72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_8252 on replicon NC_011887
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011887  Mnod_8252  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  100 
 
 		 396 aa  811    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.112958  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1719  hydroxymethylglutaryl-coenzyme A synthase  47.01 
 
 		 389 aa  390  1e-107  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.396765  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2569  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  45.83 
 
 		 388 aa  310  2e-83  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2122  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  44.59 
 
 		 388 aa  310  2e-83  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2622  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  45.83 
 
 		 388 aa  310  2e-83  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1666  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  42.12 
 
 		 384 aa  282  6.000000000000001e-75  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.696762  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1372  3-hydroxy-3-methylglutaryl CoA synthase  42.49 
 
 		 387 aa  281  1e-74  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.998569  hitchhiker  0.00000000102593 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0676  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  46.32 
 
 		 385 aa  280  3e-74  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000283469  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0359  putative hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  42.09 
 
 		 437 aa  277  3e-73  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0968  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  40.78 
 
 		 389 aa  277  3e-73  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.032504  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1291  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  36.13 
 
 		 383 aa  270  2.9999999999999997e-71  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1184  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  41.43 
 
 		 385 aa  269  5.9999999999999995e-71  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.298537  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0621  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase (HMG-CoA synthase)  40.66 
 
 		 391 aa  261  1e-68  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000102903  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1316  HMG-CoA synthase  39.48 
 
 		 390 aa  256  7e-67  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.717019  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2595  Hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  40.82 
 
 		 413 aa  174  2.9999999999999996e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1931  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase family protein  29.93 
 
 		 412 aa  169  1e-40  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.808673  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5295  Hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  32.38 
 
 		 417 aa  167  2.9999999999999998e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0778158  normal  0.248767 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1670  polyketide biosynthesis protein  34.42 
 
 		 418 aa  167  4e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.130518  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2884  Hydroxymethylglutaryl-coenzyme A synthase domain protein  33.42 
 
 		 419 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.614903 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0828  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  30.24 
 
 		 464 aa  160  3e-38  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0208074 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1179  Hydroxymethylglutaryl-coenzyme A synthase domain protein  29.85 
 
 		 407 aa  158  2e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4396  Hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  34.82 
 
 		 369 aa  157  3e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0133862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0401  Hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  33.33 
 
 		 445 aa  155  1e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1418  Hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  33.16 
 
 		 420 aa  150  3e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2766  Hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  33.51 
 
 		 444 aa  150  3e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2310  Hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  31.7 
 
 		 445 aa  149  8e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2613  putative hydroxymethylglutaryl-coenzyme A synthase  31.97 
 
 		 419 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.457692  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1212  polyketide biosynthesis protein, interruption-N  31.98 
 
 		 389 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.737994  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1739  Hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  33.42 
 
 		 447 aa  148  2.0000000000000003e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2601  Hydroxymethylglutaryl-coenzyme A synthase domain protein  35.79 
 
 		 424 aa  148  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0233973  normal  0.914531 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1384  putative polyketide biosynthesis protein pksG  31.97 
 
 		 419 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1470  putative polyketide biosynthesis protein pksG  31.97 
 
 		 419 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0349844  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2313  Hydroxymethylglutaryl-coenzyme A synthase domain protein  31.95 
 
 		 447 aa  144  4e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.859835  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2608  hydroxymethylglutaryl-coenzyme A synthase  31.23 
 
 		 412 aa  143  5e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2518  putative hydroxymethylglutaryl-coenzyme A synthase  31.23 
 
 		 412 aa  143  5e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0678  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  24.76 
 
 		 453 aa  139  1e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0215835  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2969  putative hydroxymethylglutaryl-coenzyme A synthase  30.92 
 
 		 397 aa  130  4.0000000000000003e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.763389  hitchhiker  0.0000211937 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0703  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  26.38 
 
 		 407 aa  126  8.000000000000001e-28  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_16649  predicted protein  28.72 
 
 		 461 aa  111  3e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.24052  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG02670  conserved hypothetical protein  25.83 
 
 		 492 aa  110  5e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.250048  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_83020  predicted protein  26.95 
 
 		 447 aa  109  7.000000000000001e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.203181 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04923  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase, expressed (Eurofung)  24.78 
 
 		 459 aa  101  2e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000140052  normal  0.183137 
 
 
-
 
NC_006685  CNC05080  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase, putative  30.97 
 
 		 498 aa  95.5  1e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0146937  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1142  hypothetical protein  26.4 
 
 		 349 aa  91.7  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.448183  hitchhiker  0.000356194 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2361  hypothetical protein  26.48 
 
 		 350 aa  85.9  0.000000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1607  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  26.38 
 
 		 350 aa  85.1  0.000000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0020  hypothetical protein  25.77 
 
 		 348 aa  85.1  0.000000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0551  hypothetical protein  25.86 
 
 		 349 aa  84  0.000000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0458  hypothetical protein  27.15 
 
 		 349 aa  80.9  0.00000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.288502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1461  hypothetical protein  27.15 
 
 		 349 aa  80.9  0.00000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1627  hypothetical protein  26.35 
 
 		 347 aa  80.9  0.00000000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0379  hypothetical protein  26.59 
 
 		 349 aa  79.7  0.00000000000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2510  hypothetical protein  25.37 
 
 		 350 aa  79  0.0000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.507027  normal  0.708898 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0526  hypothetical protein  26.86 
 
 		 349 aa  79  0.0000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1646  hypothetical protein  25.77 
 
 		 348 aa  79  0.0000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0811  hypothetical protein  26.51 
 
 		 350 aa  77  0.0000000000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.836821  hitchhiker  0.000111453 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3869  hypothetical protein  27.48 
 
 		 348 aa  76.6  0.0000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1082  hypothetical protein  25.97 
 
 		 350 aa  74.3  0.000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1240  hypothetical protein  26.69 
 
 		 349 aa  74.3  0.000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0625222  hitchhiker  0.00968227 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0338  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  24.15 
 
 		 347 aa  71.6  0.00000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.468823  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0157  hypothetical protein  26.17 
 
 		 350 aa  70.9  0.00000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1390  hypothetical protein  27.44 
 
 		 345 aa  70.9  0.00000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0793  hypothetical protein  26.46 
 
 		 349 aa  70.5  0.00000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1932  hypothetical protein  23.6 
 
 		 349 aa  70.5  0.00000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0292488  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0982  hypothetical protein  27.41 
 
 		 348 aa  68.6  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0151  hypothetical protein  25.34 
 
 		 350 aa  67.8  0.0000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0430  hypothetical protein  27.35 
 
 		 348 aa  67  0.0000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.637557  normal  0.081806 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0764  hypothetical protein  29.18 
 
 		 346 aa  66.2  0.000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.128662  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1356  hypothetical protein  25.97 
 
 		 351 aa  63.9  0.000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.711945  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0005  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  29.41 
 
 		 335 aa  47.8  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2055  protein of unknown function DUF35  25.91 
 
 		 474 aa  47  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0203372  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1192  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  22.15 
 
 		 324 aa  43.5  0.007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>