64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2917 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_2917  hypothetical protein  100 
 
 
495 aa  1004    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.381583  normal  0.0360554 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3069  hypothetical protein  63.58 
 
 
502 aa  652    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3240  hypothetical protein  52.08 
 
 
485 aa  453  1.0000000000000001e-126  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.57921  normal  0.496079 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1550  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.4 
 
 
913 aa  436  1e-121  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1856  3-oxoacyl-(ACP) synthase III  42.29 
 
 
484 aa  337  2.9999999999999997e-91  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0653145  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2055  protein of unknown function DUF35  33.54 
 
 
474 aa  191  2e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0203372  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5351  protein of unknown function DUF35  31.26 
 
 
490 aa  140  4.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.648727 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1240  hypothetical protein  27.27 
 
 
349 aa  104  3e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0625222  hitchhiker  0.00968227 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0157  hypothetical protein  29.62 
 
 
350 aa  102  2e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0811  hypothetical protein  28.3 
 
 
350 aa  101  4e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.836821  hitchhiker  0.000111453 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2714  protein of unknown function DUF35  31.04 
 
 
465 aa  99.8  9e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00764236  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3869  hypothetical protein  29.15 
 
 
348 aa  99.8  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1627  hypothetical protein  29.61 
 
 
347 aa  99.4  1e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1082  hypothetical protein  27.65 
 
 
350 aa  97.8  3e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2510  hypothetical protein  28.12 
 
 
350 aa  96.7  8e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.507027  normal  0.708898 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1646  hypothetical protein  29.08 
 
 
348 aa  95.9  1e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2361  hypothetical protein  29.32 
 
 
350 aa  94.7  3e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1142  hypothetical protein  28.41 
 
 
349 aa  94.4  4e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.448183  hitchhiker  0.000356194 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0793  hypothetical protein  27.33 
 
 
349 aa  92  2e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1607  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  27.6 
 
 
350 aa  91.3  4e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1932  hypothetical protein  27.59 
 
 
349 aa  88.6  2e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0292488  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1390  hypothetical protein  28.9 
 
 
345 aa  87.4  5e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0430  hypothetical protein  28.12 
 
 
348 aa  87.4  5e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.637557  normal  0.081806 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1356  hypothetical protein  28.77 
 
 
351 aa  87.4  6e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.711945  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0982  hypothetical protein  28.57 
 
 
348 aa  87  7e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0338  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  25.07 
 
 
347 aa  85.9  0.000000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.468823  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0764  hypothetical protein  27.07 
 
 
346 aa  85.5  0.000000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.128662  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0526  hypothetical protein  27.51 
 
 
349 aa  81.3  0.00000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0551  hypothetical protein  27.94 
 
 
349 aa  80.9  0.00000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0151  hypothetical protein  26.82 
 
 
350 aa  77.8  0.0000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0020  hypothetical protein  25.64 
 
 
348 aa  77  0.0000000000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4021  protein of unknown function DUF35  25.35 
 
 
481 aa  76.3  0.000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.605764  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1461  hypothetical protein  26.65 
 
 
349 aa  72.8  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0379  hypothetical protein  26.99 
 
 
349 aa  70.1  0.00000000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0458  hypothetical protein  26.65 
 
 
349 aa  69.7  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.288502  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0597  protein of unknown function DUF35  27.13 
 
 
490 aa  68.9  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4422  protein of unknown function DUF35  29.25 
 
 
474 aa  60.5  0.00000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.00766931  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1154  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  26.73 
 
 
328 aa  56.2  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000934298  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1583  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  25.4 
 
 
319 aa  55.1  0.000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0414109  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0096  3-oxoacyl-(acyl-carrier protein) synthase  26.27 
 
 
354 aa  54.7  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.795043 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0023  hypothetical protein  29.37 
 
 
130 aa  53.1  0.00001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0460  hypothetical protein  30.95 
 
 
130 aa  52  0.00003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0490887  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4194  protein of unknown function DUF35  27.88 
 
 
473 aa  50.4  0.00007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.492043  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1459  hypothetical protein  29.37 
 
 
130 aa  49.3  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2490  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  26.58 
 
 
327 aa  48.5  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.201927 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1136  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  24.05 
 
 
324 aa  48.5  0.0003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.896107  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1179  Hydroxymethylglutaryl-coenzyme A synthase domain protein  31.96 
 
 
407 aa  48.5  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3017  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  25 
 
 
348 aa  48.1  0.0004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2923  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  26.89 
 
 
325 aa  47.8  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.437795  hitchhiker  0.000795877 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1925  protein of unknown function DUF35  33.82 
 
 
474 aa  47.4  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0340  protein of unknown function DUF35  26.56 
 
 
134 aa  47.8  0.0005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.0000262786  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0377  hypothetical protein  28.57 
 
 
130 aa  47.4  0.0006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.253705  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1324  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  24.45 
 
 
324 aa  47  0.0008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.760998  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10280  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  28.11 
 
 
328 aa  46.2  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.057414 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0602  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  24.44 
 
 
319 aa  46.2  0.001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000174189  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3017  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  23.42 
 
 
335 aa  45.1  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1625  hypothetical protein  33.05 
 
 
130 aa  45.1  0.003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0766  hypothetical protein  25.19 
 
 
135 aa  45.1  0.003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.48862  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1601  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  27.54 
 
 
325 aa  45.1  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.995232  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002735  3-oxoacyl-synthase III  23.92 
 
 
329 aa  44.3  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0103393  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0812  hypothetical protein  29.03 
 
 
134 aa  44.3  0.005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.553396  hitchhiker  0.000113363 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1719  hydroxymethylglutaryl-coenzyme A synthase  24.77 
 
 
389 aa  44.3  0.005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.396765  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0968  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  26.42 
 
 
389 aa  44.3  0.006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.032504  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1599  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase III  27.21 
 
 
326 aa  43.5  0.008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.262189  normal  0.437355 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>