84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_2518 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010465  YPK_2608  hydroxymethylglutaryl-coenzyme A synthase  100 
 
 
412 aa  855    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2969  putative hydroxymethylglutaryl-coenzyme A synthase  99.75 
 
 
397 aa  825    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.763389  hitchhiker  0.0000211937 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2518  putative hydroxymethylglutaryl-coenzyme A synthase  100 
 
 
412 aa  855    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1179  Hydroxymethylglutaryl-coenzyme A synthase domain protein  37.62 
 
 
407 aa  288  2e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1931  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase family protein  36.39 
 
 
412 aa  258  1e-67  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.808673  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5295  Hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  36.85 
 
 
417 aa  237  2e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0778158  normal  0.248767 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2884  Hydroxymethylglutaryl-coenzyme A synthase domain protein  36.07 
 
 
419 aa  232  8.000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.614903 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1670  polyketide biosynthesis protein  35.24 
 
 
418 aa  219  5e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.130518  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1384  putative polyketide biosynthesis protein pksG  32.78 
 
 
419 aa  218  1e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1470  putative polyketide biosynthesis protein pksG  32.78 
 
 
419 aa  218  1e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0349844  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2613  putative hydroxymethylglutaryl-coenzyme A synthase  32.55 
 
 
419 aa  216  5e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.457692  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2595  Hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  33.73 
 
 
413 aa  213  3.9999999999999995e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1212  polyketide biosynthesis protein, interruption-N  34.04 
 
 
389 aa  211  2e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.737994  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1418  Hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  33.56 
 
 
420 aa  211  3e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2601  Hydroxymethylglutaryl-coenzyme A synthase domain protein  33.06 
 
 
424 aa  188  2e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0233973  normal  0.914531 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1719  hydroxymethylglutaryl-coenzyme A synthase  33.74 
 
 
389 aa  171  2e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.396765  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1291  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  32.88 
 
 
383 aa  168  1e-40  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0621  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase (HMG-CoA synthase)  34.69 
 
 
391 aa  165  2.0000000000000002e-39  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000102903  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1184  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  31.15 
 
 
385 aa  160  3e-38  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.298537  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1316  HMG-CoA synthase  31.9 
 
 
390 aa  156  5.0000000000000005e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.717019  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1666  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  29.78 
 
 
384 aa  149  8e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.696762  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2122  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  27.98 
 
 
388 aa  148  2.0000000000000003e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8252  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  31.23 
 
 
396 aa  143  5e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.112958  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2569  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  27.94 
 
 
388 aa  142  8e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2622  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  27.94 
 
 
388 aa  142  8e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0676  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  30.79 
 
 
385 aa  140  3.9999999999999997e-32  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000283469  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1372  3-hydroxy-3-methylglutaryl CoA synthase  28.18 
 
 
387 aa  133  6e-30  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.998569  hitchhiker  0.00000000102593 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4396  Hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  30.46 
 
 
369 aa  129  9.000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0133862  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0968  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  28.02 
 
 
389 aa  122  1.9999999999999998e-26  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.032504  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0359  putative hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  27.94 
 
 
437 aa  120  3e-26  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0401  Hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  26.42 
 
 
445 aa  116  8.999999999999998e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2310  Hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  27.18 
 
 
445 aa  113  8.000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2313  Hydroxymethylglutaryl-coenzyme A synthase domain protein  26.89 
 
 
447 aa  112  1.0000000000000001e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.859835  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1739  Hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  26.65 
 
 
447 aa  109  7.000000000000001e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2766  Hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  26.43 
 
 
444 aa  101  3e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0703  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  26.63 
 
 
407 aa  97.1  5e-19  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0551  hypothetical protein  27.1 
 
 
349 aa  93.6  6e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1932  hypothetical protein  26.56 
 
 
349 aa  91.3  3e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0292488  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0828  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  28.03 
 
 
464 aa  90.1  6e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0208074 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0678  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  24.3 
 
 
453 aa  87.8  3e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0215835  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0020  hypothetical protein  24.51 
 
 
348 aa  82.8  0.00000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04923  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase, expressed (Eurofung)  22.29 
 
 
459 aa  82  0.00000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000140052  normal  0.183137 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1627  hypothetical protein  24.52 
 
 
347 aa  82  0.00000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0811  hypothetical protein  24.8 
 
 
350 aa  81.6  0.00000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.836821  hitchhiker  0.000111453 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_83020  predicted protein  24.74 
 
 
447 aa  79.3  0.0000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.203181 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1082  hypothetical protein  25 
 
 
350 aa  72.8  0.000000000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2510  hypothetical protein  24.74 
 
 
350 aa  72.8  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.507027  normal  0.708898 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2361  hypothetical protein  23.98 
 
 
350 aa  72  0.00000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1142  hypothetical protein  27.14 
 
 
349 aa  72  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.448183  hitchhiker  0.000356194 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1390  hypothetical protein  25.72 
 
 
345 aa  72  0.00000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1240  hypothetical protein  25.2 
 
 
349 aa  70.5  0.00000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0625222  hitchhiker  0.00968227 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0157  hypothetical protein  25.4 
 
 
350 aa  70.1  0.00000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0526  hypothetical protein  25.07 
 
 
349 aa  67.8  0.0000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0338  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  24.32 
 
 
347 aa  67  0.0000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.468823  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0793  hypothetical protein  24.13 
 
 
349 aa  66.6  0.0000000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1461  hypothetical protein  24.04 
 
 
349 aa  63.2  0.000000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1356  hypothetical protein  24.07 
 
 
351 aa  61.6  0.00000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.711945  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG02670  conserved hypothetical protein  21.95 
 
 
492 aa  61.2  0.00000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.250048  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0379  hypothetical protein  23.77 
 
 
349 aa  60.1  0.00000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1607  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  23.84 
 
 
350 aa  59.7  0.00000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0458  hypothetical protein  23.77 
 
 
349 aa  59.3  0.0000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.288502  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1646  hypothetical protein  23.45 
 
 
348 aa  58.2  0.0000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC05080  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase, putative  29.05 
 
 
498 aa  55.8  0.000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0146937  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0151  hypothetical protein  24.39 
 
 
350 aa  55.5  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0915  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  27.81 
 
 
326 aa  54.3  0.000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.170701 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0980  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  27.15 
 
 
326 aa  53.5  0.000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.107285 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3869  hypothetical protein  23.37 
 
 
348 aa  52.8  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0005  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  22.96 
 
 
331 aa  50.1  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.506079  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17460  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  35.71 
 
 
343 aa  48.5  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.352579  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1050  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  26.49 
 
 
326 aa  47.8  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.682522  normal  0.412179 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2430  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  26.51 
 
 
326 aa  48.1  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_16649  predicted protein  21.41 
 
 
461 aa  47.8  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.24052  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3240  hypothetical protein  35.37 
 
 
485 aa  47.4  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.57921  normal  0.496079 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0430  hypothetical protein  23.45 
 
 
348 aa  46.6  0.0008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.637557  normal  0.081806 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2418  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  27.11 
 
 
333 aa  46.2  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0982  hypothetical protein  25.77 
 
 
348 aa  45.8  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0005  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  22.33 
 
 
331 aa  45.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0005  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  21.7 
 
 
331 aa  44.3  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.459918 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0611  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  25.54 
 
 
330 aa  44.3  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000255652 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3069  hypothetical protein  25.82 
 
 
502 aa  43.9  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1516  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  26.53 
 
 
333 aa  43.5  0.006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.103952  normal  0.0316921 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0764  hypothetical protein  24.18 
 
 
346 aa  43.5  0.006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.128662  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2265  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  25.9 
 
 
326 aa  43.5  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.3727  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3278  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  28.57 
 
 
341 aa  43.1  0.008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.298205  normal  0.218324 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>