42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_3060 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_3014  hypothetical protein  100 
 
 		 146 aa  301  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.764426  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3060  hypothetical protein  100 
 
 		 146 aa  301  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.995907 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3029  hypothetical protein  100 
 
 		 155 aa  299  8.000000000000001e-81  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.417482  normal  0.14022 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3365  hypothetical protein  74.85 
 
 		 172 aa  234  4e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.810777  normal  0.110528 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2863  hypothetical protein  73.68 
 
 		 172 aa  229  8.000000000000001e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.580018  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3567  hypothetical protein  81.25 
 
 		 145 aa  223  7e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0670852 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11644  hypothetical protein  84.06 
 
 		 163 aa  215  2e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.187499  normal  0.695339 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4526  hypothetical protein  79.58 
 
 		 143 aa  195  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0992548  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0940  hypothetical protein  50.69 
 
 		 153 aa  133  7.000000000000001e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.189583  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8927  hypothetical protein  53.66 
 
 		 134 aa  131  3e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3624  hypothetical protein  46.15 
 
 		 149 aa  129  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.680535 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4138  hypothetical protein  37.68 
 
 		 146 aa  80.9  0.000000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.67568  normal  0.342554 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3906  hypothetical protein  35.71 
 
 		 143 aa  76.3  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0256992  normal  0.0925623 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3388  hypothetical protein  37.7 
 
 		 138 aa  75.1  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.809106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2520  hypothetical protein  34.27 
 
 		 146 aa  74.3  0.0000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.167569  normal  0.666068 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3120  protein of unknown function DUF35  48.94 
 
 		 169 aa  74.3  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4132  hypothetical protein  32.17 
 
 		 149 aa  73.6  0.0000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.479777  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3672  hypothetical protein  33.56 
 
 		 141 aa  72.4  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.108807  normal  0.573153 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3659  hypothetical protein  34.27 
 
 		 137 aa  72.8  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.17734  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3732  hypothetical protein  34.27 
 
 		 137 aa  72.8  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.315586 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3555  hypothetical protein  42.86 
 
 		 132 aa  71.6  0.000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4017  hypothetical protein  33.94 
 
 		 155 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.188869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4111  hypothetical protein  33.58 
 
 		 142 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0961571  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2788  hypothetical protein  31.2 
 
 		 132 aa  48.5  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.159844  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17870  predicted nucleic-acid-binding protein containing a Zn-ribbon  40.24 
 
 		 141 aa  48.1  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.736361  normal  0.638502 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0905  hypothetical protein  29.81 
 
 		 135 aa  47.4  0.00006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00718711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0377  hypothetical protein  30.95 
 
 		 130 aa  47.4  0.00007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.253705  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0528  hypothetical protein  30.08 
 
 		 129 aa  47  0.00008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.825077  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0460  hypothetical protein  30.16 
 
 		 130 aa  46.6  0.0001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0490887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1459  hypothetical protein  30.16 
 
 		 130 aa  46.2  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8760  protein of unknown function DUF35  35.42 
 
 		 140 aa  45.4  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.108371 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0674  protein of unknown function DUF35  27.27 
 
 		 178 aa  45.4  0.0003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0023  hypothetical protein  29.75 
 
 		 130 aa  44.7  0.0004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1528  hypothetical protein  30.65 
 
 		 146 aa  44.7  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.467127 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0582  hypothetical protein  29.6 
 
 		 137 aa  44.3  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00877368  normal  0.438267 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8196  hypothetical protein  34.17 
 
 		 319 aa  44.3  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1758  hypothetical protein  28.97 
 
 		 130 aa  42.4  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.799098  normal  0.109738 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2363  hypothetical protein  32.35 
 
 		 130 aa  41.6  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0766  hypothetical protein  37.18 
 
 		 135 aa  42  0.003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.48862  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1979  protein of unknown function DUF35  30.91 
 
 		 137 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0353441  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5254  hypothetical protein  28.93 
 
 		 133 aa  41.2  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0387  hypothetical protein  35.62 
 
 		 129 aa  40.4  0.008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.448785  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>