48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0940 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_0940  hypothetical protein  100 
 
 		 153 aa  305  1.0000000000000001e-82  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.189583  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3624  hypothetical protein  53.52 
 
 		 149 aa  144  5e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.680535 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8927  hypothetical protein  57.98 
 
 		 134 aa  119  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11644  hypothetical protein  49.67 
 
 		 163 aa  115  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.187499  normal  0.695339 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3567  hypothetical protein  50.68 
 
 		 145 aa  113  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0670852 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3029  hypothetical protein  50.34 
 
 		 155 aa  113  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.417482  normal  0.14022 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3060  hypothetical protein  50.34 
 
 		 146 aa  113  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.995907 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3014  hypothetical protein  50.34 
 
 		 146 aa  113  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.764426  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3365  hypothetical protein  42.77 
 
 		 172 aa  107  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.810777  normal  0.110528 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2863  hypothetical protein  42.2 
 
 		 172 aa  107  8.000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.580018  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4526  hypothetical protein  46.97 
 
 		 143 aa  90.1  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0992548  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4132  hypothetical protein  36.09 
 
 		 149 aa  71.6  0.000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.479777  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3120  protein of unknown function DUF35  45.07 
 
 		 169 aa  68.2  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3555  hypothetical protein  31.85 
 
 		 132 aa  67  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3906  hypothetical protein  32.52 
 
 		 143 aa  64.3  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0256992  normal  0.0925623 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4138  hypothetical protein  31.43 
 
 		 146 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.67568  normal  0.342554 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2520  hypothetical protein  30 
 
 		 146 aa  61.2  0.000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.167569  normal  0.666068 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3388  hypothetical protein  29.29 
 
 		 138 aa  60.1  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.809106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1528  hypothetical protein  31.25 
 
 		 146 aa  57  0.00000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.467127 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0794  hypothetical protein  31.15 
 
 		 133 aa  55.8  0.0000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0812  hypothetical protein  30.33 
 
 		 134 aa  52.4  0.000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.553396  hitchhiker  0.000113363 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0528  hypothetical protein  26.81 
 
 		 129 aa  52.8  0.000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.825077  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0340  protein of unknown function DUF35  33.7 
 
 		 134 aa  51.6  0.000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.0000262786  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17870  predicted nucleic-acid-binding protein containing a Zn-ribbon  39.05 
 
 		 141 aa  52  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.736361  normal  0.638502 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0023  hypothetical protein  28.12 
 
 		 130 aa  52  0.000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0460  hypothetical protein  26.09 
 
 		 130 aa  52  0.000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0490887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0377  hypothetical protein  26.81 
 
 		 130 aa  51.6  0.000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.253705  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3732  hypothetical protein  29.46 
 
 		 137 aa  50.8  0.000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.315586 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3659  hypothetical protein  29.46 
 
 		 137 aa  50.8  0.000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.17734  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1459  hypothetical protein  26.09 
 
 		 130 aa  50.4  0.000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3672  hypothetical protein  29.32 
 
 		 141 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.108807  normal  0.573153 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1357  hypothetical protein  29.51 
 
 		 132 aa  48.9  0.00002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1083  hypothetical protein  36.36 
 
 		 134 aa  48.1  0.00004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1241  hypothetical protein  29.51 
 
 		 137 aa  46.2  0.0002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0148077  normal  0.0127741 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3606  protein of unknown function DUF35  31.34 
 
 		 130 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.215549  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0766  hypothetical protein  29.9 
 
 		 135 aa  44.7  0.0004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.48862  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0674  protein of unknown function DUF35  26.5 
 
 		 178 aa  43.9  0.0007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2363  hypothetical protein  29.57 
 
 		 130 aa  43.9  0.0009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4111  hypothetical protein  30.82 
 
 		 142 aa  43.9  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0961571  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1609  protein of unknown function DUF35  28.07 
 
 		 133 aa  43.5  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3114  hypothetical protein  29.85 
 
 		 130 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0274298  normal  0.392807 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3587  hypothetical protein  39.76 
 
 		 133 aa  42  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.645775  normal  0.381566 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8196  hypothetical protein  32.94 
 
 		 319 aa  42  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3482  protein of unknown function DUF35  27.5 
 
 		 319 aa  41.6  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.893274  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5254  hypothetical protein  27.87 
 
 		 133 aa  40.8  0.007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1758  hypothetical protein  30.77 
 
 		 130 aa  40.8  0.007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.799098  normal  0.109738 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4045  hypothetical protein  29.13 
 
 		 141 aa  40.4  0.008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.589309 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2351  hypothetical protein  29.1 
 
 		 130 aa  40.4  0.009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.387375  normal  0.674763 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>