More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_1627 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008942  Mlab_1627  hypothetical protein  100 
 
 
347 aa  706    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0157  hypothetical protein  75.57 
 
 
350 aa  531  1e-150  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2361  hypothetical protein  75.29 
 
 
350 aa  520  1e-146  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2510  hypothetical protein  72.7 
 
 
350 aa  507  9.999999999999999e-143  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.507027  normal  0.708898 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0151  hypothetical protein  75.29 
 
 
350 aa  495  1e-139  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1932  hypothetical protein  66.67 
 
 
349 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0292488  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0551  hypothetical protein  63.98 
 
 
349 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0020  hypothetical protein  63.51 
 
 
348 aa  449  1e-125  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0338  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  59.42 
 
 
347 aa  429  1e-119  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.468823  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1390  hypothetical protein  64.16 
 
 
345 aa  422  1e-117  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0526  hypothetical protein  63.51 
 
 
349 aa  421  1e-116  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0458  hypothetical protein  64.08 
 
 
349 aa  415  9.999999999999999e-116  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.288502  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1461  hypothetical protein  64.37 
 
 
349 aa  417  9.999999999999999e-116  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0379  hypothetical protein  63.51 
 
 
349 aa  412  1e-114  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1142  hypothetical protein  55.3 
 
 
349 aa  378  1e-104  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.448183  hitchhiker  0.000356194 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0811  hypothetical protein  48.27 
 
 
350 aa  358  8e-98  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.836821  hitchhiker  0.000111453 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0982  hypothetical protein  56.48 
 
 
348 aa  357  9.999999999999999e-98  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3869  hypothetical protein  52.75 
 
 
348 aa  356  2.9999999999999997e-97  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0430  hypothetical protein  55.62 
 
 
348 aa  353  2.9999999999999997e-96  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.637557  normal  0.081806 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1082  hypothetical protein  48.27 
 
 
350 aa  352  4e-96  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0793  hypothetical protein  48.55 
 
 
349 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1240  hypothetical protein  47.98 
 
 
349 aa  337  2.9999999999999997e-91  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0625222  hitchhiker  0.00968227 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0764  hypothetical protein  49.71 
 
 
346 aa  332  7.000000000000001e-90  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.128662  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1607  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  46 
 
 
350 aa  325  5e-88  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1356  hypothetical protein  47.11 
 
 
351 aa  320  3e-86  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.711945  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1646  hypothetical protein  43.06 
 
 
348 aa  293  3e-78  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4021  protein of unknown function DUF35  29.19 
 
 
481 aa  122  8e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.605764  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0597  protein of unknown function DUF35  29.25 
 
 
490 aa  121  1.9999999999999998e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4396  Hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  29.13 
 
 
369 aa  105  1e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0133862  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2917  hypothetical protein  29.61 
 
 
495 aa  103  4e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.381583  normal  0.0360554 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3069  hypothetical protein  28.39 
 
 
502 aa  101  2e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1550  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.61 
 
 
913 aa  99.4  9e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2122  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  25.91 
 
 
388 aa  92  1e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2622  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  25.15 
 
 
388 aa  92  1e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2569  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  25.15 
 
 
388 aa  92  1e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4422  protein of unknown function DUF35  26.07 
 
 
474 aa  91.7  2e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.00766931  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3240  hypothetical protein  28.01 
 
 
485 aa  91.3  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.57921  normal  0.496079 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1666  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  28.73 
 
 
384 aa  91.7  2e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.696762  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1925  protein of unknown function DUF35  28.41 
 
 
474 aa  90.1  5e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2518  putative hydroxymethylglutaryl-coenzyme A synthase  24.52 
 
 
412 aa  89  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2608  hydroxymethylglutaryl-coenzyme A synthase  24.52 
 
 
412 aa  89  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8252  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  26.35 
 
 
396 aa  87.4  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.112958  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2969  putative hydroxymethylglutaryl-coenzyme A synthase  24.65 
 
 
397 aa  86.3  8e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.763389  hitchhiker  0.0000211937 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1372  3-hydroxy-3-methylglutaryl CoA synthase  24.29 
 
 
387 aa  84.3  0.000000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.998569  hitchhiker  0.00000000102593 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1291  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  23.53 
 
 
383 aa  83.6  0.000000000000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0676  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  27.89 
 
 
385 aa  80.9  0.00000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000283469  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0968  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  25.94 
 
 
389 aa  80.5  0.00000000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.032504  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0359  putative hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  26.13 
 
 
437 aa  78.6  0.0000000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1184  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  25.77 
 
 
385 aa  75.1  0.000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.298537  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0678  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  23.85 
 
 
453 aa  74.3  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0215835  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1669  Beta-ketoacyl-acyl-carrier-protein synthase I  22.32 
 
 
337 aa  73.6  0.000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1316  HMG-CoA synthase  26.63 
 
 
390 aa  73.6  0.000000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.717019  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1583  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  24.19 
 
 
319 aa  72  0.00000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0414109  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0401  Hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  25.07 
 
 
445 aa  71.6  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10544  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  25.47 
 
 
335 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.66749e-72  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1719  hydroxymethylglutaryl-coenzyme A synthase  24.04 
 
 
389 aa  71.6  0.00000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.396765  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2055  protein of unknown function DUF35  29.52 
 
 
474 aa  72  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0203372  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4194  protein of unknown function DUF35  26.22 
 
 
473 aa  69.7  0.00000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.492043  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2766  Hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  24.61 
 
 
444 aa  69.7  0.00000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07545  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase  22.87 
 
 
335 aa  68.9  0.0000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01750  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  25.88 
 
 
342 aa  67.4  0.0000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.425442 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0602  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  23.55 
 
 
319 aa  66.2  0.0000000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000174189  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0646  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  23.66 
 
 
332 aa  66.2  0.0000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0016  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  25.17 
 
 
327 aa  66.2  0.0000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000262352  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2310  Hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  23.88 
 
 
445 aa  65.5  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0682  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  23.27 
 
 
332 aa  65.5  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0139915  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0828  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  24.76 
 
 
464 aa  64.7  0.000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0208074 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1324  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  23.91 
 
 
324 aa  64.7  0.000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.760998  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1136  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  23.91 
 
 
324 aa  64.7  0.000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.896107  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0985  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  22.76 
 
 
318 aa  64.3  0.000000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2987  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  23.51 
 
 
342 aa  63.9  0.000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00208212  normal  0.0221839 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1856  3-oxoacyl-(ACP) synthase III  25.66 
 
 
484 aa  63.5  0.000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0653145  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16750  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  24.26 
 
 
333 aa  62  0.00000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0510384  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1082  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  24.43 
 
 
310 aa  61.6  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.204932  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2810  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  24.44 
 
 
317 aa  61.2  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000411512  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0890  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  22.88 
 
 
310 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3511  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  25.57 
 
 
322 aa  60.8  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.410983  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1255  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  23.78 
 
 
310 aa  60.5  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1095  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  23.78 
 
 
310 aa  60.5  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1077  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  23.78 
 
 
310 aa  60.5  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1071  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  23.78 
 
 
310 aa  60.5  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000173774  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1184  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  23.78 
 
 
310 aa  60.5  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2313  Hydroxymethylglutaryl-coenzyme A synthase domain protein  23.46 
 
 
447 aa  60.5  0.00000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.859835  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1645  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  23.15 
 
 
344 aa  60.5  0.00000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1228  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  23.78 
 
 
310 aa  60.1  0.00000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1293  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  23.78 
 
 
310 aa  60.1  0.00000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2803  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  22.12 
 
 
346 aa  60.5  0.00000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09310  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  22.57 
 
 
350 aa  60.1  0.00000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.400021  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2505  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  24.44 
 
 
317 aa  60.5  0.00000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000055762  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4114  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  23.78 
 
 
310 aa  59.7  0.00000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2075  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  22.05 
 
 
335 aa  59.7  0.00000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000317439  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1154  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  21.38 
 
 
328 aa  59.7  0.00000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000934298  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1183  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  24.21 
 
 
325 aa  59.7  0.00000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.385882 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1332  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  23.45 
 
 
310 aa  59.3  0.00000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.985696  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1516  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  25.08 
 
 
333 aa  59.3  0.00000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.103952  normal  0.0316921 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0005  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  23.15 
 
 
331 aa  58.9  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.506079  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0713  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  19.87 
 
 
331 aa  58.9  0.0000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.36705 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0237  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  25.71 
 
 
328 aa  58.5  0.0000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.524505  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2466  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  29.5 
 
 
326 aa  58.9  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00040631  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2141  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  22.6 
 
 
335 aa  58.2  0.0000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>