76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4005 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_4005  hypothetical protein  100 
 
 		 134 aa  271  2.0000000000000002e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.214613  normal  0.145061 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3568  hypothetical protein  46.85 
 
 		 118 aa  110  7.000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2106  hypothetical protein  45.61 
 
 		 122 aa  108  3e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.283808  normal  0.0319762 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3951  hypothetical protein  43.97 
 
 		 121 aa  106  1e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.26677  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3313  hypothetical protein  44.74 
 
 		 121 aa  105  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3885  hypothetical protein  45 
 
 		 117 aa  85.5  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3973  hypothetical protein  40.54 
 
 		 125 aa  82.4  0.000000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.370228 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0859  hypothetical protein  36.84 
 
 		 132 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0302426  normal  0.401608 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3323  protein of unknown function DUF35  39.64 
 
 		 125 aa  66.2  0.0000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00494403  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1832  hypothetical protein  33.33 
 
 		 138 aa  61.2  0.000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0184205  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7489  hypothetical protein  25.96 
 
 		 139 aa  57  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.840415  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5254  hypothetical protein  30.85 
 
 		 133 aa  57  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5005  hypothetical protein  28.45 
 
 		 129 aa  54.3  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.264526  normal  0.0828633 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0235  hypothetical protein  35.11 
 
 		 136 aa  54.7  0.0000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.737012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2351  hypothetical protein  30.77 
 
 		 130 aa  53.5  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.387375  normal  0.674763 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3606  protein of unknown function DUF35  29.41 
 
 		 130 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.215549  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2337  protein of unknown function DUF35  28.93 
 
 		 149 aa  51.6  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5278  hypothetical protein  37.89 
 
 		 135 aa  52  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3587  hypothetical protein  27.27 
 
 		 137 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.400148 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1979  protein of unknown function DUF35  27.27 
 
 		 137 aa  51.2  0.000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0353441  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5301  hypothetical protein  31.53 
 
 		 143 aa  51.6  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.653983 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4072  hypothetical protein  32.64 
 
 		 142 aa  51.6  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0149  hypothetical protein  33.65 
 
 		 129 aa  50.8  0.000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0317  protein of unknown function DUF35  25.96 
 
 		 124 aa  50.4  0.000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2932  hypothetical protein  28.93 
 
 		 137 aa  50.4  0.000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.241273  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3114  hypothetical protein  28.85 
 
 		 130 aa  50.4  0.000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0274298  normal  0.392807 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4045  hypothetical protein  35.16 
 
 		 141 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.589309 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2363  hypothetical protein  31.96 
 
 		 130 aa  50.1  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0128  hypothetical protein  33.64 
 
 		 127 aa  49.3  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0178  hypothetical protein  35.63 
 
 		 134 aa  49.3  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.82614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4070  hypothetical protein  29.25 
 
 		 153 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.322816  normal  0.86135 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4265  hypothetical protein  27.21 
 
 		 146 aa  49.3  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.16799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1687  hypothetical protein  27.27 
 
 		 137 aa  48.9  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0475632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3255  putative short chain dehydrogenase  32.17 
 
 		 413 aa  49.3  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.695501  normal  0.516031 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3511  hypothetical protein  32.58 
 
 		 131 aa  48.9  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0146  protein of unknown function DUF35  33.64 
 
 		 127 aa  49.7  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1994  hypothetical protein  32.22 
 
 		 120 aa  49.3  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.253194  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2508  protein of unknown function DUF35  31 
 
 		 132 aa  48.5  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.347955  normal  0.395372 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2662  hypothetical protein  30.63 
 
 		 136 aa  48.9  0.00003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3402  hypothetical protein  33.66 
 
 		 136 aa  48.9  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0631046 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1602  hypothetical protein  24.32 
 
 		 143 aa  48.5  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0155  hypothetical protein  32.61 
 
 		 130 aa  48.5  0.00003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1880  hypothetical protein  26.36 
 
 		 137 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0682045 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5644  hypothetical protein  33.33 
 
 		 152 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5112  hypothetical protein  31.03 
 
 		 132 aa  48.1  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000923569  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5775  protein of unknown function DUF35  36.49 
 
 		 129 aa  47.4  0.00006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0423668  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8760  protein of unknown function DUF35  31.17 
 
 		 140 aa  47.4  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.108371 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4493  hypothetical protein  30.89 
 
 		 148 aa  47  0.00009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2010  hypothetical protein  33.33 
 
 		 137 aa  47  0.00009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.392361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4179  hypothetical protein  25.49 
 
 		 145 aa  47  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6630  hypothetical protein  33.33 
 
 		 120 aa  46.6  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0233518  normal  0.987358 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1758  hypothetical protein  27.55 
 
 		 130 aa  45.8  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.799098  normal  0.109738 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1501  hypothetical protein  25 
 
 		 133 aa  44.7  0.0004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2934  hypothetical protein  28.44 
 
 		 144 aa  44.7  0.0004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.431872  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5850  hypothetical protein  28.95 
 
 		 152 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0806522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1392  hypothetical protein  29 
 
 		 152 aa  44.3  0.0006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5453  hypothetical protein  28.95 
 
 		 152 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0654575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2745  nucleic-acid-binding protein containing a Zn-ribbon  26.47 
 
 		 135 aa  43.9  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0775897 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1671  hypothetical protein  28.95 
 
 		 152 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0635  hypothetical protein  28.95 
 
 		 152 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.525049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0553  hypothetical protein  28.95 
 
 		 152 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1644  hypothetical protein  28.95 
 
 		 152 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.982412  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0530  hypothetical protein  28.95 
 
 		 152 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1695  hypothetical protein  28.95 
 
 		 152 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0528  hypothetical protein  26 
 
 		 129 aa  43.5  0.001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.825077  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4132  hypothetical protein  31.51 
 
 		 149 aa  43.1  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.479777  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0843  hypothetical protein  25.27 
 
 		 145 aa  42.7  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0854  protein of unknown function DUF35  24.42 
 
 		 116 aa  42.7  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0219431  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4606  hypothetical protein  31.4 
 
 		 109 aa  42  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5500  hypothetical protein  27.78 
 
 		 132 aa  42  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4153  hypothetical protein  28.45 
 
 		 132 aa  42  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.280027  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3828  hypothetical protein  30.1 
 
 		 132 aa  41.6  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0860  hypothetical protein  27.72 
 
 		 138 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3806  hypothetical protein  26.87 
 
 		 132 aa  41.2  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0549  hypothetical protein  29.03 
 
 		 132 aa  40.8  0.007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0899  hypothetical protein  26.77 
 
 		 131 aa  40.4  0.007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.312493  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>