80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_0621 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008532  STER_0621  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase (HMG-CoA synthase)  100 
 
 		 391 aa  809    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000102903  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1316  HMG-CoA synthase  69.74 
 
 		 390 aa  563  1.0000000000000001e-159  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.717019  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1291  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  50.39 
 
 		 383 aa  391  1e-107  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1666  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  50.9 
 
 		 384 aa  372  1e-102  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.696762  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2122  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  50 
 
 		 388 aa  355  6.999999999999999e-97  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0676  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  47.8 
 
 		 385 aa  338  7e-92  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000283469  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2569  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  50.83 
 
 		 388 aa  332  8e-90  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2622  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  50.83 
 
 		 388 aa  332  8e-90  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0359  putative hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  44.69 
 
 		 437 aa  320  3e-86  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1184  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  46.88 
 
 		 385 aa  312  4.999999999999999e-84  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.298537  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1719  hydroxymethylglutaryl-coenzyme A synthase  43.41 
 
 		 389 aa  310  4e-83  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.396765  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1372  3-hydroxy-3-methylglutaryl CoA synthase  45.45 
 
 		 387 aa  288  1e-76  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.998569  hitchhiker  0.00000000102593 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0968  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  41.84 
 
 		 389 aa  284  2.0000000000000002e-75  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.032504  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8252  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  40.66 
 
 		 396 aa  281  2e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.112958  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2518  putative hydroxymethylglutaryl-coenzyme A synthase  34.69 
 
 		 412 aa  181  1e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2608  hydroxymethylglutaryl-coenzyme A synthase  34.69 
 
 		 412 aa  181  1e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2969  putative hydroxymethylglutaryl-coenzyme A synthase  34.18 
 
 		 397 aa  171  2e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.763389  hitchhiker  0.0000211937 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0678  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  29.38 
 
 		 453 aa  170  3e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0215835  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2884  Hydroxymethylglutaryl-coenzyme A synthase domain protein  32.09 
 
 		 419 aa  167  4e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.614903 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2310  Hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  32.52 
 
 		 445 aa  162  8.000000000000001e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1739  Hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  33.09 
 
 		 447 aa  161  2e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1212  polyketide biosynthesis protein, interruption-N  30.55 
 
 		 389 aa  159  8e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.737994  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2613  putative hydroxymethylglutaryl-coenzyme A synthase  29.76 
 
 		 419 aa  158  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.457692  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5295  Hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  30.5 
 
 		 417 aa  158  2e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0778158  normal  0.248767 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1470  putative polyketide biosynthesis protein pksG  30.93 
 
 		 419 aa  157  2e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0349844  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1384  putative polyketide biosynthesis protein pksG  30.93 
 
 		 419 aa  157  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1670  polyketide biosynthesis protein  30.43 
 
 		 418 aa  155  8e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.130518  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4396  Hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  33.54 
 
 		 369 aa  154  2e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0133862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2595  Hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  32.7 
 
 		 413 aa  154  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0828  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  31.47 
 
 		 464 aa  154  2.9999999999999998e-36  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0208074 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1179  Hydroxymethylglutaryl-coenzyme A synthase domain protein  28.27 
 
 		 407 aa  151  2e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0401  Hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  31.87 
 
 		 445 aa  150  4e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2313  Hydroxymethylglutaryl-coenzyme A synthase domain protein  29.06 
 
 		 447 aa  149  7e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.859835  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1418  Hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  31.15 
 
 		 420 aa  149  8e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2766  Hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  28.99 
 
 		 444 aa  147  4.0000000000000006e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1931  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase family protein  31.55 
 
 		 412 aa  146  6e-34  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.808673  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2601  Hydroxymethylglutaryl-coenzyme A synthase domain protein  32.43 
 
 		 424 aa  140  3.9999999999999997e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0233973  normal  0.914531 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0703  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  29.91 
 
 		 407 aa  124  3e-27  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04923  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase, expressed (Eurofung)  25.44 
 
 		 459 aa  95.5  1e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000140052  normal  0.183137 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1932  hypothetical protein  25.15 
 
 		 349 aa  88.2  2e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0292488  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0551  hypothetical protein  25.91 
 
 		 349 aa  86.3  9e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0020  hypothetical protein  24.05 
 
 		 348 aa  85.5  0.000000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1607  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  27.05 
 
 		 350 aa  84  0.000000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0526  hypothetical protein  26.42 
 
 		 349 aa  81.6  0.00000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1142  hypothetical protein  26.94 
 
 		 349 aa  81.3  0.00000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.448183  hitchhiker  0.000356194 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_83020  predicted protein  24.8 
 
 		 447 aa  80.5  0.00000000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.203181 
 
 
-
 
NC_006685  CNC05080  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase, putative  24.26 
 
 		 498 aa  78.6  0.0000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0146937  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2510  hypothetical protein  27.38 
 
 		 350 aa  78.2  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.507027  normal  0.708898 
 
 
-
 
NC_006692  CNG02670  conserved hypothetical protein  22.55 
 
 		 492 aa  78.2  0.0000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.250048  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2361  hypothetical protein  24.92 
 
 		 350 aa  77.4  0.0000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0793  hypothetical protein  26.71 
 
 		 349 aa  76.3  0.0000000000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1082  hypothetical protein  24.86 
 
 		 350 aa  75.5  0.000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0811  hypothetical protein  24.31 
 
 		 350 aa  75.1  0.000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.836821  hitchhiker  0.000111453 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1646  hypothetical protein  25.43 
 
 		 348 aa  74.3  0.000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_16649  predicted protein  25.63 
 
 		 461 aa  72  0.00000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.24052  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0338  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  25.55 
 
 		 347 aa  71.2  0.00000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.468823  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1356  hypothetical protein  24.73 
 
 		 351 aa  70.1  0.00000000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.711945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0379  hypothetical protein  23.58 
 
 		 349 aa  69.7  0.00000000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0157  hypothetical protein  25.39 
 
 		 350 aa  68.9  0.0000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0458  hypothetical protein  22.49 
 
 		 349 aa  68.9  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.288502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1461  hypothetical protein  23.58 
 
 		 349 aa  68.6  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1390  hypothetical protein  24.86 
 
 		 345 aa  65.9  0.000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1627  hypothetical protein  24.61 
 
 		 347 aa  65.1  0.000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1240  hypothetical protein  25 
 
 		 349 aa  61.6  0.00000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0625222  hitchhiker  0.00968227 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0430  hypothetical protein  25.16 
 
 		 348 aa  58.2  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.637557  normal  0.081806 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0151  hypothetical protein  23.1 
 
 		 350 aa  56.6  0.0000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0982  hypothetical protein  24.32 
 
 		 348 aa  51.6  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3869  hypothetical protein  24.04 
 
 		 348 aa  50.8  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002994  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase KASIII  34.26 
 
 		 316 aa  48.9  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000798745  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2239  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  32.41 
 
 		 317 aa  47.8  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000795975  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0764  hypothetical protein  26.28 
 
 		 346 aa  47.8  0.0003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.128662  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1609  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  35.19 
 
 		 316 aa  47.4  0.0005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000100532  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1684  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  30.83 
 
 		 316 aa  47  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000249118  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1576  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  30.83 
 
 		 316 aa  47  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  3.70406e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3501  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  30.83 
 
 		 316 aa  47  0.0006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000246754  decreased coverage  0.00135682 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4809  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  26.88 
 
 		 315 aa  45.4  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0509629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1550  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.53 
 
 		 913 aa  43.9  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1087  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  24.91 
 
 		 319 aa  42.7  0.01  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.467035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02910  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  31.48 
 
 		 316 aa  42.7  0.01  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1497  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  30.77 
 
 		 319 aa  42.7  0.01  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000000406338  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>