More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0982 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_0982  hypothetical protein  100 
 
 
348 aa  699    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0430  hypothetical protein  94.25 
 
 
348 aa  635    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.637557  normal  0.081806 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1142  hypothetical protein  77.59 
 
 
349 aa  556  1e-157  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.448183  hitchhiker  0.000356194 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3869  hypothetical protein  70.03 
 
 
348 aa  500  1e-140  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0551  hypothetical protein  55.52 
 
 
349 aa  384  1e-105  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1932  hypothetical protein  54.36 
 
 
349 aa  380  1e-104  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0292488  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1390  hypothetical protein  58.48 
 
 
345 aa  377  1e-103  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2510  hypothetical protein  54.15 
 
 
350 aa  372  1e-102  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.507027  normal  0.708898 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1627  hypothetical protein  56.48 
 
 
347 aa  373  1e-102  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0764  hypothetical protein  56.42 
 
 
346 aa  368  1e-101  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.128662  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2361  hypothetical protein  55.01 
 
 
350 aa  366  1e-100  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0157  hypothetical protein  53.3 
 
 
350 aa  360  2e-98  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0020  hypothetical protein  50.29 
 
 
348 aa  356  2.9999999999999997e-97  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0151  hypothetical protein  56.16 
 
 
350 aa  352  5e-96  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0526  hypothetical protein  52.01 
 
 
349 aa  350  3e-95  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1461  hypothetical protein  53.16 
 
 
349 aa  348  5e-95  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0458  hypothetical protein  52.87 
 
 
349 aa  347  2e-94  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.288502  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0379  hypothetical protein  52.3 
 
 
349 aa  344  1e-93  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0338  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  49.86 
 
 
347 aa  339  5e-92  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.468823  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0811  hypothetical protein  49.42 
 
 
350 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.836821  hitchhiker  0.000111453 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1240  hypothetical protein  48.12 
 
 
349 aa  325  5e-88  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0625222  hitchhiker  0.00968227 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1082  hypothetical protein  47.38 
 
 
350 aa  322  5e-87  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1646  hypothetical protein  47.8 
 
 
348 aa  320  1.9999999999999998e-86  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0793  hypothetical protein  48.7 
 
 
349 aa  316  4e-85  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1607  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  46.22 
 
 
350 aa  311  7.999999999999999e-84  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1356  hypothetical protein  50 
 
 
351 aa  310  2e-83  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.711945  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2917  hypothetical protein  28.57 
 
 
495 aa  103  5e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.381583  normal  0.0360554 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3069  hypothetical protein  26.2 
 
 
502 aa  100  3e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3240  hypothetical protein  29.94 
 
 
485 aa  95.9  9e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.57921  normal  0.496079 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2055  protein of unknown function DUF35  31.98 
 
 
474 aa  88.2  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0203372  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1719  hydroxymethylglutaryl-coenzyme A synthase  26.22 
 
 
389 aa  87.8  2e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.396765  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0597  protein of unknown function DUF35  28.21 
 
 
490 aa  87.8  3e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1550  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.54 
 
 
913 aa  87  4e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4021  protein of unknown function DUF35  28.02 
 
 
481 aa  84.7  0.000000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.605764  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4422  protein of unknown function DUF35  27.91 
 
 
474 aa  82.4  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.00766931  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4194  protein of unknown function DUF35  28.82 
 
 
473 aa  81.6  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.492043  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8252  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  27.41 
 
 
396 aa  81.3  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.112958  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0401  Hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  25.07 
 
 
445 aa  80.1  0.00000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2766  Hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  30.34 
 
 
444 aa  76.6  0.0000000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0744  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  26.17 
 
 
328 aa  75.5  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.968089  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2313  Hydroxymethylglutaryl-coenzyme A synthase domain protein  24.59 
 
 
447 aa  74.7  0.000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.859835  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2502  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  23.1 
 
 
337 aa  73.6  0.000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0775365 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3556  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase III  28.18 
 
 
319 aa  72.8  0.000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.896137  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1372  3-hydroxy-3-methylglutaryl CoA synthase  27.03 
 
 
387 aa  72  0.00000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.998569  hitchhiker  0.00000000102593 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0676  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  28.47 
 
 
385 aa  71.2  0.00000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000283469  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2310  Hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  24.93 
 
 
445 aa  70.5  0.00000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1856  3-oxoacyl-(ACP) synthase III  26.27 
 
 
484 aa  70.1  0.00000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0653145  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1739  Hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  25 
 
 
447 aa  69.3  0.0000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2075  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  22.89 
 
 
335 aa  68.2  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000317439  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1645  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  22.67 
 
 
344 aa  67.8  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2122  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  21.88 
 
 
388 aa  65.5  0.000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2569  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  22.94 
 
 
388 aa  65.5  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2622  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  22.94 
 
 
388 aa  65.5  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0890  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  21.56 
 
 
310 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10544  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  25.37 
 
 
335 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.66749e-72  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2595  Hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  26.43 
 
 
413 aa  64.7  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1418  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  27.08 
 
 
321 aa  64.7  0.000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.732664 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1516  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  27.34 
 
 
333 aa  65.1  0.000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.103952  normal  0.0316921 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1583  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  22.05 
 
 
319 aa  64.3  0.000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0414109  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1989  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase III  26.06 
 
 
334 aa  64.3  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0165  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  25.99 
 
 
316 aa  63.9  0.000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.367012  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0016  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  25 
 
 
327 aa  63.9  0.000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000262352  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2490  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  27.02 
 
 
327 aa  63.5  0.000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.201927 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2987  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  24.45 
 
 
342 aa  63.5  0.000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00208212  normal  0.0221839 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0459  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  23.33 
 
 
336 aa  62.8  0.000000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4114  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  22.47 
 
 
310 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1095  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  22.15 
 
 
310 aa  62  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1077  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  22.15 
 
 
310 aa  62  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1071  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  22.15 
 
 
310 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000173774  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1184  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  22.15 
 
 
310 aa  62  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0749  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  21.32 
 
 
310 aa  62.4  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000257819  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1293  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  21.84 
 
 
310 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1925  protein of unknown function DUF35  25.42 
 
 
474 aa  61.6  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0359  putative hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  29.13 
 
 
437 aa  61.6  0.00000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1332  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  21.84 
 
 
310 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.985696  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1255  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  21.84 
 
 
310 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1666  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  25.31 
 
 
384 aa  61.6  0.00000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.696762  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1184  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  26.67 
 
 
385 aa  60.8  0.00000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.298537  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1645  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase III  25.15 
 
 
346 aa  60.8  0.00000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0863125  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4396  Hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  26.33 
 
 
369 aa  60.8  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0133862  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0682  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  22.39 
 
 
332 aa  60.5  0.00000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0139915  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51390  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  23.94 
 
 
337 aa  60.5  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000116987 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1082  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  22.15 
 
 
310 aa  60.5  0.00000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.204932  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2608  hydroxymethylglutaryl-coenzyme A synthase  24.62 
 
 
412 aa  60.1  0.00000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1228  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  21.84 
 
 
310 aa  60.5  0.00000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2518  putative hydroxymethylglutaryl-coenzyme A synthase  24.62 
 
 
412 aa  60.1  0.00000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1932  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  24.69 
 
 
332 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.543004  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0914  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase III  26.38 
 
 
323 aa  60.1  0.00000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2969  putative hydroxymethylglutaryl-coenzyme A synthase  24.62 
 
 
397 aa  60.1  0.00000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.763389  hitchhiker  0.0000211937 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2505  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  23.51 
 
 
317 aa  60.1  0.00000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000055762  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1378  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase III  26.39 
 
 
315 aa  59.7  0.00000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.210252  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1291  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  19.73 
 
 
383 aa  59.7  0.00000007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07545  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase  22.09 
 
 
335 aa  59.7  0.00000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2206  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  25.17 
 
 
353 aa  59.7  0.00000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000102369 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2467  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  29.52 
 
 
353 aa  59.7  0.00000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.000376191  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12020  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  24.12 
 
 
320 aa  59.7  0.00000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0762403  normal  0.118636 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1726  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  22.19 
 
 
331 aa  59.3  0.00000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000259037  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5766  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  24.69 
 
 
332 aa  59.3  0.00000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0713  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  21.2 
 
 
331 aa  59.3  0.0000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.36705 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2037  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  24.39 
 
 
332 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>