58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3240 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_3240  hypothetical protein  100 
 
 		 485 aa  971    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.57921  normal  0.496079 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2917  hypothetical protein  52.08 
 
 		 495 aa  453  1.0000000000000001e-126  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.381583  normal  0.0360554 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3069  hypothetical protein  47.2 
 
 		 502 aa  443  1e-123  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1550  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.82 
 
 		 913 aa  419  1e-116  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1856  3-oxoacyl-(ACP) synthase III  43.07 
 
 		 484 aa  337  1.9999999999999998e-91  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0653145  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2055  protein of unknown function DUF35  35.14 
 
 		 474 aa  186  8e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0203372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5351  protein of unknown function DUF35  32.52 
 
 		 490 aa  143  6e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.648727 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2510  hypothetical protein  29.79 
 
 		 350 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.507027  normal  0.708898 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1240  hypothetical protein  28.53 
 
 		 349 aa  113  1.0000000000000001e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0625222  hitchhiker  0.00968227 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1390  hypothetical protein  29.71 
 
 		 345 aa  110  6e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0811  hypothetical protein  27.73 
 
 		 350 aa  108  3e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.836821  hitchhiker  0.000111453 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1932  hypothetical protein  28.71 
 
 		 349 aa  107  6e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0292488  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1082  hypothetical protein  27.52 
 
 		 350 aa  104  3e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2361  hypothetical protein  29.41 
 
 		 350 aa  102  1e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0793  hypothetical protein  27.81 
 
 		 349 aa  102  1e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0157  hypothetical protein  28.99 
 
 		 350 aa  102  2e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0551  hypothetical protein  28.53 
 
 		 349 aa  101  3e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2714  protein of unknown function DUF35  32.37 
 
 		 465 aa  98.2  3e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00764236  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1646  hypothetical protein  27.22 
 
 		 348 aa  97.4  4e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1607  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  25.57 
 
 		 350 aa  95.5  2e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1142  hypothetical protein  27.87 
 
 		 349 aa  94.7  4e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.448183  hitchhiker  0.000356194 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0338  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  26.38 
 
 		 347 aa  92.4  2e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.468823  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0764  hypothetical protein  26.02 
 
 		 346 aa  91.7  2e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.128662  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1627  hypothetical protein  28.01 
 
 		 347 aa  89.4  1e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0020  hypothetical protein  24.65 
 
 		 348 aa  87  7e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3869  hypothetical protein  27.95 
 
 		 348 aa  86.7  9e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0430  hypothetical protein  27.75 
 
 		 348 aa  85.5  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.637557  normal  0.081806 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1356  hypothetical protein  27.36 
 
 		 351 aa  83.6  0.000000000000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.711945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0982  hypothetical protein  29.3 
 
 		 348 aa  83.6  0.000000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0151  hypothetical protein  26.98 
 
 		 350 aa  83.2  0.00000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0526  hypothetical protein  24.14 
 
 		 349 aa  81.3  0.00000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1461  hypothetical protein  24.44 
 
 		 349 aa  73.6  0.000000000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0379  hypothetical protein  25.14 
 
 		 349 aa  73.2  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0458  hypothetical protein  25.89 
 
 		 349 aa  71.6  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.288502  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4021  protein of unknown function DUF35  26.48 
 
 		 481 aa  63.9  0.000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.605764  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4422  protein of unknown function DUF35  27.54 
 
 		 474 aa  57.8  0.0000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.00766931  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0340  protein of unknown function DUF35  25.78 
 
 		 134 aa  56.6  0.000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.0000262786  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2622  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  25.91 
 
 		 388 aa  56.6  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2569  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  25.91 
 
 		 388 aa  56.6  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0597  protein of unknown function DUF35  26.18 
 
 		 490 aa  55.5  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0377  hypothetical protein  26.19 
 
 		 130 aa  53.5  0.000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.253705  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1459  hypothetical protein  26.19 
 
 		 130 aa  52.8  0.00001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2122  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  24.87 
 
 		 388 aa  52.8  0.00001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0528  hypothetical protein  27.78 
 
 		 129 aa  52.8  0.00001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.825077  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1372  3-hydroxy-3-methylglutaryl CoA synthase  26.46 
 
 		 387 aa  52.8  0.00002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.998569  hitchhiker  0.00000000102593 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4194  protein of unknown function DUF35  27.16 
 
 		 473 aa  51.2  0.00005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.492043  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0460  hypothetical protein  25.4 
 
 		 130 aa  50.8  0.00006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0490887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0968  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  27.27 
 
 		 389 aa  49.3  0.0001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.032504  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1291  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  25 
 
 		 383 aa  48.9  0.0002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2608  hydroxymethylglutaryl-coenzyme A synthase  35.37 
 
 		 412 aa  47.4  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2518  putative hydroxymethylglutaryl-coenzyme A synthase  35.37 
 
 		 412 aa  47.4  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1925  protein of unknown function DUF35  25.06 
 
 		 474 aa  47  0.0007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1669  Beta-ketoacyl-acyl-carrier-protein synthase I  27.91 
 
 		 337 aa  47  0.0009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1184  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  26.32 
 
 		 385 aa  44.7  0.004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.298537  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1666  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  24.48 
 
 		 384 aa  44.7  0.004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.696762  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1648  hypothetical protein  26.15 
 
 		 135 aa  43.9  0.007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1719  hydroxymethylglutaryl-coenzyme A synthase  27.39 
 
 		 389 aa  43.5  0.008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.396765  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1316  HMG-CoA synthase  28.86 
 
 		 390 aa  43.5  0.01  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.717019  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>