46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1856 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_1856  3-oxoacyl-(ACP) synthase III  100 
 
 		 484 aa  980    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0653145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3069  hypothetical protein  41.37 
 
 		 502 aa  373  1e-102  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1550  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.63 
 
 		 913 aa  348  2e-94  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3240  hypothetical protein  43.07 
 
 		 485 aa  344  2e-93  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.57921  normal  0.496079 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2917  hypothetical protein  42.29 
 
 		 495 aa  342  9e-93  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.381583  normal  0.0360554 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2055  protein of unknown function DUF35  31.32 
 
 		 474 aa  167  4e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0203372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5351  protein of unknown function DUF35  30.91 
 
 		 490 aa  106  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.648727 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2714  protein of unknown function DUF35  29.93 
 
 		 465 aa  91.3  4e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00764236  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1082  hypothetical protein  25.9 
 
 		 350 aa  87.4  6e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0811  hypothetical protein  25.21 
 
 		 350 aa  85.5  0.000000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.836821  hitchhiker  0.000111453 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1240  hypothetical protein  26.1 
 
 		 349 aa  82.8  0.00000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0625222  hitchhiker  0.00968227 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1142  hypothetical protein  27.62 
 
 		 349 aa  80.9  0.00000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.448183  hitchhiker  0.000356194 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0793  hypothetical protein  24.86 
 
 		 349 aa  72.8  0.00000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0764  hypothetical protein  25.57 
 
 		 346 aa  72.4  0.00000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.128662  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0551  hypothetical protein  25.71 
 
 		 349 aa  72  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1646  hypothetical protein  26.96 
 
 		 348 aa  71.2  0.00000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2361  hypothetical protein  26.01 
 
 		 350 aa  70.5  0.00000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1607  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  24.72 
 
 		 350 aa  68.2  0.0000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1932  hypothetical protein  24.64 
 
 		 349 aa  68.2  0.0000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0292488  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0157  hypothetical protein  25.29 
 
 		 350 aa  66.6  0.000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2510  hypothetical protein  25.4 
 
 		 350 aa  65.5  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.507027  normal  0.708898 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1356  hypothetical protein  26.33 
 
 		 351 aa  65.5  0.000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.711945  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1627  hypothetical protein  25.66 
 
 		 347 aa  65.5  0.000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3869  hypothetical protein  27.19 
 
 		 348 aa  63.9  0.000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0526  hypothetical protein  23.48 
 
 		 349 aa  63.5  0.000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0020  hypothetical protein  23.34 
 
 		 348 aa  63.9  0.000000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0982  hypothetical protein  25.78 
 
 		 348 aa  60.5  0.00000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0458  hypothetical protein  24.02 
 
 		 349 aa  59.7  0.0000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.288502  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0338  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  23.81 
 
 		 347 aa  59.3  0.0000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.468823  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1461  hypothetical protein  24.78 
 
 		 349 aa  58.2  0.0000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0430  hypothetical protein  26.27 
 
 		 348 aa  58.5  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.637557  normal  0.081806 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0379  hypothetical protein  24.48 
 
 		 349 aa  57.4  0.0000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1390  hypothetical protein  24.68 
 
 		 345 aa  55.1  0.000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4422  protein of unknown function DUF35  27.93 
 
 		 474 aa  52.4  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.00766931  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0151  hypothetical protein  25.08 
 
 		 350 aa  49.7  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1459  hypothetical protein  32.65 
 
 		 130 aa  48.9  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1669  Beta-ketoacyl-acyl-carrier-protein synthase I  22.8 
 
 		 337 aa  47.8  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3120  3-oxoacyl-(acyl-carrier protein) synthase  20.2 
 
 		 349 aa  47.8  0.0005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4194  protein of unknown function DUF35  33.55 
 
 		 473 aa  47  0.0007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.492043  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0340  protein of unknown function DUF35  26.36 
 
 		 134 aa  46.2  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.0000262786  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0290  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  34.12 
 
 		 326 aa  45.4  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000281489  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0597  protein of unknown function DUF35  24.13 
 
 		 490 aa  44.7  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0377  hypothetical protein  30.61 
 
 		 130 aa  44.3  0.005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.253705  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0528  hypothetical protein  29.59 
 
 		 129 aa  43.9  0.007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.825077  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0460  hypothetical protein  30.61 
 
 		 130 aa  43.5  0.008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0490887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0155  hypothetical protein  29.73 
 
 		 130 aa  43.1  0.01  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>