55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_17870 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_17870  predicted nucleic-acid-binding protein containing a Zn-ribbon  100 
 
 		 141 aa  282  9e-76  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.736361  normal  0.638502 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3587  hypothetical protein  49.57 
 
 		 133 aa  89  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.645775  normal  0.381566 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3906  hypothetical protein  37.01 
 
 		 143 aa  72.4  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0256992  normal  0.0925623 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0940  hypothetical protein  40.95 
 
 		 153 aa  63.9  0.0000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.189583  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2520  hypothetical protein  38.78 
 
 		 146 aa  63.9  0.0000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.167569  normal  0.666068 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4138  hypothetical protein  38.78 
 
 		 146 aa  62.8  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.67568  normal  0.342554 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3555  hypothetical protein  47.69 
 
 		 132 aa  61.2  0.000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4132  hypothetical protein  38.68 
 
 		 149 aa  61.2  0.000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.479777  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3732  hypothetical protein  37.76 
 
 		 137 aa  60.1  0.000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.315586 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3659  hypothetical protein  37.76 
 
 		 137 aa  60.1  0.000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.17734  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3672  hypothetical protein  37.25 
 
 		 141 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.108807  normal  0.573153 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0528  hypothetical protein  33.33 
 
 		 129 aa  55.8  0.0000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.825077  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3388  hypothetical protein  37 
 
 		 138 aa  54.3  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.809106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1979  protein of unknown function DUF35  30.51 
 
 		 137 aa  53.5  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0353441  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0377  hypothetical protein  33.33 
 
 		 130 aa  52.8  0.000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.253705  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1687  hypothetical protein  30.51 
 
 		 137 aa  51.6  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0475632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3365  hypothetical protein  37.61 
 
 		 172 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.810777  normal  0.110528 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2863  hypothetical protein  37.61 
 
 		 172 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.580018  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0023  hypothetical protein  30.3 
 
 		 130 aa  50.8  0.000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0460  hypothetical protein  31.37 
 
 		 130 aa  49.7  0.00001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0490887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1438  3-hydroxybutyryl-CoA epimerase  29.84 
 
 		 576 aa  49.7  0.00001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.410853  normal  0.0151032 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1880  hypothetical protein  28.47 
 
 		 137 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0682045 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3587  hypothetical protein  30.51 
 
 		 137 aa  49.7  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.400148 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1459  hypothetical protein  31.37 
 
 		 130 aa  48.1  0.00004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1609  protein of unknown function DUF35  28.16 
 
 		 133 aa  46.2  0.0001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8927  hypothetical protein  33.33 
 
 		 134 aa  46.6  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0510  hypothetical protein  32.65 
 
 		 143 aa  46.6  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3567  hypothetical protein  41.18 
 
 		 145 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0670852 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8760  protein of unknown function DUF35  29.89 
 
 		 140 aa  46.6  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.108371 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0436  protein of unknown function DUF35  22.83 
 
 		 128 aa  46.2  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.686015  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3402  hypothetical protein  31.91 
 
 		 136 aa  45.8  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0631046 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3014  hypothetical protein  38.1 
 
 		 146 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.764426  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3029  hypothetical protein  38.1 
 
 		 155 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.417482  normal  0.14022 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3060  hypothetical protein  38.1 
 
 		 146 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.995907 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3624  hypothetical protein  36.89 
 
 		 149 aa  45.1  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.680535 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1501  hypothetical protein  28.12 
 
 		 133 aa  44.3  0.0006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1758  hypothetical protein  26.85 
 
 		 130 aa  43.9  0.0007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.799098  normal  0.109738 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0794  hypothetical protein  31.31 
 
 		 133 aa  43.9  0.0007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7489  hypothetical protein  28.57 
 
 		 139 aa  43.9  0.0008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.840415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2932  hypothetical protein  32.93 
 
 		 137 aa  43.9  0.0008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.241273  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8196  hypothetical protein  33.33 
 
 		 319 aa  42.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2010  hypothetical protein  28.57 
 
 		 137 aa  42.4  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.392361  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4412  hypothetical protein  31.9 
 
 		 132 aa  42.4  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000585754  normal  0.649702 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0458  hypothetical protein  30.28 
 
 		 182 aa  42.7  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0340  protein of unknown function DUF35  26.42 
 
 		 134 aa  42  0.003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.0000262786  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3482  protein of unknown function DUF35  29.17 
 
 		 319 aa  42  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.893274  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0812  hypothetical protein  35 
 
 		 134 aa  41.6  0.003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.553396  hitchhiker  0.000113363 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2138  hypothetical protein  25.95 
 
 		 321 aa  42  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5005  hypothetical protein  28.44 
 
 		 129 aa  42  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.264526  normal  0.0828633 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11644  hypothetical protein  34.17 
 
 		 163 aa  41.6  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.187499  normal  0.695339 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5539  hypothetical protein  26.61 
 
 		 141 aa  41.6  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1648  hypothetical protein  32.95 
 
 		 135 aa  40.8  0.006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1994  hypothetical protein  25.96 
 
 		 120 aa  40.8  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.253194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1241  hypothetical protein  32 
 
 		 137 aa  40.4  0.007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0148077  normal  0.0127741 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2015  hypothetical protein  29.09 
 
 		 136 aa  40.8  0.007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.196649  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>