52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5351 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_5351  protein of unknown function DUF35  100 
 
 		 490 aa  957    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.648727 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2055  protein of unknown function DUF35  47.23 
 
 		 474 aa  342  9e-93  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0203372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3240  hypothetical protein  32.93 
 
 		 485 aa  205  1e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.57921  normal  0.496079 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2917  hypothetical protein  30.78 
 
 		 495 aa  202  1.9999999999999998e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.381583  normal  0.0360554 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3069  hypothetical protein  28.83 
 
 		 502 aa  187  3e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1550  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.83 
 
 		 913 aa  185  2.0000000000000003e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2714  protein of unknown function DUF35  38.67 
 
 		 465 aa  180  4.999999999999999e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00764236  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1856  3-oxoacyl-(ACP) synthase III  31.52 
 
 		 484 aa  162  2e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0653145  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1607  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  27.45 
 
 		 350 aa  91.7  2e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1142  hypothetical protein  28.12 
 
 		 349 aa  77.4  0.0000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.448183  hitchhiker  0.000356194 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4422  protein of unknown function DUF35  27.01 
 
 		 474 aa  77.4  0.0000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.00766931  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1240  hypothetical protein  25.84 
 
 		 349 aa  77.4  0.0000000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0625222  hitchhiker  0.00968227 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1646  hypothetical protein  28.03 
 
 		 348 aa  77  0.0000000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3869  hypothetical protein  27.56 
 
 		 348 aa  75.1  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0764  hypothetical protein  25.5 
 
 		 346 aa  75.1  0.000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.128662  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1082  hypothetical protein  24.09 
 
 		 350 aa  72.4  0.00000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0982  hypothetical protein  28.05 
 
 		 348 aa  69.7  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1932  hypothetical protein  24.08 
 
 		 349 aa  66.2  0.000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0292488  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0430  hypothetical protein  27.76 
 
 		 348 aa  66.2  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.637557  normal  0.081806 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0338  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  24.44 
 
 		 347 aa  65.5  0.000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.468823  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0811  hypothetical protein  23.25 
 
 		 350 aa  65.5  0.000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.836821  hitchhiker  0.000111453 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0551  hypothetical protein  25.42 
 
 		 349 aa  64.3  0.000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1390  hypothetical protein  25.49 
 
 		 345 aa  63.9  0.000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2510  hypothetical protein  25.14 
 
 		 350 aa  62.8  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.507027  normal  0.708898 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0793  hypothetical protein  24.02 
 
 		 349 aa  62.4  0.00000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4194  protein of unknown function DUF35  26.59 
 
 		 473 aa  59.7  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.492043  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4021  protein of unknown function DUF35  25.44 
 
 		 481 aa  58.9  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.605764  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0020  hypothetical protein  22.88 
 
 		 348 aa  58.5  0.0000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0157  hypothetical protein  23.31 
 
 		 350 aa  57.4  0.0000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2361  hypothetical protein  25 
 
 		 350 aa  57  0.0000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1627  hypothetical protein  25.46 
 
 		 347 aa  57  0.0000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1356  hypothetical protein  23.48 
 
 		 351 aa  51.2  0.00004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.711945  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1719  hydroxymethylglutaryl-coenzyme A synthase  24.24 
 
 		 389 aa  51.2  0.00004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.396765  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2788  hypothetical protein  38.24 
 
 		 132 aa  50.1  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.159844  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0766  hypothetical protein  43.04 
 
 		 135 aa  48.9  0.0002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.48862  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0428  hypothetical protein  31.4 
 
 		 131 aa  48.9  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0261769  normal  0.146814 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0597  protein of unknown function DUF35  25 
 
 		 490 aa  48.5  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1925  protein of unknown function DUF35  25.48 
 
 		 474 aa  47.8  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2363  hypothetical protein  41.79 
 
 		 130 aa  47.4  0.0006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0526  hypothetical protein  22.22 
 
 		 349 aa  47  0.0008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0458  hypothetical protein  23.36 
 
 		 349 aa  46.6  0.0009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.288502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1461  hypothetical protein  23.08 
 
 		 349 aa  46.2  0.001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0379  hypothetical protein  23.08 
 
 		 349 aa  46.2  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3948  Beta-ketoacyl-acyl-carrier-protein synthase I  24.31 
 
 		 314 aa  45.8  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.877471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0023  hypothetical protein  25.98 
 
 		 130 aa  45.8  0.002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0794  hypothetical protein  30.25 
 
 		 133 aa  45.8  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1184  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  22.85 
 
 		 385 aa  45.4  0.002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.298537  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0151  hypothetical protein  23.4 
 
 		 350 aa  45.8  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0155  hypothetical protein  30.51 
 
 		 130 aa  44.7  0.004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1145  protein of unknown function DUF35  30 
 
 		 133 aa  43.9  0.007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0574924  hitchhiker  0.0000746026 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0984  hypothetical protein  28.1 
 
 		 132 aa  43.5  0.009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1316  HMG-CoA synthase  26.14 
 
 		 390 aa  43.5  0.009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.717019  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>