73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_3069 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_3069  hypothetical protein  100 
 
 		 502 aa  1035    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2917  hypothetical protein  64.52 
 
 		 495 aa  650    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.381583  normal  0.0360554 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1550  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.15 
 
 		 913 aa  472  1e-132  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3240  hypothetical protein  47.2 
 
 		 485 aa  443  1e-123  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.57921  normal  0.496079 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1856  3-oxoacyl-(ACP) synthase III  41.37 
 
 		 484 aa  365  1e-99  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0653145  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2055  protein of unknown function DUF35  30.66 
 
 		 474 aa  181  2.9999999999999997e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0203372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5351  protein of unknown function DUF35  28.23 
 
 		 490 aa  125  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.648727 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1240  hypothetical protein  26.89 
 
 		 349 aa  115  2.0000000000000002e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0625222  hitchhiker  0.00968227 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2510  hypothetical protein  29.74 
 
 		 350 aa  114  3e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.507027  normal  0.708898 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0157  hypothetical protein  29.11 
 
 		 350 aa  111  2.0000000000000002e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2361  hypothetical protein  29.15 
 
 		 350 aa  109  1e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2714  protein of unknown function DUF35  28.42 
 
 		 465 aa  103  6e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00764236  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0764  hypothetical protein  26.51 
 
 		 346 aa  103  8e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.128662  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0811  hypothetical protein  26.42 
 
 		 350 aa  102  1e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.836821  hitchhiker  0.000111453 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0338  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  26 
 
 		 347 aa  98.6  3e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.468823  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1932  hypothetical protein  28.3 
 
 		 349 aa  98.6  3e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0292488  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1142  hypothetical protein  27.17 
 
 		 349 aa  97.4  5e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.448183  hitchhiker  0.000356194 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1082  hypothetical protein  26.55 
 
 		 350 aa  97.4  6e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3869  hypothetical protein  26.78 
 
 		 348 aa  97.1  7e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0551  hypothetical protein  27.4 
 
 		 349 aa  96.7  8e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1627  hypothetical protein  28.39 
 
 		 347 aa  95.9  1e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1646  hypothetical protein  29.62 
 
 		 348 aa  95.5  2e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0793  hypothetical protein  26.91 
 
 		 349 aa  94.7  3e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0526  hypothetical protein  27.43 
 
 		 349 aa  93.6  7e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0020  hypothetical protein  26.21 
 
 		 348 aa  90.9  5e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1356  hypothetical protein  26.42 
 
 		 351 aa  90.1  9e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.711945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0430  hypothetical protein  26.2 
 
 		 348 aa  89.4  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.637557  normal  0.081806 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1390  hypothetical protein  27.8 
 
 		 345 aa  89.4  1e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0982  hypothetical protein  26.2 
 
 		 348 aa  85.1  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0151  hypothetical protein  28.03 
 
 		 350 aa  83.6  0.000000000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1461  hypothetical protein  26.63 
 
 		 349 aa  82.8  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1607  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  25.36 
 
 		 350 aa  80.5  0.00000000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0458  hypothetical protein  26.35 
 
 		 349 aa  79.7  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.288502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0379  hypothetical protein  26.06 
 
 		 349 aa  78.2  0.0000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0597  protein of unknown function DUF35  27.02 
 
 		 490 aa  72  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4021  protein of unknown function DUF35  26.57 
 
 		 481 aa  67  0.0000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.605764  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0968  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  27.75 
 
 		 389 aa  57.4  0.0000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.032504  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1184  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  28.99 
 
 		 385 aa  55.1  0.000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.298537  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1583  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  25.24 
 
 		 319 aa  54.7  0.000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0414109  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1516  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  27.27 
 
 		 333 aa  53.1  0.00001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.103952  normal  0.0316921 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0359  putative hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  29.7 
 
 		 437 aa  52  0.00003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1719  hydroxymethylglutaryl-coenzyme A synthase  28.75 
 
 		 389 aa  51.2  0.00005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.396765  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1925  protein of unknown function DUF35  35.25 
 
 		 474 aa  51.2  0.00005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0023  hypothetical protein  28.91 
 
 		 130 aa  50.4  0.00006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0602  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  24.92 
 
 		 319 aa  50.4  0.00007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000174189  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1372  3-hydroxy-3-methylglutaryl CoA synthase  26.88 
 
 		 387 aa  49.7  0.0001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.998569  hitchhiker  0.00000000102593 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1669  Beta-ketoacyl-acyl-carrier-protein synthase I  23.4 
 
 		 337 aa  50.1  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4422  protein of unknown function DUF35  36.36 
 
 		 474 aa  48.9  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.00766931  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0713  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  21.7 
 
 		 331 aa  48.9  0.0002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.36705 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1291  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  26.15 
 
 		 383 aa  48.9  0.0002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3948  Beta-ketoacyl-acyl-carrier-protein synthase I  23.33 
 
 		 314 aa  48.5  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.877471  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2090  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  24.17 
 
 		 358 aa  48.5  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0225889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1136  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  22.4 
 
 		 324 aa  48.1  0.0004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.896107  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0460  hypothetical protein  30.16 
 
 		 130 aa  47.8  0.0005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0490887  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1536  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  25.66 
 
 		 356 aa  47.4  0.0006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10544  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  24.92 
 
 		 335 aa  47  0.0007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.66749e-72  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1324  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  23.34 
 
 		 324 aa  47  0.0008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.760998  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2923  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  25.33 
 
 		 325 aa  47  0.0008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.437795  hitchhiker  0.000795877 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1459  hypothetical protein  29.37 
 
 		 130 aa  46.6  0.001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2669  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  26.18 
 
 		 355 aa  46.2  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00205787  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0890  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  23.22 
 
 		 310 aa  46.6  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1530  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  25.45 
 
 		 338 aa  46.2  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1715  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  26.18 
 
 		 355 aa  46.2  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.011888  hitchhiker  0.000000672919 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2634  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  26.18 
 
 		 355 aa  46.2  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.710058  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2748  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  26.18 
 
 		 355 aa  46.2  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.138517  normal  0.031659 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0991  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase III  29.67 
 
 		 324 aa  45.1  0.003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0237197  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2136  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  26.84 
 
 		 333 aa  43.9  0.006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0340  protein of unknown function DUF35  24.41 
 
 		 134 aa  44.3  0.006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.0000262786  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2518  putative hydroxymethylglutaryl-coenzyme A synthase  25.82 
 
 		 412 aa  43.9  0.007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4194  protein of unknown function DUF35  26.03 
 
 		 473 aa  43.9  0.007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.492043  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2608  hydroxymethylglutaryl-coenzyme A synthase  25.82 
 
 		 412 aa  43.9  0.007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1758  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  25.45 
 
 		 354 aa  43.5  0.009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00909742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4286  putative 3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  25.69 
 
 		 346 aa  43.5  0.01  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.12567  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>