87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_1241 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009954  Cmaq_1241  hypothetical protein  100 
 
 
137 aa  278  2e-74  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0148077  normal  0.0127741 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0812  hypothetical protein  60 
 
 
134 aa  165  2e-40  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.553396  hitchhiker  0.000113363 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0794  hypothetical protein  60.16 
 
 
133 aa  163  8e-40  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1357  hypothetical protein  59.69 
 
 
132 aa  159  1e-38  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1083  hypothetical protein  60.47 
 
 
134 aa  144  4.0000000000000006e-34  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0766  hypothetical protein  44.53 
 
 
135 aa  102  2e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.48862  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0377  hypothetical protein  41.54 
 
 
130 aa  99  2e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.253705  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0340  protein of unknown function DUF35  37.88 
 
 
134 aa  98.6  3e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.0000262786  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1459  hypothetical protein  40.77 
 
 
130 aa  97.8  4e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0528  hypothetical protein  40.31 
 
 
129 aa  94.4  4e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.825077  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0460  hypothetical protein  40 
 
 
130 aa  94  6e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0490887  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2363  hypothetical protein  35.88 
 
 
130 aa  93.2  1e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1392  hypothetical protein  37.59 
 
 
152 aa  90.9  5e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0155  hypothetical protein  34.09 
 
 
130 aa  89  2e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0549  hypothetical protein  34.88 
 
 
132 aa  89.4  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2508  protein of unknown function DUF35  34.62 
 
 
132 aa  87.8  4e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.347955  normal  0.395372 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1625  hypothetical protein  34.62 
 
 
130 aa  85.5  2e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1648  hypothetical protein  39.2 
 
 
135 aa  85.5  2e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1609  protein of unknown function DUF35  35.61 
 
 
133 aa  84  7e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0023  hypothetical protein  33.33 
 
 
130 aa  82  0.000000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1934  hypothetical protein  33.85 
 
 
133 aa  80.1  0.00000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0108502  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0149  hypothetical protein  31.54 
 
 
129 aa  77  0.00000000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0428  hypothetical protein  36.64 
 
 
131 aa  74.7  0.0000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0261769  normal  0.146814 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1925  protein of unknown function DUF35  34.75 
 
 
474 aa  71.2  0.000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0597  protein of unknown function DUF35  33.56 
 
 
490 aa  71.2  0.000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1310  hypothetical protein  40 
 
 
151 aa  68.9  0.00000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.120998 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0984  hypothetical protein  35.11 
 
 
132 aa  68.2  0.00000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4194  protein of unknown function DUF35  31.43 
 
 
473 aa  64.3  0.0000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.492043  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1145  protein of unknown function DUF35  31.01 
 
 
133 aa  63.5  0.0000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0574924  hitchhiker  0.0000746026 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4021  protein of unknown function DUF35  33.56 
 
 
481 aa  59.7  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.605764  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3871  hypothetical protein  30.23 
 
 
131 aa  60.1  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0674  protein of unknown function DUF35  37.84 
 
 
178 aa  56.6  0.0000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2476  protein of unknown function DUF35  42.47 
 
 
134 aa  56.6  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.73466  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2010  hypothetical protein  31.36 
 
 
137 aa  56.6  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.392361  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0387  hypothetical protein  36.49 
 
 
129 aa  55.8  0.0000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.448785  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2101  hypothetical protein  34.21 
 
 
139 aa  55.5  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.416637  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1979  protein of unknown function DUF35  29.23 
 
 
137 aa  55.1  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0353441  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1880  hypothetical protein  32.31 
 
 
137 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0682045 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0436  protein of unknown function DUF35  30 
 
 
128 aa  53.1  0.000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.686015  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3587  hypothetical protein  30.61 
 
 
137 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.400148 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5254  hypothetical protein  33.33 
 
 
133 aa  50.8  0.000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4422  protein of unknown function DUF35  29.05 
 
 
474 aa  50.4  0.000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.00766931  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1602  hypothetical protein  29.41 
 
 
143 aa  49.7  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1630  hypothetical protein  32.56 
 
 
128 aa  49.7  0.00001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0843  hypothetical protein  33.9 
 
 
145 aa  50.1  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1903  hypothetical protein  31.96 
 
 
132 aa  48.9  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.539737  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1687  hypothetical protein  31.3 
 
 
137 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0475632  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2808  protein of unknown function DUF35  36.23 
 
 
128 aa  47  0.00008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0884467  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5539  hypothetical protein  31.82 
 
 
141 aa  47  0.00009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8196  hypothetical protein  30.21 
 
 
319 aa  47  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1438  3-hydroxybutyryl-CoA epimerase  27.27 
 
 
576 aa  46.6  0.0001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.410853  normal  0.0151032 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3090  protein of unknown function DUF35  37.04 
 
 
335 aa  46.6  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.736409  normal  0.697465 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0940  hypothetical protein  29.51 
 
 
153 aa  46.2  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.189583  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3780  protein of unknown function DUF35  31.78 
 
 
126 aa  47  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.000111928  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2932  hypothetical protein  29.57 
 
 
137 aa  46.6  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.241273  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1528  hypothetical protein  31.82 
 
 
146 aa  46.6  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.467127 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3388  hypothetical protein  31.09 
 
 
138 aa  46.2  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.809106  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1550  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.89 
 
 
913 aa  45.4  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3600  hypothetical protein  34.12 
 
 
140 aa  45.1  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0665674  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2934  hypothetical protein  30.77 
 
 
144 aa  45.1  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.431872  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0859  hypothetical protein  29.79 
 
 
132 aa  44.7  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0302426  normal  0.401608 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0397  hypothetical protein  31.52 
 
 
177 aa  44.7  0.0004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3818  protein of unknown function DUF35  35.11 
 
 
320 aa  44.7  0.0005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.704476  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1804  hypothetical protein  30.63 
 
 
140 aa  44.3  0.0005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.983 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4045  hypothetical protein  32.2 
 
 
141 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.589309 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0836  hypothetical protein  28.12 
 
 
189 aa  43.5  0.0008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6833  hypothetical protein  35.92 
 
 
121 aa  43.9  0.0008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0860  hypothetical protein  30.09 
 
 
138 aa  43.9  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0510  hypothetical protein  35 
 
 
143 aa  43.9  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0458  hypothetical protein  35 
 
 
182 aa  42.7  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2788  hypothetical protein  29.17 
 
 
132 aa  43.5  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.159844  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1758  hypothetical protein  31.63 
 
 
130 aa  42.4  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.799098  normal  0.109738 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3906  hypothetical protein  28.8 
 
 
143 aa  42.7  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0256992  normal  0.0925623 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0892  hypothetical protein  25.23 
 
 
142 aa  42  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.204366  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3402  hypothetical protein  31.46 
 
 
136 aa  42.4  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0631046 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11644  hypothetical protein  31.53 
 
 
163 aa  42  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.187499  normal  0.695339 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2623  hypothetical protein  30.21 
 
 
305 aa  41.6  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.140164  normal  0.486862 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1994  hypothetical protein  30.53 
 
 
120 aa  42  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.253194  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3624  hypothetical protein  30.4 
 
 
149 aa  42  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.680535 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3964  protein of unknown function DUF35  36.62 
 
 
329 aa  41.6  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17870  predicted nucleic-acid-binding protein containing a Zn-ribbon  32 
 
 
141 aa  41.6  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.736361  normal  0.638502 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0616  hypothetical protein  31.01 
 
 
176 aa  41.6  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.11399  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8760  protein of unknown function DUF35  29.81 
 
 
140 aa  40.8  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.108371 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3365  hypothetical protein  30 
 
 
172 aa  40.8  0.007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.810777  normal  0.110528 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2863  hypothetical protein  30 
 
 
172 aa  40.8  0.007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.580018  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3060  hypothetical protein  29.09 
 
 
146 aa  40  0.01  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.995907 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3014  hypothetical protein  29.09 
 
 
146 aa  40  0.01  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.764426  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>