105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_1925 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013924  Nmag_4021  protein of unknown function DUF35  75.68 
 
 
481 aa  712    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.605764  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0597  protein of unknown function DUF35  74.44 
 
 
490 aa  704    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1925  protein of unknown function DUF35  100 
 
 
474 aa  924    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4422  protein of unknown function DUF35  59.32 
 
 
474 aa  503  1e-141  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.00766931  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4194  protein of unknown function DUF35  45.19 
 
 
473 aa  334  2e-90  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.492043  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1240  hypothetical protein  27.75 
 
 
349 aa  116  6.9999999999999995e-25  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0625222  hitchhiker  0.00968227 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2510  hypothetical protein  27.87 
 
 
350 aa  106  1e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.507027  normal  0.708898 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1627  hypothetical protein  28.41 
 
 
347 aa  105  2e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1082  hypothetical protein  26.33 
 
 
350 aa  103  9e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0020  hypothetical protein  26.61 
 
 
348 aa  102  2e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0811  hypothetical protein  26.02 
 
 
350 aa  101  3e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.836821  hitchhiker  0.000111453 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0157  hypothetical protein  26.8 
 
 
350 aa  101  3e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1607  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  26.69 
 
 
350 aa  99.4  1e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0551  hypothetical protein  27.64 
 
 
349 aa  96.3  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0793  hypothetical protein  26.9 
 
 
349 aa  95.1  2e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2361  hypothetical protein  27.3 
 
 
350 aa  93.2  9e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1932  hypothetical protein  26.76 
 
 
349 aa  91.7  2e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0292488  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0379  hypothetical protein  26.65 
 
 
349 aa  91.3  4e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0764  hypothetical protein  30.08 
 
 
346 aa  90.1  9e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.128662  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1390  hypothetical protein  26.86 
 
 
345 aa  89.7  1e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3869  hypothetical protein  28.01 
 
 
348 aa  89.4  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0338  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  26.86 
 
 
347 aa  89.7  1e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.468823  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2055  protein of unknown function DUF35  28.43 
 
 
474 aa  89.7  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0203372  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0458  hypothetical protein  27.91 
 
 
349 aa  88.6  2e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.288502  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1461  hypothetical protein  27.03 
 
 
349 aa  87.4  5e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1357  hypothetical protein  39.72 
 
 
132 aa  86.3  0.000000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1356  hypothetical protein  26.63 
 
 
351 aa  84.3  0.000000000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.711945  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0526  hypothetical protein  25.87 
 
 
349 aa  84  0.000000000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1646  hypothetical protein  26.67 
 
 
348 aa  83.6  0.000000000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0794  hypothetical protein  37.41 
 
 
133 aa  79.7  0.0000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1142  hypothetical protein  26.76 
 
 
349 aa  79.3  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.448183  hitchhiker  0.000356194 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0812  hypothetical protein  35.46 
 
 
134 aa  76.3  0.000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.553396  hitchhiker  0.000113363 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0151  hypothetical protein  27.3 
 
 
350 aa  74.7  0.000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1241  hypothetical protein  34.75 
 
 
137 aa  71.2  0.00000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0148077  normal  0.0127741 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1083  hypothetical protein  38.3 
 
 
134 aa  70.5  0.00000000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0430  hypothetical protein  26.65 
 
 
348 aa  70.5  0.00000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.637557  normal  0.081806 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2917  hypothetical protein  25.44 
 
 
495 aa  70.1  0.00000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.381583  normal  0.0360554 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0766  hypothetical protein  38.3 
 
 
135 aa  69.3  0.0000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.48862  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2714  protein of unknown function DUF35  28.02 
 
 
465 aa  68.2  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00764236  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1550  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  24.16 
 
 
913 aa  67.8  0.0000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0377  hypothetical protein  32.14 
 
 
130 aa  67.4  0.0000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.253705  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0023  hypothetical protein  33.33 
 
 
130 aa  66.6  0.0000000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0982  hypothetical protein  25.42 
 
 
348 aa  65.9  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1459  hypothetical protein  32.14 
 
 
130 aa  65.9  0.000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1392  hypothetical protein  33.11 
 
 
152 aa  65.5  0.000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2508  protein of unknown function DUF35  35.04 
 
 
132 aa  65.1  0.000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.347955  normal  0.395372 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0549  hypothetical protein  31.21 
 
 
132 aa  64.3  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0155  hypothetical protein  31.03 
 
 
130 aa  64.3  0.000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1609  protein of unknown function DUF35  33.58 
 
 
133 aa  63.9  0.000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0460  hypothetical protein  32.14 
 
 
130 aa  62.8  0.00000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0490887  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0340  protein of unknown function DUF35  30.07 
 
 
134 aa  62  0.00000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.0000262786  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2363  hypothetical protein  32.19 
 
 
130 aa  62  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3240  hypothetical protein  26.77 
 
 
485 aa  60.1  0.00000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.57921  normal  0.496079 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3069  hypothetical protein  24.23 
 
 
502 aa  60.1  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0528  hypothetical protein  28.99 
 
 
129 aa  56.6  0.0000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.825077  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4154  hypothetical protein  33.09 
 
 
397 aa  56.2  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.880245  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2626  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  26.23 
 
 
319 aa  54.7  0.000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000124797  unclonable  0.00000000014785 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2040  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  28.25 
 
 
319 aa  53.9  0.000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000147656  normal  0.0175917 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1145  protein of unknown function DUF35  32.85 
 
 
133 aa  53.9  0.000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0574924  hitchhiker  0.0000746026 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2295  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  26.82 
 
 
319 aa  52.8  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000269031  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1625  hypothetical protein  26.43 
 
 
130 aa  53.1  0.00001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2505  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  26.69 
 
 
317 aa  52  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000055762  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1601  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  27.33 
 
 
319 aa  51.2  0.00004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000117796  hitchhiker  0.000966367 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4072  hypothetical protein  42.86 
 
 
142 aa  50.4  0.00007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2003  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  27.42 
 
 
321 aa  50.1  0.00009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2519  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  25.58 
 
 
323 aa  49.3  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0674  protein of unknown function DUF35  30.67 
 
 
178 aa  48.9  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1717  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  24.92 
 
 
319 aa  49.3  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000441505  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1580  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  25 
 
 
319 aa  48.5  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000016033  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1714  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  24.92 
 
 
319 aa  49.3  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000275042  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2496  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  35.05 
 
 
319 aa  48.9  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000027329  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1757  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  24.92 
 
 
319 aa  49.3  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000146713  normal  0.162626 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2575  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  24.92 
 
 
319 aa  49.3  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000148386  normal  0.052755 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2360  hypothetical protein  30.39 
 
 
131 aa  48.1  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.116484 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2810  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  26.8 
 
 
317 aa  48.1  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000411512  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1497  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  36.08 
 
 
319 aa  48.1  0.0004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000000406338  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01087  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase  24.75 
 
 
317 aa  47  0.0007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000578388  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1213  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  24.75 
 
 
317 aa  47  0.0007  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  2.16382e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2510  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  24.75 
 
 
317 aa  47  0.0007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000101658  hitchhiker  0.0000844737 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01095  hypothetical protein  24.75 
 
 
317 aa  47  0.0007  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000485703  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2556  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  24.75 
 
 
317 aa  46.6  0.0009  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000231699  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1212  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  24.75 
 
 
317 aa  46.6  0.0009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000153107  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2036  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  24.75 
 
 
317 aa  46.6  0.0009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000955089  decreased coverage  0.000000634537 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2233  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  24.75 
 
 
317 aa  46.6  0.0009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.00000000000000918964  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1470  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  24.75 
 
 
317 aa  46.6  0.0009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000946289  hitchhiker  0.00000000000127697 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0567  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  23.1 
 
 
313 aa  46.6  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2398  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  25.81 
 
 
319 aa  46.2  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000897819  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2468  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  25.81 
 
 
319 aa  46.2  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000348586  hitchhiker  0.00158302 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2560  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  25.81 
 
 
319 aa  46.2  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000598459  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0397  hypothetical protein  31.19 
 
 
177 aa  46.6  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0428  hypothetical protein  31.06 
 
 
131 aa  46.2  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0261769  normal  0.146814 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1585  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  26.19 
 
 
316 aa  46.6  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000421947  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0899  hypothetical protein  31.19 
 
 
131 aa  45.8  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.312493  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0638  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  23.86 
 
 
324 aa  45.8  0.002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1648  hypothetical protein  28.78 
 
 
135 aa  45.4  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1982  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  25 
 
 
319 aa  45.1  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000000251663  decreased coverage  0.000708854 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2239  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  24.83 
 
 
317 aa  44.7  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000795975  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1934  hypothetical protein  28.15 
 
 
133 aa  44.3  0.004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0108502  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0869  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  32.99 
 
 
325 aa  44.7  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2778  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  33.33 
 
 
319 aa  43.9  0.007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>