87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_3568 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_3568  hypothetical protein  100 
 
 		 118 aa  245  1e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3313  hypothetical protein  59.83 
 
 		 121 aa  148  3e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2106  hypothetical protein  58.33 
 
 		 122 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.283808  normal  0.0319762 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3951  hypothetical protein  59.32 
 
 		 121 aa  130  6e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.26677  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4005  hypothetical protein  45.79 
 
 		 134 aa  106  1e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.214613  normal  0.145061 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3885  hypothetical protein  36.54 
 
 		 117 aa  72.8  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0859  hypothetical protein  36.11 
 
 		 132 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0302426  normal  0.401608 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3973  hypothetical protein  34.91 
 
 		 125 aa  68.9  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.370228 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7489  hypothetical protein  33.33 
 
 		 139 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.840415  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3511  hypothetical protein  43.84 
 
 		 131 aa  61.2  0.000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2337  protein of unknown function DUF35  33.33 
 
 		 149 aa  60.5  0.000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1832  hypothetical protein  30.84 
 
 		 138 aa  60.1  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0184205  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2932  hypothetical protein  34.26 
 
 		 137 aa  60.1  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.241273  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3587  hypothetical protein  40 
 
 		 137 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.400148 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1880  hypothetical protein  42.67 
 
 		 137 aa  58.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0682045 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1687  hypothetical protein  42.47 
 
 		 137 aa  58.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0475632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5278  hypothetical protein  34.04 
 
 		 135 aa  58.2  0.00000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1979  protein of unknown function DUF35  41.33 
 
 		 137 aa  58.2  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0353441  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4072  hypothetical protein  34.86 
 
 		 142 aa  57.4  0.00000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5254  hypothetical protein  32.98 
 
 		 133 aa  57  0.00000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0146  protein of unknown function DUF35  32.04 
 
 		 127 aa  56.2  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0128  hypothetical protein  32.04 
 
 		 127 aa  55.8  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0178  hypothetical protein  40 
 
 		 134 aa  54.7  0.0000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.82614  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5301  hypothetical protein  30 
 
 		 143 aa  54.7  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.653983 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5112  hypothetical protein  37.66 
 
 		 132 aa  53.9  0.0000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000923569  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1602  hypothetical protein  26.36 
 
 		 143 aa  53.5  0.0000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5644  hypothetical protein  34.26 
 
 		 152 aa  53.9  0.0000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5453  hypothetical protein  35.14 
 
 		 152 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0654575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5850  hypothetical protein  35.14 
 
 		 152 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0806522  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0317  protein of unknown function DUF35  30.19 
 
 		 124 aa  52.8  0.000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0854  protein of unknown function DUF35  26.6 
 
 		 116 aa  52.4  0.000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0219431  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0635  hypothetical protein  33.78 
 
 		 152 aa  52  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.525049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0553  hypothetical protein  33.78 
 
 		 152 aa  52  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1695  hypothetical protein  33.78 
 
 		 152 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0530  hypothetical protein  33.78 
 
 		 152 aa  52  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1671  hypothetical protein  33.78 
 
 		 152 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2010  hypothetical protein  37.33 
 
 		 137 aa  52  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.392361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1644  hypothetical protein  33.78 
 
 		 152 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.982412  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4412  hypothetical protein  40 
 
 		 132 aa  52  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000585754  normal  0.649702 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3323  protein of unknown function DUF35  34.91 
 
 		 125 aa  51.6  0.000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00494403  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5005  hypothetical protein  31.48 
 
 		 129 aa  51.2  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.264526  normal  0.0828633 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0235  hypothetical protein  36.63 
 
 		 136 aa  51.6  0.000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.737012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4045  hypothetical protein  34.78 
 
 		 141 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.589309 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4606  hypothetical protein  38.81 
 
 		 109 aa  49.7  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3114  hypothetical protein  32.14 
 
 		 130 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0274298  normal  0.392807 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6630  hypothetical protein  32.67 
 
 		 120 aa  50.1  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0233518  normal  0.987358 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2351  hypothetical protein  31.19 
 
 		 130 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.387375  normal  0.674763 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3606  protein of unknown function DUF35  32.14 
 
 		 130 aa  48.9  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.215549  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1994  hypothetical protein  35.53 
 
 		 120 aa  49.3  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.253194  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0149  hypothetical protein  31.18 
 
 		 129 aa  48.9  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0860  hypothetical protein  31.31 
 
 		 138 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4153  hypothetical protein  37.84 
 
 		 132 aa  48.1  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.280027  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2745  nucleic-acid-binding protein containing a Zn-ribbon  30.39 
 
 		 135 aa  47.8  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0775897 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2138  hypothetical protein  29.25 
 
 		 321 aa  47.4  0.00007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5775  protein of unknown function DUF35  34.72 
 
 		 129 aa  47  0.00009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0423668  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5500  hypothetical protein  33.64 
 
 		 132 aa  46.6  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2934  hypothetical protein  28.97 
 
 		 144 aa  46.6  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.431872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1972  nucleic-acid-binding protein containing a Zn-ribbon-like protein  28.44 
 
 		 150 aa  46.2  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3402  hypothetical protein  36.78 
 
 		 136 aa  46.6  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0631046 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1804  hypothetical protein  26.67 
 
 		 140 aa  45.4  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.983 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1758  hypothetical protein  31.53 
 
 		 130 aa  45.8  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.799098  normal  0.109738 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4179  hypothetical protein  25.71 
 
 		 145 aa  45.8  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2675  hypothetical protein  30.38 
 
 		 417 aa  45.8  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51200  hypothetical protein  32.67 
 
 		 128 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.719355  hitchhiker  0.00000582925 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2152  hypothetical protein  35.53 
 
 		 311 aa  45.1  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2788  hypothetical protein  30.67 
 
 		 132 aa  45.1  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.159844  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0377  hypothetical protein  32.22 
 
 		 130 aa  45.1  0.0004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.253705  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4369  hypothetical protein  31.73 
 
 		 127 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3806  hypothetical protein  33.03 
 
 		 132 aa  44.7  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0460  hypothetical protein  33.33 
 
 		 130 aa  44.3  0.0006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0490887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2582  hypothetical protein  37.5 
 
 		 123 aa  44.3  0.0006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.709226  normal  0.0256768 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0023  hypothetical protein  27.78 
 
 		 130 aa  43.1  0.001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1459  hypothetical protein  32.22 
 
 		 130 aa  43.5  0.001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1073  hypothetical protein  29.57 
 
 		 128 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1501  hypothetical protein  26.8 
 
 		 133 aa  43.1  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8196  hypothetical protein  32.5 
 
 		 319 aa  42.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0843  hypothetical protein  32.91 
 
 		 145 aa  42.4  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0528  hypothetical protein  31.11 
 
 		 129 aa  42.7  0.002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.825077  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5096  hypothetical protein  33.64 
 
 		 128 aa  42.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3255  putative short chain dehydrogenase  29.82 
 
 		 413 aa  42  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.695501  normal  0.516031 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1609  protein of unknown function DUF35  33.72 
 
 		 133 aa  42  0.003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1903  hypothetical protein  29.06 
 
 		 132 aa  41.2  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.539737  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3482  protein of unknown function DUF35  31.94 
 
 		 319 aa  40.4  0.008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.893274  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8760  protein of unknown function DUF35  26.83 
 
 		 140 aa  40.4  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.108371 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1648  hypothetical protein  35.21 
 
 		 135 aa  40.4  0.009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3705  hypothetical protein  29.57 
 
 		 550 aa  40.4  0.009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.724372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4265  hypothetical protein  27.73 
 
 		 146 aa  40.4  0.009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.16799  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>