67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_1179 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_1179  Hydroxymethylglutaryl-coenzyme A synthase domain protein  100 
 
 		 407 aa  822    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2518  putative hydroxymethylglutaryl-coenzyme A synthase  37.62 
 
 		 412 aa  288  2e-76  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2608  hydroxymethylglutaryl-coenzyme A synthase  37.62 
 
 		 412 aa  288  2e-76  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2969  putative hydroxymethylglutaryl-coenzyme A synthase  37.5 
 
 		 397 aa  277  2e-73  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.763389  hitchhiker  0.0000211937 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2595  Hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  36.99 
 
 		 413 aa  243  3.9999999999999997e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2884  Hydroxymethylglutaryl-coenzyme A synthase domain protein  32.54 
 
 		 419 aa  236  4e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.614903 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1931  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase family protein  33.5 
 
 		 412 aa  234  1.0000000000000001e-60  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.808673  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5295  Hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  32.3 
 
 		 417 aa  228  1e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0778158  normal  0.248767 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1384  putative polyketide biosynthesis protein pksG  34.75 
 
 		 419 aa  227  2e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2613  putative hydroxymethylglutaryl-coenzyme A synthase  34.75 
 
 		 419 aa  228  2e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.457692  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1470  putative polyketide biosynthesis protein pksG  34.75 
 
 		 419 aa  227  2e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0349844  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1670  polyketide biosynthesis protein  34.43 
 
 		 418 aa  228  2e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.130518  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1212  polyketide biosynthesis protein, interruption-N  35.53 
 
 		 389 aa  219  6e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.737994  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1418  Hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  31.99 
 
 		 420 aa  211  2e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1719  hydroxymethylglutaryl-coenzyme A synthase  33.58 
 
 		 389 aa  206  6e-52  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.396765  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2601  Hydroxymethylglutaryl-coenzyme A synthase domain protein  33.17 
 
 		 424 aa  196  6e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0233973  normal  0.914531 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1184  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  30.08 
 
 		 385 aa  159  8e-38  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.298537  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8252  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  29.85 
 
 		 396 aa  158  2e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.112958  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1291  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  27.3 
 
 		 383 aa  155  1e-36  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0676  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  28.33 
 
 		 385 aa  152  8.999999999999999e-36  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000283469  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2622  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  29.88 
 
 		 388 aa  151  2e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2569  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  29.88 
 
 		 388 aa  151  2e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2122  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  29.05 
 
 		 388 aa  149  7e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1316  HMG-CoA synthase  27.02 
 
 		 390 aa  144  2e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.717019  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1372  3-hydroxy-3-methylglutaryl CoA synthase  30.92 
 
 		 387 aa  142  9e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.998569  hitchhiker  0.00000000102593 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0359  putative hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  29.27 
 
 		 437 aa  142  9.999999999999999e-33  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0621  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase (HMG-CoA synthase)  28.27 
 
 		 391 aa  136  7.000000000000001e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000102903  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2313  Hydroxymethylglutaryl-coenzyme A synthase domain protein  27.62 
 
 		 447 aa  133  6e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.859835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1666  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  28.97 
 
 		 384 aa  132  7.999999999999999e-30  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.696762  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2310  Hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  27.02 
 
 		 445 aa  132  1.0000000000000001e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4396  Hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  33.88 
 
 		 369 aa  130  3e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0133862  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0968  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  25.31 
 
 		 389 aa  129  1.0000000000000001e-28  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.032504  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0401  Hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  26.1 
 
 		 445 aa  124  2e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2766  Hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  27.63 
 
 		 444 aa  124  3e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1739  Hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  27.68 
 
 		 447 aa  122  9e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0678  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  24.28 
 
 		 453 aa  107  4e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0215835  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04923  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase, expressed (Eurofung)  24.08 
 
 		 459 aa  97.1  5e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000140052  normal  0.183137 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0703  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  24.79 
 
 		 407 aa  93.6  5e-18  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0828  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  24.61 
 
 		 464 aa  89.4  9e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0208074 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_83020  predicted protein  24.73 
 
 		 447 aa  85.1  0.000000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.203181 
 
 
-
 
NC_006692  CNG02670  conserved hypothetical protein  21.58 
 
 		 492 aa  77  0.0000000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.250048  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0811  hypothetical protein  25 
 
 		 350 aa  63.9  0.000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.836821  hitchhiker  0.000111453 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0551  hypothetical protein  23.23 
 
 		 349 aa  60.5  0.00000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1240  hypothetical protein  23.53 
 
 		 349 aa  59.7  0.0000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0625222  hitchhiker  0.00968227 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1082  hypothetical protein  23.38 
 
 		 350 aa  57  0.0000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1932  hypothetical protein  24.11 
 
 		 349 aa  56.2  0.0000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0292488  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1356  hypothetical protein  23.85 
 
 		 351 aa  55.8  0.000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.711945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2361  hypothetical protein  23.28 
 
 		 350 aa  55.1  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC05080  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase, putative  25.33 
 
 		 498 aa  54.7  0.000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0146937  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3869  hypothetical protein  24.92 
 
 		 348 aa  54.7  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0764  hypothetical protein  23.64 
 
 		 346 aa  53.9  0.000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.128662  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0020  hypothetical protein  21.3 
 
 		 348 aa  53.5  0.000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1607  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  22.63 
 
 		 350 aa  52.8  0.00001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1142  hypothetical protein  24.47 
 
 		 349 aa  52  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.448183  hitchhiker  0.000356194 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0793  hypothetical protein  22.91 
 
 		 349 aa  50.8  0.00004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_16649  predicted protein  24.65 
 
 		 461 aa  50.1  0.00007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.24052  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1627  hypothetical protein  22.37 
 
 		 347 aa  49.7  0.0001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0379  hypothetical protein  28.57 
 
 		 349 aa  49.3  0.0001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1461  hypothetical protein  28.57 
 
 		 349 aa  48.9  0.0001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0458  hypothetical protein  28.57 
 
 		 349 aa  48.9  0.0002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.288502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2917  hypothetical protein  31.96 
 
 		 495 aa  48.9  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.381583  normal  0.0360554 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2510  hypothetical protein  21.99 
 
 		 350 aa  47.4  0.0004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.507027  normal  0.708898 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17460  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  30.19 
 
 		 343 aa  46.2  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.352579  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0157  hypothetical protein  20.9 
 
 		 350 aa  45.8  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1823  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  33.33 
 
 		 332 aa  46.2  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0148812  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1646  hypothetical protein  26.77 
 
 		 348 aa  44.3  0.004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0338  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  22.55 
 
 		 347 aa  43.5  0.006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.468823  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>