73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0676 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_0676  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  100 
 
 		 385 aa  793    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000283469  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1184  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  51.68 
 
 		 385 aa  385  1e-106  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.298537  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2122  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  51.48 
 
 		 388 aa  350  2e-95  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1291  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  45.74 
 
 		 383 aa  348  8e-95  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1666  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  48.96 
 
 		 384 aa  345  5e-94  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.696762  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2569  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  50.9 
 
 		 388 aa  344  2e-93  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2622  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  50.9 
 
 		 388 aa  344  2e-93  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0968  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  48.97 
 
 		 389 aa  343  2e-93  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.032504  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0621  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase (HMG-CoA synthase)  48.32 
 
 		 391 aa  336  2.9999999999999997e-91  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000102903  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1372  3-hydroxy-3-methylglutaryl CoA synthase  45.99 
 
 		 387 aa  334  2e-90  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.998569  hitchhiker  0.00000000102593 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0359  putative hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  46.15 
 
 		 437 aa  329  5.0000000000000004e-89  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1719  hydroxymethylglutaryl-coenzyme A synthase  43.59 
 
 		 389 aa  324  2e-87  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.396765  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1316  HMG-CoA synthase  46.25 
 
 		 390 aa  319  5e-86  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.717019  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8252  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  46.32 
 
 		 396 aa  298  2e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.112958  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5295  Hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  33.08 
 
 		 417 aa  188  1e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0778158  normal  0.248767 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1670  polyketide biosynthesis protein  31.27 
 
 		 418 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.130518  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2595  Hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  32.38 
 
 		 413 aa  171  3e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1212  polyketide biosynthesis protein, interruption-N  30.31 
 
 		 389 aa  170  5e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.737994  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1179  Hydroxymethylglutaryl-coenzyme A synthase domain protein  28.33 
 
 		 407 aa  168  1e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2310  Hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  31.57 
 
 		 445 aa  167  2.9999999999999998e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2613  putative hydroxymethylglutaryl-coenzyme A synthase  29.46 
 
 		 419 aa  166  8e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.457692  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1470  putative polyketide biosynthesis protein pksG  30.54 
 
 		 419 aa  166  9e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0349844  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1384  putative polyketide biosynthesis protein pksG  30.54 
 
 		 419 aa  166  9e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2884  Hydroxymethylglutaryl-coenzyme A synthase domain protein  31.28 
 
 		 419 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.614903 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1931  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase family protein  32.6 
 
 		 412 aa  163  5.0000000000000005e-39  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.808673  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2601  Hydroxymethylglutaryl-coenzyme A synthase domain protein  32.19 
 
 		 424 aa  162  8.000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0233973  normal  0.914531 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0678  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  27.92 
 
 		 453 aa  160  3e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0215835  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2313  Hydroxymethylglutaryl-coenzyme A synthase domain protein  31.54 
 
 		 447 aa  157  3e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.859835  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2766  Hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  32.35 
 
 		 444 aa  157  3e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2518  putative hydroxymethylglutaryl-coenzyme A synthase  32.32 
 
 		 412 aa  156  7e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2608  hydroxymethylglutaryl-coenzyme A synthase  32.32 
 
 		 412 aa  156  7e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0401  Hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  31.47 
 
 		 445 aa  155  8e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1418  Hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  31.1 
 
 		 420 aa  155  2e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1739  Hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  31.3 
 
 		 447 aa  152  1e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2969  putative hydroxymethylglutaryl-coenzyme A synthase  32.48 
 
 		 397 aa  149  7e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.763389  hitchhiker  0.0000211937 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4396  Hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  31.81 
 
 		 369 aa  149  1.0000000000000001e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0133862  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0828  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  28.64 
 
 		 464 aa  139  1e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0208074 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0703  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  28.91 
 
 		 407 aa  129  8.000000000000001e-29  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_83020  predicted protein  28.49 
 
 		 447 aa  108  1e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.203181 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04923  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase, expressed (Eurofung)  26.27 
 
 		 459 aa  98.2  2e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000140052  normal  0.183137 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_16649  predicted protein  25.76 
 
 		 461 aa  88.6  2e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.24052  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1627  hypothetical protein  27.89 
 
 		 347 aa  83.6  0.000000000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1142  hypothetical protein  26.99 
 
 		 349 aa  80.9  0.00000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.448183  hitchhiker  0.000356194 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1607  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  25.42 
 
 		 350 aa  80.9  0.00000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG02670  conserved hypothetical protein  23.73 
 
 		 492 aa  75.9  0.000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.250048  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3869  hypothetical protein  25.71 
 
 		 348 aa  75.5  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0551  hypothetical protein  24.09 
 
 		 349 aa  73.2  0.000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0526  hypothetical protein  24.16 
 
 		 349 aa  72  0.00000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0020  hypothetical protein  22.26 
 
 		 348 aa  69.3  0.00000000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1646  hypothetical protein  24.19 
 
 		 348 aa  68.9  0.0000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0458  hypothetical protein  23.33 
 
 		 349 aa  68.6  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.288502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1461  hypothetical protein  23.33 
 
 		 349 aa  67  0.0000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0811  hypothetical protein  22.25 
 
 		 350 aa  67  0.0000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.836821  hitchhiker  0.000111453 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0982  hypothetical protein  27.78 
 
 		 348 aa  67  0.0000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0430  hypothetical protein  27.15 
 
 		 348 aa  66.2  0.0000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.637557  normal  0.081806 
 
 
-
 
NC_006685  CNC05080  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase, putative  30.24 
 
 		 498 aa  66.2  0.0000000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0146937  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0379  hypothetical protein  23 
 
 		 349 aa  65.9  0.000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2510  hypothetical protein  24.32 
 
 		 350 aa  65.1  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.507027  normal  0.708898 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1932  hypothetical protein  21.88 
 
 		 349 aa  63.5  0.000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0292488  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2361  hypothetical protein  24.09 
 
 		 350 aa  63.5  0.000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0157  hypothetical protein  25.34 
 
 		 350 aa  63.5  0.000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0764  hypothetical protein  25.77 
 
 		 346 aa  62.4  0.00000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.128662  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1082  hypothetical protein  22.22 
 
 		 350 aa  60.8  0.00000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0793  hypothetical protein  21.58 
 
 		 349 aa  59.7  0.00000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0338  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  22.64 
 
 		 347 aa  57.8  0.0000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.468823  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1390  hypothetical protein  23.18 
 
 		 345 aa  57.4  0.0000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1240  hypothetical protein  24.82 
 
 		 349 aa  55.8  0.000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0625222  hitchhiker  0.00968227 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1356  hypothetical protein  21.58 
 
 		 351 aa  55.8  0.000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.711945  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0151  hypothetical protein  23.43 
 
 		 350 aa  53.1  0.000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1585  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  32.84 
 
 		 316 aa  50.8  0.00004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000421947  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2428  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase III  31.09 
 
 		 330 aa  48.1  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000247729  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2505  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  30.15 
 
 		 317 aa  44.7  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000055762  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2810  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  29.41 
 
 		 317 aa  43.5  0.006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000411512  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>