95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_1291 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013515  Smon_1291  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  100 
 
 		 383 aa  769    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0621  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase (HMG-CoA synthase)  50.39 
 
 		 391 aa  371  1e-101  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000102903  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1316  HMG-CoA synthase  51.03 
 
 		 390 aa  370  1e-101  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.717019  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1666  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  48.45 
 
 		 384 aa  356  3.9999999999999996e-97  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.696762  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2122  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  46.51 
 
 		 388 aa  343  2.9999999999999997e-93  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0676  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  45.85 
 
 		 385 aa  329  5.0000000000000004e-89  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000283469  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2569  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  47.18 
 
 		 388 aa  328  7e-89  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2622  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  47.18 
 
 		 388 aa  328  7e-89  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1372  3-hydroxy-3-methylglutaryl CoA synthase  50 
 
 		 387 aa  322  7e-87  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.998569  hitchhiker  0.00000000102593 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0359  putative hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  42.97 
 
 		 437 aa  292  6e-78  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1184  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  42.17 
 
 		 385 aa  284  2.0000000000000002e-75  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.298537  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8252  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  36.13 
 
 		 396 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.112958  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1719  hydroxymethylglutaryl-coenzyme A synthase  37.37 
 
 		 389 aa  267  2e-70  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.396765  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0968  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  42.31 
 
 		 389 aa  262  6e-69  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.032504  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2884  Hydroxymethylglutaryl-coenzyme A synthase domain protein  31.91 
 
 		 419 aa  176  5e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.614903 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0678  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  28.43 
 
 		 453 aa  173  3.9999999999999995e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0215835  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2518  putative hydroxymethylglutaryl-coenzyme A synthase  32.88 
 
 		 412 aa  168  1e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2608  hydroxymethylglutaryl-coenzyme A synthase  32.88 
 
 		 412 aa  168  1e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4396  Hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  30.06 
 
 		 369 aa  166  5.9999999999999996e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0133862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5295  Hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  33.24 
 
 		 417 aa  164  3e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0778158  normal  0.248767 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1670  polyketide biosynthesis protein  28.8 
 
 		 418 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.130518  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2969  putative hydroxymethylglutaryl-coenzyme A synthase  32.48 
 
 		 397 aa  160  3e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.763389  hitchhiker  0.0000211937 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1931  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase family protein  34.85 
 
 		 412 aa  160  3e-38  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.808673  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1179  Hydroxymethylglutaryl-coenzyme A synthase domain protein  27.3 
 
 		 407 aa  155  1e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1212  polyketide biosynthesis protein, interruption-N  29.13 
 
 		 389 aa  154  2e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.737994  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1739  Hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  30.96 
 
 		 447 aa  153  4e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2310  Hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  30.71 
 
 		 445 aa  153  5e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2613  putative hydroxymethylglutaryl-coenzyme A synthase  29.22 
 
 		 419 aa  149  7e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.457692  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1470  putative polyketide biosynthesis protein pksG  29.22 
 
 		 419 aa  149  7e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0349844  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1384  putative polyketide biosynthesis protein pksG  29.22 
 
 		 419 aa  149  7e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1418  Hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  29.33 
 
 		 420 aa  149  7e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2766  Hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  29.09 
 
 		 444 aa  148  1.0000000000000001e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0703  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  31.42 
 
 		 407 aa  148  1.0000000000000001e-34  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2595  Hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  28.07 
 
 		 413 aa  149  1.0000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2313  Hydroxymethylglutaryl-coenzyme A synthase domain protein  28.4 
 
 		 447 aa  144  4e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.859835  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0401  Hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  29.98 
 
 		 445 aa  141  1.9999999999999998e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2601  Hydroxymethylglutaryl-coenzyme A synthase domain protein  28.49 
 
 		 424 aa  137  4e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0233973  normal  0.914531 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0828  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  28.25 
 
 		 464 aa  135  9.999999999999999e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0208074 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_83020  predicted protein  27.27 
 
 		 447 aa  109  1e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.203181 
 
 
-
 
NC_006685  CNC05080  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase, putative  25.56 
 
 		 498 aa  106  6e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0146937  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04923  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase, expressed (Eurofung)  25.61 
 
 		 459 aa  101  2e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000140052  normal  0.183137 
 
 
-
 
NC_006692  CNG02670  conserved hypothetical protein  24.13 
 
 		 492 aa  94.4  3e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.250048  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1607  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  25.91 
 
 		 350 aa  92  2e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0020  hypothetical protein  23.32 
 
 		 348 aa  80.9  0.00000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0526  hypothetical protein  24.71 
 
 		 349 aa  80.9  0.00000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2361  hypothetical protein  24.53 
 
 		 350 aa  80.5  0.00000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0551  hypothetical protein  24.61 
 
 		 349 aa  80.1  0.00000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0379  hypothetical protein  25.59 
 
 		 349 aa  78.2  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1461  hypothetical protein  25.59 
 
 		 349 aa  78.2  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1142  hypothetical protein  23.65 
 
 		 349 aa  77  0.0000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.448183  hitchhiker  0.000356194 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0458  hypothetical protein  25.29 
 
 		 349 aa  76.6  0.0000000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.288502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1627  hypothetical protein  23.53 
 
 		 347 aa  76.3  0.0000000000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1932  hypothetical protein  23.25 
 
 		 349 aa  72.4  0.00000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0292488  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2510  hypothetical protein  23.74 
 
 		 350 aa  71.6  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.507027  normal  0.708898 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1646  hypothetical protein  23.96 
 
 		 348 aa  69.3  0.0000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0338  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  23.77 
 
 		 347 aa  67  0.0000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.468823  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0157  hypothetical protein  23.27 
 
 		 350 aa  66.6  0.0000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_16649  predicted protein  26.64 
 
 		 461 aa  61.6  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.24052  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1082  hypothetical protein  22.02 
 
 		 350 aa  58.9  0.0000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1390  hypothetical protein  22.64 
 
 		 345 aa  58.5  0.0000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0811  hypothetical protein  22.81 
 
 		 350 aa  58.2  0.0000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.836821  hitchhiker  0.000111453 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0793  hypothetical protein  22.78 
 
 		 349 aa  54.3  0.000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0764  hypothetical protein  21.29 
 
 		 346 aa  54.3  0.000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.128662  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0151  hypothetical protein  23.73 
 
 		 350 aa  53.9  0.000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1356  hypothetical protein  24.14 
 
 		 351 aa  53.5  0.000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.711945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3869  hypothetical protein  21.8 
 
 		 348 aa  52.8  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1240  hypothetical protein  22.04 
 
 		 349 aa  52  0.00002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0625222  hitchhiker  0.00968227 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1292  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  27.88 
 
 		 317 aa  50.8  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000523087  hitchhiker  2.7964e-16 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2176  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  27.88 
 
 		 317 aa  50.8  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00253287  hitchhiker  0.000000000000149939 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1993  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  27.88 
 
 		 317 aa  50.8  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000302649  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1263  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  27.88 
 
 		 317 aa  50.8  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00141014  normal  0.134616 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1307  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  27.88 
 
 		 317 aa  50.8  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0184872  hitchhiker  0.000000000000113023 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3240  hypothetical protein  25 
 
 		 485 aa  48.9  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.57921  normal  0.496079 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3069  hypothetical protein  26.15 
 
 		 502 aa  48.9  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01087  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase  28.78 
 
 		 317 aa  47  0.0005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000578388  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01095  hypothetical protein  28.78 
 
 		 317 aa  47  0.0005  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000485703  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1213  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  28.78 
 
 		 317 aa  47  0.0005  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  2.16382e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2510  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  28.78 
 
 		 317 aa  47  0.0005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000101658  hitchhiker  0.0000844737 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3650  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  30.08 
 
 		 325 aa  46.6  0.0007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1212  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  28.78 
 
 		 317 aa  46.2  0.0008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000153107  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2556  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  28.78 
 
 		 317 aa  46.2  0.0008  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000231699  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1470  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  28.78 
 
 		 317 aa  46.2  0.0008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000946289  hitchhiker  0.00000000000127697 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2233  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  28.78 
 
 		 317 aa  46.2  0.0008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.00000000000000918964  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2036  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  28.78 
 
 		 317 aa  46.2  0.0008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000955089  decreased coverage  0.000000634537 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1609  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  27.34 
 
 		 316 aa  45.1  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000100532  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002994  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase KASIII  27.21 
 
 		 316 aa  44.3  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000798745  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0005  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  28.45 
 
 		 335 aa  44.3  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1606  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  32.41 
 
 		 317 aa  43.9  0.005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000000532359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1823  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  25.71 
 
 		 332 aa  43.5  0.006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0148812  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3501  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  29.63 
 
 		 316 aa  43.1  0.008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000246754  decreased coverage  0.00135682 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2037  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  25.32 
 
 		 332 aa  43.1  0.008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1684  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  29.63 
 
 		 316 aa  43.1  0.008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000249118  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0748  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  25.32 
 
 		 332 aa  43.1  0.008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1576  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  29.63 
 
 		 316 aa  43.1  0.008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  3.70406e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1550  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  22.52 
 
 		 913 aa  42.7  0.01  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>