58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4132 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_4132  hypothetical protein  100 
 
 		 149 aa  303  5.0000000000000004e-82  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.479777  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4138  hypothetical protein  46.85 
 
 		 146 aa  118  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.67568  normal  0.342554 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2520  hypothetical protein  48.33 
 
 		 146 aa  113  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.167569  normal  0.666068 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3672  hypothetical protein  45.97 
 
 		 141 aa  112  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.108807  normal  0.573153 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3388  hypothetical protein  48.76 
 
 		 138 aa  111  3e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.809106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3659  hypothetical protein  47.11 
 
 		 137 aa  111  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.17734  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3732  hypothetical protein  47.11 
 
 		 137 aa  111  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.315586 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3906  hypothetical protein  47.15 
 
 		 143 aa  110  7.000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0256992  normal  0.0925623 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3587  hypothetical protein  43.75 
 
 		 133 aa  74.3  0.0000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.645775  normal  0.381566 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3365  hypothetical protein  36.59 
 
 		 172 aa  72  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.810777  normal  0.110528 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0940  hypothetical protein  36.09 
 
 		 153 aa  71.6  0.000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.189583  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2863  hypothetical protein  36.59 
 
 		 172 aa  71.6  0.000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.580018  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3555  hypothetical protein  35.86 
 
 		 132 aa  65.5  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3029  hypothetical protein  32.85 
 
 		 155 aa  65.1  0.0000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.417482  normal  0.14022 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3060  hypothetical protein  32.85 
 
 		 146 aa  64.7  0.0000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.995907 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3014  hypothetical protein  32.85 
 
 		 146 aa  64.7  0.0000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.764426  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11644  hypothetical protein  32.09 
 
 		 163 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.187499  normal  0.695339 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8927  hypothetical protein  33.06 
 
 		 134 aa  57.4  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0674  protein of unknown function DUF35  26.27 
 
 		 178 aa  56.2  0.0000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17870  predicted nucleic-acid-binding protein containing a Zn-ribbon  39.25 
 
 		 141 aa  54.3  0.0000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.736361  normal  0.638502 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0397  hypothetical protein  33.68 
 
 		 177 aa  53.1  0.000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2476  protein of unknown function DUF35  37.65 
 
 		 134 aa  52.8  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.73466  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0340  protein of unknown function DUF35  32.5 
 
 		 134 aa  53.5  0.000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.0000262786  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3567  hypothetical protein  29.93 
 
 		 145 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0670852 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0899  hypothetical protein  35.48 
 
 		 131 aa  50.8  0.000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.312493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0377  hypothetical protein  31.4 
 
 		 130 aa  50.8  0.000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.253705  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0528  hypothetical protein  29.91 
 
 		 129 aa  50.4  0.000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.825077  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1459  hypothetical protein  30.58 
 
 		 130 aa  50.1  0.00001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0836  hypothetical protein  28.45 
 
 		 189 aa  48.5  0.00003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4526  hypothetical protein  31.93 
 
 		 143 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0992548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3624  hypothetical protein  32.38 
 
 		 149 aa  47.8  0.00005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.680535 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1528  hypothetical protein  26.28 
 
 		 146 aa  47.8  0.00005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.467127 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3255  putative short chain dehydrogenase  34.41 
 
 		 413 aa  47.4  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.695501  normal  0.516031 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1994  hypothetical protein  31.2 
 
 		 120 aa  47.4  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.253194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0458  hypothetical protein  29.31 
 
 		 182 aa  47  0.0001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2821  hypothetical protein  33.02 
 
 		 315 aa  46.6  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.875118  normal  0.0237416 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0766  hypothetical protein  31.03 
 
 		 135 aa  46.2  0.0001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.48862  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0460  hypothetical protein  29.75 
 
 		 130 aa  46.2  0.0001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0490887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3313  hypothetical protein  31.25 
 
 		 121 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1602  hypothetical protein  26.04 
 
 		 143 aa  45.4  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5539  hypothetical protein  34.04 
 
 		 141 aa  44.7  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1438  3-hydroxybutyryl-CoA epimerase  27.59 
 
 		 576 aa  44.3  0.0006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.410853  normal  0.0151032 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1357  hypothetical protein  30.51 
 
 		 132 aa  44.3  0.0006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2106  hypothetical protein  30.26 
 
 		 122 aa  43.9  0.0008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.283808  normal  0.0319762 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0794  hypothetical protein  28.57 
 
 		 133 aa  43.9  0.0008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8196  hypothetical protein  32.97 
 
 		 319 aa  43.5  0.0009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4005  hypothetical protein  31.51 
 
 		 134 aa  43.1  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.214613  normal  0.145061 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8760  protein of unknown function DUF35  32.32 
 
 		 140 aa  43.5  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.108371 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1609  protein of unknown function DUF35  28.23 
 
 		 133 aa  42.7  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3482  protein of unknown function DUF35  31.58 
 
 		 319 aa  42.7  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.893274  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2840  protein of unknown function DUF35  33.93 
 
 		 132 aa  42  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00189293  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0436  protein of unknown function DUF35  25.45 
 
 		 128 aa  41.6  0.004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.686015  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0616  hypothetical protein  32.54 
 
 		 176 aa  41.6  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.11399  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1482  nucleic-acid-binding protein containing a Zn- ribbon-like protein  32.28 
 
 		 295 aa  41.2  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0812  hypothetical protein  27.97 
 
 		 134 aa  40.8  0.006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.553396  hitchhiker  0.000113363 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4493  hypothetical protein  29.35 
 
 		 148 aa  40.4  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0023  hypothetical protein  27.27 
 
 		 130 aa  40.4  0.009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5301  hypothetical protein  32.63 
 
 		 143 aa  40  0.01  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.653983 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>