48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_2714 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_2714  protein of unknown function DUF35  100 
 
 
465 aa  905    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00764236  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2055  protein of unknown function DUF35  39.12 
 
 
474 aa  216  8e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0203372  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5351  protein of unknown function DUF35  38.22 
 
 
490 aa  174  1.9999999999999998e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.648727 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2917  hypothetical protein  32.38 
 
 
495 aa  145  2e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.381583  normal  0.0360554 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3069  hypothetical protein  30.43 
 
 
502 aa  144  4e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3240  hypothetical protein  31.91 
 
 
485 aa  134  5e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.57921  normal  0.496079 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1856  3-oxoacyl-(ACP) synthase III  30.52 
 
 
484 aa  120  3.9999999999999996e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0653145  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1550  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.96 
 
 
913 aa  114  4.0000000000000004e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4021  protein of unknown function DUF35  29.2 
 
 
481 aa  94.7  3e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.605764  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0764  hypothetical protein  29.39 
 
 
346 aa  85.5  0.000000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.128662  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1142  hypothetical protein  30.52 
 
 
349 aa  82.8  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.448183  hitchhiker  0.000356194 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1925  protein of unknown function DUF35  28.26 
 
 
474 aa  80.5  0.00000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0982  hypothetical protein  31.1 
 
 
348 aa  79.3  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0430  hypothetical protein  30.81 
 
 
348 aa  79.3  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.637557  normal  0.081806 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4194  protein of unknown function DUF35  28.11 
 
 
473 aa  78.6  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.492043  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0338  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  27.78 
 
 
347 aa  77  0.0000000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.468823  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0597  protein of unknown function DUF35  27.73 
 
 
490 aa  75.9  0.000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1390  hypothetical protein  27.4 
 
 
345 aa  72.4  0.00000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3869  hypothetical protein  28.99 
 
 
348 aa  72  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2361  hypothetical protein  27.9 
 
 
350 aa  71.6  0.00000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0020  hypothetical protein  25.64 
 
 
348 aa  70.9  0.00000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0551  hypothetical protein  28.53 
 
 
349 aa  69.3  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1646  hypothetical protein  28.21 
 
 
348 aa  69.7  0.0000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1240  hypothetical protein  28.12 
 
 
349 aa  68.9  0.0000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0625222  hitchhiker  0.00968227 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1461  hypothetical protein  25.7 
 
 
349 aa  66.6  0.0000000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0379  hypothetical protein  25.42 
 
 
349 aa  66.2  0.000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0526  hypothetical protein  25.76 
 
 
349 aa  65.1  0.000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0458  hypothetical protein  25.7 
 
 
349 aa  64.7  0.000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.288502  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4422  protein of unknown function DUF35  28.19 
 
 
474 aa  65.1  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.00766931  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1627  hypothetical protein  28.32 
 
 
347 aa  63.9  0.000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1082  hypothetical protein  27.64 
 
 
350 aa  62.4  0.00000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2510  hypothetical protein  28.53 
 
 
350 aa  60.8  0.00000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.507027  normal  0.708898 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0811  hypothetical protein  25.9 
 
 
350 aa  60.1  0.00000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.836821  hitchhiker  0.000111453 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0157  hypothetical protein  28.81 
 
 
350 aa  60.1  0.00000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0793  hypothetical protein  28.69 
 
 
349 aa  59.7  0.0000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1932  hypothetical protein  25.57 
 
 
349 aa  56.6  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0292488  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1356  hypothetical protein  27.35 
 
 
351 aa  56.2  0.000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.711945  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4017  hypothetical protein  33.86 
 
 
155 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.188869  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8196  hypothetical protein  27.64 
 
 
319 aa  46.2  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2483  hypothetical protein  30.53 
 
 
548 aa  46.2  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.207424 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8252  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  26.62 
 
 
396 aa  45.4  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.112958  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0766  hypothetical protein  32.35 
 
 
135 aa  45.1  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.48862  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0340  protein of unknown function DUF35  24.35 
 
 
134 aa  45.4  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.0000262786  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0023  hypothetical protein  27.13 
 
 
130 aa  44.7  0.003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4171  hypothetical protein  28.97 
 
 
548 aa  45.1  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1392  hypothetical protein  32.77 
 
 
152 aa  45.1  0.003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1903  hypothetical protein  29.47 
 
 
132 aa  44.7  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.539737  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1357  hypothetical protein  28.68 
 
 
132 aa  43.9  0.006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>