypothetical protein  30 
 
 		 146 aa  43.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0530  hypothetical protein  30.21 
 
 		 152 aa  42.4  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0553  hypothetical protein  30.21 
 
 		 152 aa  42.4  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3276  hypothetical protein  30.09 
 
 		 145 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0635  hypothetical protein  30.21 
 
 		 152 aa  42.4  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.525049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1695  hypothetical protein  30.21 
 
 		 152 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2015  hypothetical protein  29.36 
 
 		 136 aa  42.7  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.196649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1644  hypothetical protein  30.21 
 
 		 152 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.982412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3225  hypothetical protein  30.09 
 
 		 145 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.730825  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3214  hypothetical protein  30.09 
 
 		 145 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.907218  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1671  hypothetical protein  30.21 
 
 		 152 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3313  hypothetical protein  33.33 
 
 		 121 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3973  hypothetical protein  29.66 
 
 		 125 aa  40.8  0.006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.370228 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5850  hypothetical protein  29.17 
 
 		 152 aa  40.8  0.007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0806522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5453  hypothetical protein  29.17 
 
 		 152 aa  40.8  0.007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0654575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3255  putative short chain dehydrogenase  28.07 
 
 		 413 aa  40.4  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.695501  normal  0.516031 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8760  protein of unknown function DUF35  24.62 
 
 		 140 aa  40.4  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.108371 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1392  hypothetical protein  28.71 
 
 		 152 aa  40  0.01  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>