260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0551 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0551  hypothetical protein  100 
 
 
349 aa  712    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1932  hypothetical protein  80.69 
 
 
349 aa  597  1e-170  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0292488  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1390  hypothetical protein  73.2 
 
 
345 aa  513  1e-144  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2361  hypothetical protein  69.74 
 
 
350 aa  488  1e-137  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2510  hypothetical protein  68.88 
 
 
350 aa  479  1e-134  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.507027  normal  0.708898 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0157  hypothetical protein  69.74 
 
 
350 aa  474  1e-133  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0020  hypothetical protein  62.82 
 
 
348 aa  472  1e-132  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0526  hypothetical protein  64.35 
 
 
349 aa  449  1e-125  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1461  hypothetical protein  63.48 
 
 
349 aa  441  1e-123  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1627  hypothetical protein  63.98 
 
 
347 aa  440  9.999999999999999e-123  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0458  hypothetical protein  63.48 
 
 
349 aa  441  9.999999999999999e-123  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.288502  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0379  hypothetical protein  62.61 
 
 
349 aa  435  1e-121  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0151  hypothetical protein  65.71 
 
 
350 aa  425  1e-118  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0338  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  60.58 
 
 
347 aa  422  1e-117  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.468823  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0811  hypothetical protein  54.91 
 
 
350 aa  404  1e-111  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.836821  hitchhiker  0.000111453 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1082  hypothetical protein  55.2 
 
 
350 aa  402  1e-111  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0793  hypothetical protein  55.46 
 
 
349 aa  397  1e-109  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1142  hypothetical protein  56.1 
 
 
349 aa  391  1e-108  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.448183  hitchhiker  0.000356194 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1356  hypothetical protein  56.07 
 
 
351 aa  387  1e-106  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.711945  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1240  hypothetical protein  52.74 
 
 
349 aa  382  1e-105  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0625222  hitchhiker  0.00968227 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3869  hypothetical protein  54.94 
 
 
348 aa  371  1e-102  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0982  hypothetical protein  55.52 
 
 
348 aa  361  1e-98  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0430  hypothetical protein  54.36 
 
 
348 aa  359  5e-98  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.637557  normal  0.081806 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0764  hypothetical protein  50.14 
 
 
346 aa  339  4e-92  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.128662  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1607  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  50.29 
 
 
350 aa  337  9.999999999999999e-92  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1646  hypothetical protein  47.99 
 
 
348 aa  327  2.0000000000000001e-88  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1550  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.46 
 
 
913 aa  104  2e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4021  protein of unknown function DUF35  28.37 
 
 
481 aa  102  9e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.605764  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3240  hypothetical protein  28.53 
 
 
485 aa  101  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.57921  normal  0.496079 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4396  Hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  27.91 
 
 
369 aa  101  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0133862  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0597  protein of unknown function DUF35  27.5 
 
 
490 aa  98.2  2e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3069  hypothetical protein  27.4 
 
 
502 aa  96.7  5e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2518  putative hydroxymethylglutaryl-coenzyme A synthase  27.1 
 
 
412 aa  93.6  5e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2608  hydroxymethylglutaryl-coenzyme A synthase  27.1 
 
 
412 aa  93.6  5e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2969  putative hydroxymethylglutaryl-coenzyme A synthase  27.12 
 
 
397 aa  90.1  5e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.763389  hitchhiker  0.0000211937 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2622  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  25.62 
 
 
388 aa  86.7  5e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2569  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  25.62 
 
 
388 aa  86.7  5e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8252  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  25.86 
 
 
396 aa  84  0.000000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.112958  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1316  HMG-CoA synthase  27.32 
 
 
390 aa  83.2  0.000000000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.717019  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2122  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  24.7 
 
 
388 aa  82  0.00000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1719  hydroxymethylglutaryl-coenzyme A synthase  24.61 
 
 
389 aa  81.6  0.00000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.396765  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1666  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  27.19 
 
 
384 aa  81.6  0.00000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.696762  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1372  3-hydroxy-3-methylglutaryl CoA synthase  23.88 
 
 
387 aa  81.3  0.00000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.998569  hitchhiker  0.00000000102593 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2917  hypothetical protein  27.94 
 
 
495 aa  80.5  0.00000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.381583  normal  0.0360554 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1291  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  24.61 
 
 
383 aa  80.1  0.00000000000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1925  protein of unknown function DUF35  27.07 
 
 
474 aa  78.6  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1583  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  23.23 
 
 
319 aa  74.7  0.000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0414109  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4422  protein of unknown function DUF35  25.21 
 
 
474 aa  73.9  0.000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.00766931  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0359  putative hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  27.09 
 
 
437 aa  73.6  0.000000000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0621  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase (HMG-CoA synthase)  25.91 
 
 
391 aa  73.2  0.000000000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000102903  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2766  Hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  24.66 
 
 
444 aa  73.2  0.000000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0968  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  24.77 
 
 
389 aa  72.8  0.000000000008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.032504  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2418  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  25.31 
 
 
333 aa  72  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0744  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  23.15 
 
 
328 aa  72  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.968089  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2313  Hydroxymethylglutaryl-coenzyme A synthase domain protein  28.57 
 
 
447 aa  69.3  0.0000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.859835  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2055  protein of unknown function DUF35  26.22 
 
 
474 aa  68.9  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0203372  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2310  Hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  24.74 
 
 
445 aa  68.2  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1856  3-oxoacyl-(ACP) synthase III  24.86 
 
 
484 aa  65.5  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0653145  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0031  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  23.08 
 
 
336 aa  64.7  0.000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0645987  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0682  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  21.91 
 
 
332 aa  64.7  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0139915  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0646  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  24.23 
 
 
332 aa  64.7  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0676  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  24.09 
 
 
385 aa  65.1  0.000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000283469  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0401  Hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  28.14 
 
 
445 aa  65.5  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1726  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  24.61 
 
 
331 aa  63.9  0.000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000259037  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1585  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  26.83 
 
 
316 aa  63.5  0.000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000421947  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0678  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  25.29 
 
 
453 aa  63.5  0.000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0215835  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1516  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  26.81 
 
 
333 aa  62.8  0.000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.103952  normal  0.0316921 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0229  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  24.38 
 
 
330 aa  62.8  0.000000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1293  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  22.01 
 
 
310 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1095  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  22.01 
 
 
310 aa  62.4  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1077  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  22.01 
 
 
310 aa  62.4  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1071  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  22.01 
 
 
310 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000173774  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1184  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  22.01 
 
 
310 aa  62.4  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1228  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  22.01 
 
 
310 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1613  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  23.58 
 
 
328 aa  62  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00239827  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1739  Hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  23.75 
 
 
447 aa  62  0.00000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1255  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  22.01 
 
 
310 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16750  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  25.48 
 
 
333 aa  62.4  0.00000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0510384  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1082  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  22.33 
 
 
310 aa  61.2  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.204932  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1332  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  22.01 
 
 
310 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.985696  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1418  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  26.13 
 
 
321 aa  62  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.732664 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1324  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  23.05 
 
 
324 aa  61.2  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.760998  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4114  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  22.01 
 
 
310 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_83020  predicted protein  23.71 
 
 
447 aa  61.6  0.00000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.203181 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2075  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  22.09 
 
 
335 aa  62  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000317439  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2595  Hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  25 
 
 
413 aa  61.2  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1136  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  22.88 
 
 
324 aa  61.2  0.00000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.896107  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0165  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  22.33 
 
 
316 aa  60.8  0.00000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.367012  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1184  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  23.33 
 
 
385 aa  60.5  0.00000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.298537  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1179  Hydroxymethylglutaryl-coenzyme A synthase domain protein  23.23 
 
 
407 aa  60.5  0.00000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1492  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  24.07 
 
 
333 aa  58.5  0.0000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.560119  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0890  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  20 
 
 
310 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1593  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase III  22.64 
 
 
323 aa  58.9  0.0000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00182036  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1198  Beta-ketoacyl-acyl-carrier-protein synthase I  24.74 
 
 
346 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0921466  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4194  protein of unknown function DUF35  22.86 
 
 
473 aa  58.5  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.492043  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2601  Hydroxymethylglutaryl-coenzyme A synthase domain protein  27.05 
 
 
424 aa  57.8  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0233973  normal  0.914531 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1086  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  24.9 
 
 
306 aa  56.6  0.0000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.298736  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2505  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  23.01 
 
 
317 aa  56.6  0.0000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000055762  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04923  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase, expressed (Eurofung)  23.72 
 
 
459 aa  56.2  0.0000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000140052  normal  0.183137 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0113  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  21.52 
 
 
332 aa  56.2  0.0000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>